| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 1465092 = | 170 (1.880) | 9 (0.110) | 8/252 | NT | 5.6% | intergenic (+31/+73) | paaY/ynbG | thioesterase required for phenylacetic acid degradation; trimeric; phenylacetate regulatory and detoxification protein; hexapeptide repeat protein/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | 1465125 = | 147 (1.770) | intergenic (+64/+40) | paaY/ynbG | thioesterase required for phenylacetic acid degradation; trimeric; phenylacetate regulatory and detoxification protein; hexapeptide repeat protein/uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
GTACCAGGTGCTGGTGACACGCTGTAAGCAGACGTTACATCAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTT > NC_000913/1464944‑1465240 | gTACCAGGTGCTGGTGACACGCTGTAAGCAGACGTTACATCAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATta < 2:201350/149‑1 (MQ=255)actataattcacaattataattcaggtgaataaaaaaagaccatgaaatatataaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaa > 1:1584083‑M1/149‑149 (MQ=255) tataattcacaattataattcaggtgaataaaaaaagaccatgaaatatataaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcataataaataattatatgatgaaaaaactgtatgaattaatactcaaataaata < 1:428819‑M1/3‑1 (MQ=255) ataattcacaattataattcaggtgaataaaaaaagaccatgaaatatataaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaataa > 1:445358‑M1/146‑149 (MQ=255) cAGGTGCTGGTGACACGCTGTAAGCAGACGTTACATCAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATaaa > 2:673413/1‑149 (MQ=255) cAGGTGCTGGTGACACGCTGTAAGCAGACGTTACATCAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATaaa > 1:1445020/1‑149 (MQ=255) aattcacaattataattcaggtgaataaaaaaagaccatgaaatatataaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAg > 2:1053455‑M1/144‑149 (MQ=255) aattcacaattataattcaggtgaataaaaaaagaccatgaaatatataaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAg < 2:1557724‑M1/6‑1 (MQ=255) 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tttAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGt > 2:541109/1‑149 (MQ=255) aaTTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCtt > 2:1329113/1‑149 (MQ=255) ttATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCtttt > 2:823744/1‑149 (MQ=255) ttATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGCTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCtttt > 2:152417/1‑149 (MQ=255) tataAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCCTCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCttttt < 1:972730/149‑1 (MQ=255) ATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATTTGTTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTAtttttt < 1:1204937‑M1/149‑1 (MQ=255) ATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCtttttt < 1:339049‑M1/149‑1 (MQ=255) | GTACCAGGTGCTGGTGACACGCTGTAAGCAGACGTTACATCAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTT > NC_000913/1464944‑1465240 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |