| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2466384 | 544 (1.000) | 76 (0.160) | 51/244 | NT | 13.8% | intergenic (+1/‑161) | argW/intS | tRNA‑Arg/CPS‑53 (KpLE1) prophage; putative prophage CPS‑53 integrase |
| ? | NC_000913 | 2476600 = | 472 (0.980) | intergenic (+2/+94) | pawZ/dsdC | tRNA‑OTHER/dsd operon activator; autorepressor | |||||
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
AAAACCCGGCATAAATGGCGAGGGTTTAAGCAATCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2466220‑2466384‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCTTCAATTTTT > NC_000913/2476600‑2476748 AAACCCGGCATAAATGGCGAGGGTTTAAGCAATCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCT < 2:5686495/150‑1 AAACCCGGCATAAATGGCGAGGGTTTAAGCAATCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCT > 1:583125/1‑150 AAACCCGGCATAAATGGCGAGGGTTTAAGCAATCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCT < 2:7544666/150‑1 AAACCCGGCATAAATGGCGAGGGTTTAAGCAATCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCT > 1:2504989/1‑150 AAACCCGGCATAAATGGCGAGGGTTTAAGCAATCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCACATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCT > 2:1747301/1‑150 ACCCGGCATAAATGGCGAGGGTTTAAGCAATCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGC < 1:1487620/150‑1 CCCGGCCTAAATGGCGAGGGTTTAAGCAATCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCA < 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2:918654/1‑150 aaaCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCT < 2:8609166/147‑1 GCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACC < 2:4971680/150‑1 GCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACA > 2:6609790/1‑150 CAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACAT < 2:8126503/150‑1 TACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAA < 1:212041/150‑1 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CATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCTTCAATTT > 2:1550469/1‑150 ATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCTTCAATTTT > 1:511768/1‑150 ATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCTTCAATTTT < 2:7884875/150‑1 ATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCTTCAATTTT < 2:5772325/150‑1 TCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCTTCAATTTTT < 1:4867158/150‑1 TCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCTTCAATTTTT < 1:5405557/150‑1 TCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCTTCAATTTTT < 2:7679840/150‑1 TCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCTTCAATTTTT < 2:7084607/150‑1 TCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCTTCAATTTTT < 1:7702165/150‑1 TCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCTTCAATTTTT < 2:211905/150‑1 AAAACCCGGCATAAATGGCGAGGGTTTAAGCAATCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2466220‑2466384‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCTTCAATTTTT > NC_000913/2476600‑2476748 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |