New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4326878 = | 99 (1.670) | 6 (0.110) | 6/258 | NT | 6.2% | intergenic (‑144/‑257) | yjdM/crfC | zinc‑ribbon family protein/clamp‑binding sister replication fork colocalization protein, dynamin‑related |
? | NC_000913 | 4326902 = | 88 (1.590) | intergenic (‑168/‑233) | yjdM/crfC | zinc‑ribbon family protein/clamp‑binding sister replication fork colocalization protein, dynamin‑related |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
GCAGGGCAAAAGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACACACTAAATATAAAATTATTTCTTG > NC_000913/4326755‑4327050 | ttgttttttatcagaataaataacgtcttctgatacgtttaaaacgtcagaaagataaaaatatcatgtgaattaaaaaaagaacaagtagagcattaacattatcttaaataataaatagagGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCct > 1:365852‑M1/124‑149 (MQ=255) tgtttttaatcagaataaataaagtcttcttatacgtttaaaacgacagaaagataaaaatatcatgtgaattaaaaaaataacaagtagagcattaacattatcttaaataataaatagagGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCctc > 2:1001027‑M1/123‑149 (MQ=255) gggCAAAAGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGCCGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCctcaa > 1:830270/1‑147 (MQ=255) gCAAAAGCGCCAAAACACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACCCAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACGGCTGATTTTAGACGACGATCGTGTTCATGTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTGtatt > 1:76017/1‑149 (MQ=255) gCAAAAGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGAAGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTAtatt > 2:747222/1‑149 (MQ=255) cAAAAGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATACCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTATCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCtattt > 2:281908/1‑149 (MQ=255) aaaaGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCTAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCtattta < 1:269677/149‑1 (MQ=255) gcgcCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTtattat < 2:869572/149‑1 (MQ=255) aaaaaaCGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGACTCTATTTATTATTTAAg > 1:501318/1‑149 (MQ=255) aaaaaCGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGa > 1:873739/1‑149 (MQ=255) aCGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCATGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAAt < 1:26291/149‑1 (MQ=255) aCGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACAAAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAAt < 2:819666/149‑1 (MQ=255) cAGATTGCCGATAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGATAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGGCTCTATTTATTATTTAAGATAATGttt > 2:265440/1‑148 (MQ=255) aGATTGCCGAAAAAGGCCGCTATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTaa < 1:535282/149‑1 (MQ=255) ccGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGctct > 2:885191/1‑149 (MQ=255) ccGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGctct < 1:1006863/149‑1 (MQ=255) cGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCGCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGCTCGTTTTCATTTGAAAGCAAACGCAAAAATAAAATAATCTTTTTGCCTCTAATTATTAATTAAGATAAAGTTAATgaacta > 2:538292/1‑144 (MQ=255) acgtttaaaacgtcataaagataaaaatatcatgttaattaaaaaaagaacaagtagagcattaacattatcttaaataataaatagagGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTAc > 2:595197‑M1/90‑149 (MQ=255) 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ggCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTc < 2:145923/149‑1 (MQ=255) cGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTTTCGGGTTTACTTCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTTAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCttt < 2:803075/149‑1 (MQ=255) aaTTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCtttttt < 1:552051/149‑1 (MQ=255) cacaAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTca < 2:873739/149‑1 (MQ=255) ataaaaatatcattttaattaaaaaaataacaagtagagcattaacattatcttaaataataaatagagGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTcac > 1:961740‑M1/70‑149 (MQ=255) 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ttttgcCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACACACTAAATATAAAattat < 2:284935‑M2/143‑1 (MQ=255) ctctATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGGTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACACACTAAATATAAAATTATTTCTTg > 1:887687/1‑149 (MQ=255) | GCAGGGCAAAAGCGCCAAAAAACGGCAGATTGCCGAAAAAGGCCGCAATTATACACAAAATCCCTGAGTTTGTCGGGGGTACTGCTGATTTTAGACGACGATCGTTTTCATTTGAAAGGAAACGCAAAAAGAAAATAATCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACACACTAAATATAAAATTATTTCTTG > NC_000913/4326755‑4327050 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |