| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2446595 | 53 (0.890) | 5 (0.090) | 3/268 | NT | 9.5% | coding (879/1086 nt) | aroC | chorismate synthase |
| ? | NC_000913 | = 2446636 | 44 (0.760) | coding (838/1086 nt) | aroC | chorismate synthase | |||||
CGCGGATCCCGACACAGGGATCGTGACGGCCTTTGGTGATCATCTCAACTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAAAGCCGTCGCCAATTTCCACGCCTTTCACCGCGTTGATGCTCATCAGCGCATGGGC > NC_000913/2446492‑2446783 | cgcgGATCCCGACACAGGGATCGTGACGGCCTTTGGTGATCATCTCAACTTCTTCGCCAACGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATaccg < 2:734511‑M2/149‑5 (MQ=255) gcgGATCCCGACACAGGGATCGTGACGGCCTTTGGTGATCATCTCAACTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTTATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATAccgc > 1:850412/1‑149 (MQ=255) cgGATCCCGACACAGGGATCGTGACGGCCTTTGGTGATCATCTCAACTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATAccgcc < 2:880083/149‑1 (MQ=255) cgGATCCCGACACAGGGATCGTGACGGCCTTTGGTGATCATCTCAACTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATAccgcc < 2:507317/149‑1 (MQ=255) gctCCCGACACAGGGATCGTGACGGCCTTTGGTGATCATCGCAACTTCTTCGCCAACGCGGTTAATGGTACGACCCGGCCCGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCga < 2:1013412/147‑1 (MQ=255) tCCCGCCACAGGGATCGTGACGGCCTTTGGTGATCATCTCAACTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGCCCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCgaga > 1:718403/1‑149 (MQ=255) ccGACACAGGGATCGTGACGGCCTTTGGTGATCATCTCAACTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAAt < 1:370580/149‑1 (MQ=255) cGACACAGGGATCGTGACGGCCTTTGGTGATCATCTCAACTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATg < 1:835899/149‑1 (MQ=255) cgggATCGAGTCGGCCTTTGGTGATCATCTCAACTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACCACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTTCTGATACCGCCGAGAATGccgccc < 2:824152/148‑1 (MQ=255) aGGGATCGTGACGGCCTTTGGTGATCATCTCAACTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGccgccc > 2:150618/1‑149 (MQ=255) ggATCGTGACGGCCTTTGGTGATCATCTCAACTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGccgcccgc < 2:778457/149‑1 (MQ=255) ggCCTTTGGTGATCATCTCAACTTCTTCGCCAAGGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGctc < 2:290425/149‑1 (MQ=255) ggCCTTTGGTGATCATCTCAACTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGctc > 2:929653/1‑149 (MQ=255) gCCTTTGGTGATAATCTTAAGTTCTTCGCCAAAGGGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCAGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGGCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGctct < 2:1018717/149‑1 (MQ=255) cTTTGGTGATCATCTCAACTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTgg < 1:266229/149‑1 (MQ=255) tGATCATCTCAACTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCg > 2:535965/1‑149 (MQ=255) gATCATCTCAACTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATTGTTGATCTGGAAACCGt > 2:114168/1‑149 (MQ=255) atcTCAACTTCTTCGCCAAAGCGGTAAATGGTACGACCCGGCACGGTAAGGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATCTGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCttt < 1:720464/149‑1 (MQ=255) tctcAACTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTg < 2:352778/149‑1 (MQ=255) ctcAACTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTgg < 1:731031/149‑1 (MQ=255) cttcGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCa > 1:42205/1‑149 (MQ=255) cGCCCAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCCCGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATcg < 2:469137/149‑1 (MQ=255) cGCCAAAGCGGTTAATTGTACGACCCGGGACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATcg < 2:654247/149‑1 (MQ=255) cGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGGCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATcg < 2:635939/149‑1 (MQ=255) ccAAATCGGGTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATcgcg < 2:385019/149‑1 (MQ=255) ccAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATcgcg > 2:617810/1‑149 (MQ=255) cAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCgg > 2:123673/1‑149 (MQ=255) gACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAgc > 1:760589/1‑149 (MQ=255) aTGCTGGAGGGCGGTTTCAGCGCCATATGGTCAATGATTTTCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCaaa < 2:574378/149‑1 (MQ=255) gCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATaccgacctccagcattaccgtgccgggtcgtaccattaaccgctttggcgaagaagttgagatgatcaccaaaggccgtcacgatccctgtgtcg < 1:856231‑M2/149‑96 (MQ=255) gCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATaccgacctccagcattaccgtgccgggtcgtaccattaaccgctttggcgaagaagttgagatgatcaccaaaggccgtcacgatccctgtgtcg < 1:673376‑M2/149‑96 (MQ=255) gAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAAAGCCGTc < 2:361084/149‑1 (MQ=255) gAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAAAGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAACCCGTCGATCGTGATTTCCTCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAAACCCGTc > 2:201892/1‑149 (MQ=255) gTCGGTTTCAGCGACATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATaccgacctccagcattaccgtgccggggcgtaccattaaccgctttggcgaagaagttgagatgatcaccaaaggccgtcacgatccctgtgtcgggatccg < 1:959343‑M2/149‑103 (MQ=255) cGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCAGGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTTGCTGCCGCGCAGCGCCCCCACGTCAAAGCCGTCGCCaa > 1:567650/1‑149 (MQ=255) gTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAAAGCCGTCGCCAAtt > 2:146938/1‑149 (MQ=255) gTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAAAGCCGTCGCCAAtt > 1:727213/1‑149 (MQ=255) gTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAAAGCCGTCGCCAAtt > 1:5099/1‑149 (MQ=255) tttCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACAACGTCACAGCCGTCGCCAAttt > 2:648587/1‑149 (MQ=255) ttCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCGGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAAAGCCGTCGCCAATTTc < 2:401432/149‑1 (MQ=255) aGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTTAAAGCCGTCGCCAATTTCCAc < 2:426334/149‑1 (MQ=255) atatGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGATTGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAAAGCCGTCGCCAATTTCCACGCCttt < 1:21341/149‑1 (MQ=255) atGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAAAGCCGTCGCCAATTTCCACGCCTTTcc > 1:36507/1‑148 (MQ=255) atGGGCAATGATGTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAAAGCCGTCGCCAATTTCCACGCCTTTCa < 1:210189/149‑1 (MQ=255) gCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAACGCCGTCGCCAATTTCCACGCCTTTCACcgc > 1:549617/1‑149 (MQ=255) aaTGATTTGCTGCCCGCTGCTGATaccgacctccagcattaccgtgccgggtcgtaccattaaccgctttggcgaagaagttgagatgatcaccaaaggccgtcacgatccctgtgtcgggatccgcgcagtgccgatcgcagaagcga > 2:673376‑M2/1‑24 (MQ=255) aaTGATTTGCTGCCCGCTGCTGATaccgacctccagcattaccgtgccgggtcgtaccattaaccgctttggcgaagaagttgagatgatcaccaaaggccgtcacgatccctgtgtcgggatccgcgcagtgccgatcgcagaagcga > 2:856231‑M2/1‑24 (MQ=255) aaTGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAAAGCCGTCGCCAATTTCCACGCCTTTCACCGCGt < 2:866271/149‑1 (MQ=255) gATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAAAGCCGTCGCCAATTTCCCCGCCTTTCACCGCGTTGa > 2:1006156/1‑149 (MQ=255) gATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAAAGCCGTCGCCAATTTCCACGCCTTTCACCGCGTTGa > 2:35199/1‑149 (MQ=255) tttGCTGCCCGCGGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAAAGCCGTCGCCAATTTCCACGCCTTTCACCGCGTTGATg < 2:718403/149‑1 (MQ=255) ctgcCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCCCCCCGTCAAAGCCGTCGCCAATTTCCACGCCTTTCACCGCGTTGATGCtca > 2:874717/1‑149 (MQ=255) ctgcCAGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCAGCACGCATGGTGGCTCTGGATACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCTCGTCAAAGCCGTCGCCAATTTCCACGCCTTTCACCGCGTTGATGCtca < 1:666681/149‑1 (MQ=255) cGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGGATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAAAGCCGTCGCCAATTTCCACGCCTTTCACCGCGTTGATGCTCATCAgc < 2:788246/149‑1 (MQ=255) tgATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCCGCGCCACCACGTCAAAGCCGTCGCCAATTTCCACGCCTTTCACCGCGTTGATGCTCATCAGCGCATgg > 1:69130/1‑149 (MQ=255) tgATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAAAGCCGTCGCCAATTTCCACGCCTTTCACCGCGTTGATGCTCATCAGCGCATgg > 2:193547/1‑149 (MQ=255) gATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAAAGCCGTCGCCAATTTCCACGCCTTTCACCGCGTTGATGCTCATCAGCGCATggg < 2:375530/149‑1 (MQ=255) aTACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACGGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAAAGCCGTCGCCAATTTCCACGCCTTTCCCCGCGTTGATGCTCATCAGCGCAGGGGc > 2:130342/1‑149 (MQ=255) aTACCGCCGAGAATGCCGCCCGCAGGGTTGCGCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGGCAAAGCCGTCGCCAATTTCCACGCCTTTCCCCGCGGTGATGCTCATCAGCGCATGGGc < 1:195562/149‑1 (MQ=255) aTACCGCCGAGAATGACGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAAAGCCGTCGCCAATTTCCACGCCTTTCACCGCGTTGATGCTCATCAGCGCATGGGc > 2:9706/1‑149 (MQ=255) | CGCGGATCCCGACACAGGGATCGTGACGGCCTTTGGTGATCATCTCAACTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAGCGCCATATGGGCAATGATTTGCTGCCCGCTGCTGATACCGCCGAGAATGCCGCCCGCATGGTTGCTCTGGAAACCGTCTTTGGTGATTTCATCGCGGTTCTGGCTGCCGCGCAGCGCCACCACGTCAAAGCCGTCGCCAATTTCCACGCCTTTCACCGCGTTGATGCTCATCAGCGCATGGGC > NC_000913/2446492‑2446783 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |