New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1584174 | 144 (1.600) | 8 (0.100) | 7/250 | NT | 5.5% | intergenic (‑215/+33) | safA/ydeP | two‑component system connector membrane protein, EvgSA to PhoQP/putative oxidoreductase |
? | NC_000913 | = 1584181 | 143 (1.740) | intergenic (‑222/+26) | safA/ydeP | two‑component system connector membrane protein, EvgSA to PhoQP/putative oxidoreductase |
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
GAAAAGAGGAAATAGGACTGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATAGGTCACCAGTG > NC_000913/1584029‑1584322 | aaGAGGAAATAGGACTGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGAt > 2:1472395/1‑149 (MQ=255) agagGAAATAGGACTGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATg > 1:104376/1‑149 (MQ=255) gagGAAATAGGACTGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGa < 1:1453670‑M2/149‑2 (MQ=255) gagGAAATAGGACTGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGa > 2:338031‑M2/1‑148 (MQ=255) agGAAATAGGACTGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGac < 2:199400‑M2/149‑3 (MQ=255) aaaTAGGACTGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTCTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGacagc < 1:203924‑M2/149‑6 (MQ=255) aaTAGGACTGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGacagca < 1:1354029‑M2/149‑7 (MQ=255) cTGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTcatccgcacagcagaagaat < 1:644304‑M1/149‑21 (MQ=255) tGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAAt < 1:850931/149‑1 (MQ=255) ggTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTcatccgcacagcagaagaattc < 1:253459‑M1/149‑23 (MQ=255) ggCTTCAGTACTGAGAGTAGTTTCTTAGAGCTGTACGCATAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTATTTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGGCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACATCAGAAGAAATgag < 1:62466/148‑1 (MQ=255) ttCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGagaag > 2:327409/1‑149 (MQ=255) tCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTATGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGagaaga < 2:30717/149‑1 (MQ=255) tCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGagaaga < 1:850470/149‑1 (MQ=255) aGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAAt > 1:375139/1‑149 (MQ=255) gCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAAtt > 2:1193924/1‑149 (MQ=255) gCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAAtt > 2:329305/1‑149 (MQ=255) gAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGa < 1:1282159/149‑1 (MQ=255) gAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGa > 2:1141354/1‑149 (MQ=255) gAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGa > 1:1140485/1‑149 (MQ=255) ttttCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATg < 2:911303/148‑1 (MQ=255) tttCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGAt > 2:616788/1‑147 (MQ=255) tttCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATgg > 1:1194512/1‑149 (MQ=255) tttCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATgg > 2:127454/1‑149 (MQ=255) tttCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATgg > 2:323173/1‑149 (MQ=255) tttCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATgg > 1:1207567/1‑149 (MQ=255) tttCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATgg > 2:865699/1‑149 (MQ=255) cTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTc < 2:194919/149‑1 (MQ=255) ttACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCt > 2:297665/1‑149 (MQ=255) tACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTa > 2:1299810/1‑149 (MQ=255) aCAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTaa < 2:526612/149‑1 (MQ=255) aCAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTaa > 1:717892/1‑149 (MQ=255) cAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGAAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGGGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAAt < 1:102246/149‑1 (MQ=255) gatGTATGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCTGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTc < 2:264438/147‑1 (MQ=255) tGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCaa < 1:628810/149‑1 (MQ=255) tGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCaa > 2:571314/1‑149 (MQ=255) cAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGaa < 2:5432/149‑1 (MQ=255) aGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTACTCCATGTGAGCAAATTGGGAAATAATAGACAATGAGGAATACTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAAAGAGAATAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCgtatt > 2:773073/1‑145 (MQ=255) aGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAAt > 2:379443/1‑149 (MQ=255) caagTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTACTCCATGTGACCAAACTGCGAAATAAAAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTcatccccacagcagaagaattcctcattgactattatttcgcaatttgctcacatggattaaa < 1:76771‑M1/148‑64 (MQ=255) aaGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATAc > 1:317185/1‑149 (MQ=255) aaGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGAGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTATTCTGTGCGGATGACATCATAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATAc > 1:33835/1‑149 (MQ=255) ttttATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACtt < 2:41058/148‑1 (MQ=255) tttATATATTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACttt < 2:132243/149‑1 (MQ=255) ttATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACtttt < 1:326721/149‑1 (MQ=255) tatCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTtata > 1:953877/1‑149 (MQ=255) tatCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTtata < 2:826128/149‑1 (MQ=255) tCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGc < 1:862218/149‑1 (MQ=255) tCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGc > 1:443015/1‑149 (MQ=255) cTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGcc > 1:1284450/1‑149 (MQ=255) cTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGcc > 2:877745/1‑149 (MQ=255) cTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGcc > 2:1196600/1‑149 (MQ=255) ttATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTTCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTaa < 1:548551/124‑1 (MQ=255) ttATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTaa > 2:168129/1‑124 (MQ=255) ttATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTaa < 1:168129/124‑1 (MQ=255) tataGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAg < 1:1472395/149‑1 (MQ=255) tataGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAg < 2:1373733/149‑1 (MQ=255) ataGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAgg > 2:68713/1‑149 (MQ=255) aGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGaa > 2:317300/1‑149 (MQ=255) aGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGaa < 1:817387/149‑1 (MQ=255) tAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCAc < 1:1413487/149‑1 (MQ=255) tttaatttaaTCCATGTGATCAAATTGCTAAATTATATTGAATGAGGAATTCTTCTGCTTTTCGGATGACAGCAGAAGAAATGATAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTa < 2:855579/149‑1 (MQ=255) tttaatttaaTCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCAACTTa > 1:1167322/1‑149 (MQ=255) aatttaatCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATg > 2:1357939/1‑149 (MQ=255) aatttaatCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATg > 1:318145/1‑149 (MQ=255) aatttaatCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATg > 1:1252180/1‑149 (MQ=255) taatCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATc < 2:1434176/149‑1 (MQ=255) tCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGCCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTg < 2:209240/149‑1 (MQ=255) tgAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATc < 1:1590697/149‑1 (MQ=255) tgAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATc < 2:461555/149‑1 (MQ=255) aGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCaa < 2:219481/149‑1 (MQ=255) aGCAAATTGAGAAATAATAGTCATTGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCaa < 1:262380/149‑1 (MQ=255) gCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAg < 1:571314/149‑1 (MQ=255) tgagAAATAATAGTCAATGATGAATTCTTCTGCTGTGCTGATGAAAGCAGAAGATATGAGAAGAGGCATTTATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAg < 1:978933/146‑1 (MQ=255) tGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGacagcagaagaattcctcattgactattatttcgcaatttgctcacatggattaaattaaactacatactataagatataaacttcttcctacagctgtaagaaac < 2:1059596‑M2/149‑107 (MQ=255) gAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCAt > 1:1520191/1‑149 (MQ=255) aataatAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCAtgt > 2:1313690/1‑149 (MQ=255) taataGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTga < 2:1521969/149‑1 (MQ=255) aataGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATTACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTgat < 2:435459/149‑1 (MQ=255) taGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGacagcagaagaattcctcattgactattatttcgcaatttgctcacatggattaaattaaactacatactataagatataaacttctgcatacagctgtaagaaactccgctcagt < 2:1073397‑M2/149‑117 (MQ=255) aaTGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTgattcgattc > 1:418080/1‑149 (MQ=255) aTGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCt > 1:583082/1‑149 (MQ=255) tGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTg < 2:368135/149‑1 (MQ=255) tGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTg > 2:1459606/1‑149 (MQ=255) ggAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGaa > 2:340620/1‑149 (MQ=255) aTTCTTCTGCTGTGCGGATGacagcagaagaattcctcattgactattatttcgcaatttgctcacatggattaaattaaactacatactataagatataaacttctgcctacagctgtaagaaactccgctcagtactgaagcaccag < 1:352786‑M2/149‑130 (MQ=255) aTTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAAt < 1:696687/149‑1 (MQ=255) ttcttcTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATa < 2:1216576/149‑1 (MQ=255) ttcttcTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATa < 1:327286/149‑1 (MQ=255) cttctGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATAgg < 1:877745/149‑1 (MQ=255) ttctGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATAGGt < 2:953877/149‑1 (MQ=255) ctgctgTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATAGGTCa < 2:1075773/149‑1 (MQ=255) tgctgTcatccgcacagcagaagaattcctcattgactattatttcgcaatttgctcacatggattaaattaaactacatactataagatataaacttctgcctacagctgtaagaaactccgctcagtactgaagcaccagtcctatt > 1:507403‑M1/1‑6 (MQ=255) tgctgTGCGGATGacagcagaagaattcctcattgactattatttcgcaatttgctcacatggattaaattaaactacatactataagatataaacttctgcctacagctgtaagaaactccgctcagtactgaagcaccagtcctatt < 2:1001286‑M2/149‑137 (MQ=255) ctgTcatccgcacagcagaagaattcctcattgactattatttcgcaatttgctcacatggattaaattaaactacatactataagatataaacttctgcctacagctgtaagaaactccgctcagtactgaagcaccagtcctatttc < 2:84794‑M1/149‑146 (MQ=255) ctgTcatccgcacagcagaagaattcctcattgactattatttcgcaatttgctcacatggattaaattaaactacatactataagatataaacttctgcctacagctgtaagaaactccgctcagtactgaagcaccagtcctatttc < 1:395526‑M1/149‑146 (MQ=255) tgtgCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATAGGTCACCAg < 2:1565791/149‑1 (MQ=255) tgTcatccgcacaggagaagaattcctcattgactattatttcgcaatttgctgacttggattaaattaaactacataatataagatataaacttctgcctacagctgtaagaaactccgctctttactgaagcaccagtcctatttcc < 1:541107‑M1/149‑147 (MQ=255) gtgCGGATGacagcagaagaattcctcattgactattatttcgcaatttgctcacatggattaaattaaactacatactataagatataaacttctgcctacagctgtaagaaactccgctcagtactgaagcaccagtcctatttcct < 1:357285‑M2/149‑141 (MQ=255) gTcatccgcacagcagaagaattcctcattgactattatttcgcaatttgctcacatggattaaattaaactacatactataagatataaacttctgcctacagctgtaagaaactccgctcagtactgaagcaccagtcctatttcct < 2:1131874‑M1/149‑148 (MQ=255) | GAAAAGAGGAAATAGGACTGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATAGGTCACCAGTG > NC_000913/1584029‑1584322 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |