New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2466384 | 544 (1.000) | 76 (0.160) | 51/244 | NT | 13.8% | intergenic (+1/‑161) | argW/intS | tRNA‑Arg/CPS‑53 (KpLE1) prophage; putative prophage CPS‑53 integrase |
? | NC_000913 | 2476600 = | 472 (0.980) | intergenic (+2/+94) | pawZ/dsdC | tRNA‑OTHER/dsd operon activator; autorepressor |
Only 100 of 783 total aligned reads displayed.
TGGCGAGGGTTTAAGCAATCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGCCGCACTCCATGACGGGTAAAAAGTGGATAAAATAATTTTACCCACCG > NC_000913/2466235‑2466533 | cGAGGGTTTAAGCAATCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTa < 2:619036/150‑1 (MQ=255) gTTTAAGCAATCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGt < 2:2380196/150‑1 (MQ=255) tttAAGCAATCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGtt > 2:7773730/1‑150 (MQ=255) tAAGCAATCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCg < 1:3092966/150‑1 (MQ=255) aGCAATCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATccttgtgtttatc > 2:918654‑M1/1‑137 (MQ=255) aGCAATCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCt < 2:3754199/150‑1 (MQ=255) cAATCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTcc > 1:8026203/1‑150 (MQ=255) aTCGAGTGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCa < 1:499471/150‑1 (MQ=255) aTCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCa < 2:6994684/150‑1 (MQ=255) tCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCAt > 1:7834234/1‑150 (MQ=255) tCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCAt > 1:3244353/1‑150 (MQ=255) gAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATcc > 2:1789003/1‑150 (MQ=255) gAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATcc > 2:4116667/1‑150 (MQ=255) ggCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTAc > 1:1045761/1‑150 (MQ=255) gTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTcc > 1:64787/1‑150 (MQ=255) gTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTcc < 1:2760507/150‑1 (MQ=255) aCTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACAGCATccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaac > 2:4904320‑M1/1‑118 (MQ=255) cTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCa > 2:3883825/1‑150 (MQ=255) ttACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCaa < 2:6560916/150‑1 (MQ=255) aCCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCaaaa > 1:7478568/1‑150 (MQ=255) aCCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCaaaa < 1:7044502/150‑1 (MQ=255) aCCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGACGCATTGTCCTCTAAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCaaaa > 2:670004/1‑150 (MQ=255) cccGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATc > 1:634218/1‑150 (MQ=255) cccGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATc > 1:529995/1‑150 (MQ=255) cGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATccc < 2:8318820/150‑1 (MQ=255) cGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATccc > 1:2522493/1‑150 (MQ=255) cGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATccc < 1:9111120/150‑1 (MQ=255) cGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATccc < 2:1323851/150‑1 (MQ=255) cACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCt < 2:5587561/150‑1 (MQ=255) cACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCATACCAGTCCGCAAAATCCCCt < 1:6763689/150‑1 (MQ=255) cATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAata > 1:8828994/1‑150 (MQ=255) ttAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATc < 1:1810197/150‑1 (MQ=255) ttAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATc < 1:2013426/150‑1 (MQ=255) tAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCa < 1:2850586/150‑1 (MQ=255) gCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAg < 2:7100700/150‑1 (MQ=255) gggTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCa > 2:3990778/1‑150 (MQ=255) ggTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCAt < 1:4113769/150‑1 (MQ=255) tataCTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTc < 1:4339697/150‑1 (MQ=255) ataCTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTcc > 2:745207/1‑150 (MQ=255) ataCTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTcc > 2:4763077/1‑150 (MQ=255) aCTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGt < 2:8137967/150‑1 (MQ=255) cTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTa < 2:5356570/150‑1 (MQ=255) cATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGa > 2:8683521/1‑150 (MQ=255) aTGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGAt < 1:5888405/150‑1 (MQ=255) cGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggc < 2:679961‑M1/150‑69 (MQ=255) gTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCg > 1:2101912/1‑150 (MQ=255) ctctTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccagga > 2:9021678‑M1/1‑73 (MQ=255) tctTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCAt > 2:7254017/1‑150 (MQ=255) gTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTc > 1:566696/1‑150 (MQ=255) aaTGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCtt < 1:3997312/150‑1 (MQ=255) aTGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTc < 2:8869682/150‑1 (MQ=255) aTGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTc > 1:1260734/1‑150 (MQ=255) aTGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTc > 1:6068144/1‑150 (MQ=255) tGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCa > 2:7907467/1‑150 (MQ=255) atatAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGAt > 1:4490422/1‑150 (MQ=255) taACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGt < 2:6429511/150‑1 (MQ=255) aGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACa < 2:8589625/150‑1 (MQ=255) ccccTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGc < 1:7334255/150‑1 (MQ=255) cccTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggtcgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagt > 1:2206461‑M1/1‑47 (MQ=255) cccTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGcc > 1:1512129/1‑150 (MQ=255) cccTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGcc < 2:2900128/150‑1 (MQ=255) cccTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGAGTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATCTCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGcc < 2:7333851/150‑1 (MQ=255) cctcctAAGTGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGCCg < 2:5199640/150‑1 (MQ=255) cctcctAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGCCg < 1:2626494/150‑1 (MQ=255) ctcctAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGCCGc > 2:7528626/1‑150 (MQ=255) tcctAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGCCGCa > 1:339947/1‑150 (MQ=255) aaGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGCCGCACTcc < 1:826554/150‑1 (MQ=255) tAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagtggtttttacctgt > 2:4449269‑M1/1‑34 (MQ=255) ttCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGCCGCACTCCATGACGGGTAAAAAGt < 2:3602611/150‑1 (MQ=255) cGATTCCTGCAGGGGACACCATccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagtggtttttacctgttctcttagccag < 2:195436‑M1/150‑129 (MQ=255) cGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGCCGCACTCCATGACGGGTAAAAAGTgg < 2:4247020/150‑1 (MQ=255) gATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGCCGCACTCCATGACGGGTAAAAAGTGGa > 2:5930917/1‑150 (MQ=255) aTTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGCCGCACTCCATGACGGGTAAAAAGTGGAt > 1:4704885/1‑150 (MQ=255) tGCAGGGGACACCATccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagtggtttttacctgttctcttagccagataatat > 1:765628‑M1/1‑15 (MQ=255) tGCAGGGGACACCATccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagtggtttttacctgttctcttagccagataataa > 2:1562765‑M1/1‑15 (MQ=255) tGCAGGGGACACCATccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagtggtttttacctgttctcttagccagataataa > 1:6158811‑M1/1‑15 (MQ=255) tGCAGGGGACACCATccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaacgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagtggtttttacatgttctcttagccagataataa > 2:853227‑M1/1‑15 (MQ=255) gCAGGGGACACCATccttgtgtttatccctaaaaccacataaataccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagtggtttttacctgttctcttagccagataataaa < 2:3382599‑M1/150‑137 (MQ=255) gCAGGGGACACCATccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagtggtttttacctgttctcttagccagataataaa < 2:2696772‑M1/150‑137 (MQ=255) cAGGGGACACCATccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagtggtttttacctgttctctgagccagagactaaac > 1:4864658‑M1/1‑13 (MQ=255) aGGGGACACCATccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagtggtttttacctgttctcttagccagataataaacg < 1:869171‑M1/150‑139 (MQ=255) ggggACACCATccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagtggtttttacctgttctcttagccagataataaacgc < 1:5468033‑M1/150‑140 (MQ=255) gACACCATccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagtggtttttacctgttctcttagccagataataaacgcttc > 1:1690288‑M1/1‑8 (MQ=255) acacCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGCCGCACTCCATGACGGGTAAAAAGTGGATAAAATAATTTTAc < 1:5147092/150‑1 (MQ=255) acacCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGCCGCACTCCATGACGGGTAAAAAGTGGATAAAATAATTTTAc < 2:3245824/150‑1 (MQ=255) cacCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGCCGCACTCCATGACGGGTAAAAAGTGGATAAAATAATTTTAcc < 2:8026203/150‑1 (MQ=255) acCATccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagtggtttttacctgttctcttagccagataataaacgcttcaat > 2:1502188‑M1/1‑5 (MQ=255) acCATccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagtggtttttacctgttctcttagccagataataaacgcttcaat > 2:6361615‑M1/1‑5 (MQ=255) acCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGCCGCACTCCATGACGGGTAAAAAGTGGATAAAATAATTTTAccc > 2:2540980/1‑150 (MQ=255) acCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGCCGCACTCCATGACGGGTAAAAAGTGGATAAAATAATTTTAccc > 1:3603932/1‑150 (MQ=255) ccATccttgtgtttatccctaaaaccaaataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagtggtttttacctgttctcttagccagataataaacgcttcaatt < 1:3764858‑M1/150‑147 (MQ=255) cATccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagtggtttttacctgttctcttagccagataataaacgcttcaattt > 2:568512‑M1/1‑3 (MQ=255) cATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGCCGCACTCCATGACGGGTAAAAAGTGGATAAAATAATTTTACCCAc < 1:8435626/150‑1 (MQ=255) aTTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGCCGCACTCCATGACGGGTAAAAAGTGGATAAAATAATTTTACCCAcc > 1:9214606/1‑150 (MQ=255) aTTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGCCGCACTCCATGACGGGTAAAAAGTGGATAAAATAATTTTACCCAcc > 1:9027311/1‑150 (MQ=255) aTTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGCCGCACTCCATGACGGGTAAAAAGTGGATAAAATAATTTTACCCAcc > 1:7242302/1‑150 (MQ=255) tccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagtggtttttacctgttctcttagccagataataaacgcttcaattttt < 2:318943‑M1/150‑150 (MQ=255) tccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagtggtttttacctgttctcttagccagataataaacgcttcaattttt < 2:7679840‑M1/150‑150 (MQ=255) tccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagtggtttttacctgttctcttagccagataataaacgcttcaattttt < 2:109379‑M1/150‑150 (MQ=255) tccttgtgtttatccctaaaaccacataaaaaccgtaaattaaattcgaactagcaggccgaataaggcacaccaggaactcgtggttttattcattatgaagtggtttttacctgttctcttagccagataataaacgcttcaattttt < 2:5023204‑M1/150‑150 (MQ=255) | TGGCGAGGGTTTAAGCAATCGAGCGGCAGCGTACTTACCCCGCACTCCATTAGCGGGTATACTCATGCCGCATTGTCCTCTTAGTTAAATGGATATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAATTGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCATTTATCAGTTCGCTCCCATCCGTACCAGTCCGCAAAATCCCCTGAATATCAAGCATTCCGTAGATTTACAGTTCGTCATGGTTCGCTTCAGATCGTTGACAGCCGCACTCCATGACGGGTAAAAAGTGGATAAAATAATTTTACCCACCG > NC_000913/2466235‑2466533 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |