| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 1201867 | 66 (0.960) | 4 (0.060) | 3/266 | NT | 5.7% | coding (218/309 nt) | ymfJ | e14 prophage; uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | = 1201905 | 69 (1.050) | coding (180/309 nt) | ymfJ | e14 prophage; uncharacterized protein | |||||
GCAAATATATTTGTCTGTAAATTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGC > NC_000913/1201719‑1202013 | gCAAATATATTTGTCTGTAAATTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCTGCTACCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATATTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACAC > 2:723740‑M1/1‑149 (MQ=255) aaaTATATTTGTCTGTAAATTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACgg < 1:553376/149‑1 (MQ=255) aaaTATATTTGTCTGTAAATTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACgg < 2:605608/149‑1 (MQ=255) atatatTTGTCTGTAAATTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCt > 1:356443/1‑149 (MQ=255) tatatTTGTCTGTAAATTTGAAGAAAGCGCCTGCTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTc < 2:1012626/149‑1 (MQ=255) tatatTTGTCTGTAAATTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTTACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTc < 2:937931/149‑1 (MQ=255) aatTTGTCTCTAAATTTGAACAAAGCGCAAGATTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCAc < 1:1124227/148‑1 (MQ=255) tCTGTAAATTTGCACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTGGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCACATCAAGCTCTATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCACCTtctc < 2:752853/149‑1 (MQ=255) tGTAAATTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCACCTtctctc < 1:782378/149‑1 (MQ=255) gTAAATTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCACCTTCTCTcc < 2:274612/149‑1 (MQ=255) tAAATTTGAACAAAGCGCATTCTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTGGGTAACGATTTCGTTCATAACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCACCTTCTCTCCa < 2:815166/149‑1 (MQ=255) tAAATTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCACCTTCTCTCCa > 2:565751/1‑149 (MQ=255) tAAATTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCACCTTCTCTCCa > 1:931670/1‑149 (MQ=255) tAAATTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCACCTTCTCTCCa > 1:303297/1‑149 (MQ=255) aaaaTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGAAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCACCTTCTCTCCAt < 1:1099474/149‑1 (MQ=255) aaaTTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCACCTTCTCTCCAt < 2:936180/149‑1 (MQ=255) aaTTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTTACGATTTCGTTCATTACCATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTAAAAGACTTAACCATTGTGTCGTTATAAACACGGCTCACCTTCTCAACAtt > 1:56586/1‑149 (MQ=255) tttGAACAAAGCGCATGCTTACTTCAGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGAATCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACTCGGCTGACCTTCACTCCATTGc > 1:1182602/1‑149 (MQ=255) 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tAAACACGGCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGGCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCAtt < 2:949242/149‑1 (MQ=255) aaCACactcacccctctgccatgcaatggagagaaggtgagccgtgtttatcacgacacaatggttaaggctttaagaatcgagcttgatgggcttaggcgtaagatcgtaatgaacgaaatcgttaccaactaaggaagcagacggaa < 2:925119‑M1/149‑145 (MQ=255) acacactcacccctctgccatgcaatggagagaaggtgagccgtgtttatcacgacacaatggttaaggctttaagaatcgagcttgatgggcttaggcgtaagatcgtaatgaacgaaatcgttaccaactaaggaagcagacggaag > 2:463324‑M1/1‑4 (MQ=255) acacGGCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTTTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTgg < 2:303297/149‑1 (MQ=255) acacGGCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTgg < 1:925119/149‑1 (MQ=255) acacGGCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTgg < 1:1127016/149‑1 (MQ=255) acacGGCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTgg < 2:968501/149‑1 (MQ=255) acacGGCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTGAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTgg > 2:367211/1‑149 (MQ=255) acacGGCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGGGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTgg < 2:716464/149‑1 (MQ=255) acacGGCGCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTACTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTgg < 1:950020/149‑1 (MQ=255) cacGGCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTgtgtttatcacgacacaagggttaaggctttaagaatcgagcttgatgggcttaggcgtaagatcttaatgaacgaaatcgttaacaactaaggaagcagacggaagt < 1:884393‑M2/149‑109 (MQ=255) cacGGCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTTTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGc < 1:130249/149‑1 (MQ=255) | GCAAATATATTTGTCTGTAAATTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGC > NC_000913/1201719‑1202013 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |