New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1584174 | 144 (1.600) | 8 (0.100) | 7/250 | NT | 5.5% | intergenic (‑215/+33) | safA/ydeP | two‑component system connector membrane protein, EvgSA to PhoQP/putative oxidoreductase |
? | NC_000913 | = 1584181 | 143 (1.740) | intergenic (‑222/+26) | safA/ydeP | two‑component system connector membrane protein, EvgSA to PhoQP/putative oxidoreductase |
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
AGAGGAAATAGGACTGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATAGGTCACCAGTGAGCGGTC > NC_000913/1584033‑1584329 | agagGAAATAGGACTGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATg > 1:104376/1‑149 (MQ=255) gAAATAGGACTGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGacag < 2:84794‑M2/149‑5 (MQ=255) gAAATAGGACTGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGacag < 1:395526‑M2/149‑5 (MQ=255) aaaTAGGACTGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTCTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGacagc < 1:203924‑M2/149‑6 (MQ=255) aaTAGGACTGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGacagca > 1:507403‑M2/1‑143 (MQ=255) tGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAAt < 2:203924/149‑1 (MQ=255) tGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAAt < 2:1453670/149‑1 (MQ=255) gTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATga > 2:262380/1‑149 (MQ=255) ggCTTCAGTACTGAGAGTAGTTTCTTAGAGCTGTACGCATAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTATTTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGGCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACATCAGAAGAAATgag < 1:62466/148‑1 (MQ=255) ttCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGagaag > 2:327409/1‑149 (MQ=255) tgaGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGagaaga < 2:673595/147‑1 (MQ=255) tCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGagaaga < 1:850470/149‑1 (MQ=255) aGTACTGACCGGAGTTTCTTTCAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAgg < 1:1511006/149‑1 (MQ=255) aGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAAt > 1:375139/1‑149 (MQ=255) gCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAAtt < 2:1395233/149‑1 (MQ=255) gCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAAtt > 2:329305/1‑149 (MQ=255) cGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAAttt < 1:900083/149‑1 (MQ=255) gAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGa > 2:1141354/1‑149 (MQ=255) gAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGa > 1:1140485/1‑149 (MQ=255) ttttCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATg < 2:911303/148‑1 (MQ=255) tttCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATgg > 1:1194512/1‑149 (MQ=255) tttCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATgg > 1:1207567/1‑149 (MQ=255) tttCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATgg > 2:323173/1‑149 (MQ=255) tttCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATgg > 2:127454/1‑149 (MQ=255) tCTTACAGATGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGtt < 2:829282/149‑1 (MQ=255) cTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTc < 2:194919/149‑1 (MQ=255) aCAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTaa < 2:526612/149‑1 (MQ=255) aCAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTaa > 1:717892/1‑149 (MQ=255) aCAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTaa < 2:614021/149‑1 (MQ=255) cAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGAAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGGGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAAt < 1:102246/149‑1 (MQ=255) tGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCaa < 1:628810/149‑1 (MQ=255) gTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAAc < 2:1194512/149‑1 (MQ=255) cAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGaa < 2:5432/149‑1 (MQ=255) aGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTACTCCATGTGAGCAAATTGGGAAATAATAGACAATGAGGAATACTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAAAGAGAATAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCgtatt > 2:773073/1‑145 (MQ=255) aGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAAt > 2:379443/1‑149 (MQ=255) gAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATa < 2:187727/149‑1 (MQ=255) aaGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGAGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTATTCTGTGCGGATGACATCATAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATAc > 1:33835/1‑149 (MQ=255) ttttATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACtt < 2:41058/148‑1 (MQ=255) tttATATATTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACttt < 2:132243/149‑1 (MQ=255) ttATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACtttt < 1:326721/149‑1 (MQ=255) tataTCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTta < 1:127454/149‑1 (MQ=255) tatCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTtata > 1:861839/1‑149 (MQ=255) tatCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTtata > 1:953877/1‑149 (MQ=255) cTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGcc > 1:1284450/1‑149 (MQ=255) cTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGcc > 2:877745/1‑149 (MQ=255) ttATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTTCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTaa < 1:548551/124‑1 (MQ=255) ttATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTaa > 2:548551/1‑124 (MQ=255) ttATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCa > 1:461555/1‑149 (MQ=255) ttATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCa > 2:1519297/1‑149 (MQ=255) tataGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAg < 2:1373733/149‑1 (MQ=255) ataGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAgg > 2:68713/1‑149 (MQ=255) aGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGaa > 2:317300/1‑149 (MQ=255) gTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAAt < 2:317185/149‑1 (MQ=255) tGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGcc > 2:416759/1‑149 (MQ=255) gTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTGCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCa < 2:871149/149‑1 (MQ=255) tAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCAc < 1:1413487/149‑1 (MQ=255) tAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCAc > 2:268307/1‑149 (MQ=255) tttaatttaaTCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTa > 1:368135/1‑149 (MQ=255) tttaatttaaTCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCAACTTa > 1:1167322/1‑149 (MQ=255) ttaatttaatCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTaa < 1:84794/149‑1 (MQ=255) taatttaatCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAAt < 2:355920/149‑1 (MQ=255) aatttaatCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATg > 2:1314168/1‑149 (MQ=255) aatttaatCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATg > 1:1252180/1‑149 (MQ=255) aatttaatCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATg > 2:1357939/1‑149 (MQ=255) aatttaatCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATg > 1:318145/1‑149 (MQ=255) tttaatCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGGGGATGacagcagaagaattcctcattgacttttatttcgcagtttggtcacatggagtaaattaaactacatactataagatataaacttg < 1:76771‑M2/149‑87 (MQ=255) tCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTg < 1:327409/149‑1 (MQ=255) ccATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTgg < 1:572606/149‑1 (MQ=255) tgAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATc > 1:1392008/1‑149 (MQ=255) tgAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATc < 1:1590697/149‑1 (MQ=255) tgAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATc < 2:461555/149‑1 (MQ=255) aGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCaa < 2:219481/149‑1 (MQ=255) aGCAAATTGAGAAATAATAGTCATTGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCaa < 1:262380/149‑1 (MQ=255) gCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAg < 1:571314/149‑1 (MQ=255) tgagAAATAATAGTCAATGATGAATTCTTCTGCTGTGCTGATGAAAGCAGAAGATATGAGAAGAGGCATTTATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAg < 1:978933/146‑1 (MQ=255) tGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGacagcagaagaattcctcattgactattatttcgcaatttgctcacatggattaaattaaactacatactataagatataaacttcttcctacagctgtaagaaac < 2:1059596‑M2/149‑107 (MQ=255) gAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCAt > 1:1520191/1‑149 (MQ=255) gAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATAGTGGTTATCAAGTGTTAGCAt > 2:306223/1‑149 (MQ=255) aaaTAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCAtg < 1:317300/149‑1 (MQ=255) aataatAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCAtgt < 2:861839/149‑1 (MQ=255) taataGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTga < 2:1521969/149‑1 (MQ=255) aataGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTgat > 2:1183031/1‑149 (MQ=255) taGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGacagcagaagaattcctcattgactattatttcgcaatttgctcacatggattaaattaaactacatactataagatataaacttctgcatacagctgtaagaaactccgctcagt < 2:1073397‑M2/149‑117 (MQ=255) gTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTgattcga < 2:1083317/149‑1 (MQ=255) tCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTgattcgat > 1:699872/1‑149 (MQ=255) aaTGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTgattcgattc > 1:418080/1‑149 (MQ=255) aTGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCt > 1:583082/1‑149 (MQ=255) tGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTg < 2:368135/149‑1 (MQ=255) tGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTg > 1:1455277/1‑149 (MQ=255) gAATTCTTCTGCTGTGCGGATGacagcagaagaattcctcattgactattatttcgcaatttgctcacatggattaaattaaactacatactataagatataaacttctgcctacagctgtaagaaactccgctcagtactgaagcacc < 1:253459‑M2/149‑128 (MQ=255) aTTCTTCTGCTGTGCGGATGacagcagaagaattcctcattgactattatttcgcaatttgctcacatggattaaattaaactacatactataagatataaacttctgcctacagctgtaagaaactccgctcagtactgaagcaccag < 1:644304‑M2/149‑130 (MQ=255) aTTCTTCTGCTGTGCGGATGacagcagaagaattcctcattgactattatttcgcaatttgctcacatggattaaattaaactacatactataagatataaacttctgcctacagctgtaagaaactccgctcagtactgaagcaccag < 1:352786‑M2/149‑130 (MQ=255) ttcttcTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATa < 2:33835/149‑1 (MQ=255) ttcttcTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATa < 2:1216576/149‑1 (MQ=255) cttctGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATAgg < 2:1207567/149‑1 (MQ=255) ttctGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATAGGt < 2:953877/149‑1 (MQ=255) ctgctgTGCGGATGACTGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATAGGTCa < 1:865699/149‑1 (MQ=255) gctgTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATAGGTCAcc > 2:1303212/1‑149 (MQ=255) tgtgCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATAGGTCACCAg < 2:1565791/149‑1 (MQ=255) gACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATAGGTCACCAGTGAGCGGTc > 1:292931/1‑149 (MQ=255) | AGAGGAAATAGGACTGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATAGGTCACCAGTGAGCGGTC > NC_000913/1584033‑1584329 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |