New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4326878 = | 99 (1.670) | 6 (0.110) | 6/258 | NT | 6.2% | intergenic (‑144/‑257) | yjdM/crfC | zinc‑ribbon family protein/clamp‑binding sister replication fork colocalization protein, dynamin‑related |
? | NC_000913 | 4326902 = | 88 (1.590) | intergenic (‑168/‑233) | yjdM/crfC | zinc‑ribbon family protein/clamp‑binding sister replication fork colocalization protein, dynamin‑related |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GACATGTGGATTTCCTCAAAAGTCAGCAGGGCAAAAGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACA > NC_000913/4326730‑4327026 | gACATGTGGATTTCCTCAAAAGTCAGCAGGGCAAAAGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACg > 2:552051/1‑149 (MQ=255) aCATGTGGATTTCCTCAAAAGTCAGCAGGGCAAAAGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTCATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGc > 1:913824/1‑149 (MQ=255) cATGTGGATTTCCTCAAAAGTCAGCAGGGCAAAAGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAACATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCa > 1:214999/1‑149 (MQ=255) aTGTGGATTTCCTCAAAAGTCAGCAGGGCAAAAGCGCCAAAAAACGGCAGCTTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGATGATTTTAGACGCCGATCGTTTTCATTATAAAGGAAACGCaa > 2:69005/1‑149 (MQ=255) ataattttatatttagtgtgttgttttttatcagaataaataacgtcttctgatacgtttaaaacgtcagaaagataaaaatatcatgtgaattaaaaaaagaacaagtagagcattaacattatcttaaataataaatagagGCaaaa < 2:284935‑M1/6‑1 (MQ=255) tgGATTTCCTCAAAAGTCAGCAGGGCAAAAGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCaaaaa < 1:877999/149‑1 (MQ=255) ggATTTCCTCAAAAGTCAGCAGGGCAAAAGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGATAGGAAACGCaaaaat > 1:115796/1‑148 (MQ=255) gATTTCCGCAAAAGTCAGCAGGGCAAAAGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCGGAAAAAGGCCGCAATTATACTCAAACTCAAGGAGTTTGTCGGGGGTACGGCTGAGATTAGACTACGCTCGTTTTCTTATGAAAGGAACCGCATAAAGa > 2:394014/1‑149 (MQ=255) aTTTCCTCAAAAGTCAGCAGGGCAAAAGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATAAACAAAATCCCGGAGTTTGTCCGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCATAAAGaa < 1:636251/149‑1 (MQ=255) tttCCTCAAAAGTCAGCAGGGCAAAAGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGaaa > 1:947033/1‑149 (MQ=255) tttagtgtgttgttttttttcataataaataacgtcttctgatacggttaaaacgtcagaaagataaaaatatcatgtgaattaaaaaaagaacaagtagagcattaacattatcttaaatattaaatagagGCAAAAAGAAAATAATc > 2:696393‑M1/133‑149 (MQ=255) aaaaGTCAGCAGGGCAAAAGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTGTGTCGGGGGGACTGCTGATGTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAACTAATCt > 1:918051/1‑149 (MQ=255) tCAGCAGGGCAAAAGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTg > 1:334621/1‑149 (MQ=255) ttttgttttttatcagaataaataacgtcttctgatacgtttaaaacgtcagaaagataaaaatatcatgtgaattaaaaaaagaacaagtagagcattaacattatcttaaataataaatagagGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGc > 1:705181‑M1/126‑149 (MQ=255) caccagGGCATAAGAGCCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAAATATACAAAAAATCCCTGAGTTTGTCTGGGGTACTGCTGATATTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGATTATTTTCTTTTTGc < 2:536464/146‑1 (MQ=255) agcagGGCATAAGCGCCAAAAAACGGCAGAATGCCGAAAAACGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGATTATTTTCTTTTTGcg < 1:101954/149‑2 (MQ=255) agcagGGCAAAAGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTgac > 2:31415/1‑147 (MQ=255) ttgttttttatcagaataaataacgtcttctgatacgtttaaaacgtcagaaagataaaaatatcatgtgaattaaaaaaagaacaagtagagcattaacattatcttaaataataaatagagGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCct > 1:365852‑M1/124‑149 (MQ=255) 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cAAAAGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATACCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTATCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCtattt > 2:281908/1‑149 (MQ=255) aaaaGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCTAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCtattta < 1:269677/149‑1 (MQ=255) aaGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCtatttatt > 1:466822/1‑149 (MQ=255) aaaaaaCGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGACTCTATTTATTATTTAAg > 1:501318/1‑149 (MQ=255) aaaaCGGCAGATTGCAGAAAAAGGCCGCAATTATACTCAAAATCACTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTATAGACGACGATAGTTTTAATTTGAAAGTAAACGCAAAAAGAAAAAAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGAt > 1:629766/1‑149 (MQ=255) 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cATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATTATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTATTTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTc > 2:496691/1‑149 (MQ=255) tttGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTg < 1:673285/149‑1 (MQ=255) ttGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACTTATCATAAGACTTTATTTATTCTGa > 2:165443/1‑149 (MQ=255) ttGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGa > 1:562553/1‑149 (MQ=255) ttGAAAGGAAACGAAAAAAGAAAATTATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTTATGCTCTTCTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGa < 2:766625/149‑1 (MQ=255) aaGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATaaa < 1:548196/149‑1 (MQ=255) aGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATaaaa < 2:115796/149‑1 (MQ=255) ggAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAAATCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTTTCAGAAGACGTTATTTATTCTGATaaaaa > 1:910010/1‑149 (MQ=255) aaaCGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAaac > 2:1014561/1‑149 (MQ=255) aCGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAaacaa < 1:743937/149‑1 (MQ=255) aCGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAaacaa < 2:763831/149‑1 (MQ=255) GCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAacaaca > 2:34678‑M1/1‑149 (MQ=255) | GACATGTGGATTTCCTCAAAAGTCAGCAGGGCAAAAGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACA > NC_000913/4326730‑4327026 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |