| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2606125 = | 85 (0.940) | 6 (0.070) | 5/260 | NT | 6.9% | coding (1315/1440 nt) | hyfD | hydrogenase 4, membrane subunit |
| ? | NC_000913 | 2606172 = | 81 (0.950) | coding (1362/1440 nt) | hyfD | hydrogenase 4, membrane subunit | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CAACGGCTTCTTCAGTAAATTCCCGCTGTTTGCTGCCGGTTTTGCGTTGTCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCGG > NC_000913/2605977‑2606269 | acatcgatgtcagcatcatcagtcccgccagattatttactatcaaagaaccggtcattcatcatctccttactgcaaccaggtcgcggcgattacgctggaaatcagcgacatcacaatcagtacaatcaacaccaggcgcattgatc > 1:1032542‑M1/149‑149 (MQ=255) aaCGGCTTCTTCAGTAAATTCCCGCTGTTTGCTGCCGGTTTTGCGTTGTCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGcc > 2:1318896/1‑149 (MQ=255) aaCGGCTTCTTCAGTAAATTCCCGCTGTTTGCTGCCGGTTTTGCGTTGTCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGcc > 2:260566/1‑149 (MQ=255) agcgatgtcagcatcatcagtcccgccagattatttacgatcatagaaccggtcattcatcatctccttactgcaaccaggtcgcggcgattacgctggatatcagcgacatcacaatcagtacaatcaacaccaggcgcattgatCCt < 2:1132652‑M1/3‑1 (MQ=255) agcgatgtcagcatcatcagtcccgccagattatttacgatcatagaaccggtcattcatcatctccttactgcaaccaggtcgcggcgattacgctggaaatcagcgacatcacaatcagtacaatcaacaccaggcgcattgatCCt < 1:488817‑M1/3‑1 (MQ=255) agcgatgtcagcatcatcagtcccgccagattatttacgatcatagaaccggtcattcatcatctccttactgcaaccaggtcgcggcgattacgctggaaatcagcgacatcacaatcagtacaatcaacaccaggcgcattgatCCt < 1:494876‑M1/3‑1 (MQ=255) cGGCTTCTTCAGTAAATTCCCGCTGATTGCTGCCGGTATTGCGTTGTCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTACCAGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTATAGACTGGATTATTAGCTGGTTAGGTCGCGTTGTGCCTg > 1:94953/1‑149 (MQ=255) cgatgtcagcatcatcagtcccgccagattatttacgatcatagcaccggtcagtcatcatctccttacagcaaccaggtcgcggcgattacgctggaaatcagcgacagcacaatcagtacaatcaacaccaggcgcattgatCCTgg < 1:106146‑M1/5‑1 (MQ=255) gCTTCTTCAGTAAATTCCCGCTGTTTGCTGCCGGTTTTGCGTTGTCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGc > 2:176664/1‑149 (MQ=255) atgtcagcatcatcagtcccgccagattatttacgatcatagaaccggtcattcatcatctccttactgcaaccaggtcgcggcgattacgctggaaatcagcgacatcacaatcagtacaatcaacaccaggcgcattgatCCTGGCa < 2:327730‑M1/7‑1 (MQ=255) tcagcatcatcagtcccgccagattatttacgatcatagaaccggtcattcatcatctccttactgcaaccaggtcgcggcgattacgctggaaatcagcgacatcacaatcagtacaatcaacaccaggcgcattgatCctggccgcg < 1:566733‑M1/10‑5 (MQ=255) tcAGTAAATTCCCGCTGTTTGCTGCCGGTTTTGCGTTGTCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACcg > 2:505228/1‑149 (MQ=255) gTAAATTCCCGCTGTTTGCTGCCGGTTTTGCGTTGTCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACcgagc > 2:460605/1‑149 (MQ=255) aaaTTCCCGCTGTTTGCTGCCGGTTTTGCGTTGTCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGAGTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACcgagcga < 1:1238023/149‑1 (MQ=255) aTTCCCGCTGTTTGCTGCCGGTTTTGCGTTGTCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAgg > 1:897971/1‑149 (MQ=255) tCCCGCTGTTTGCTGCCGGTTTTGCGTTGTCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGcc > 1:482117/1‑149 (MQ=255) tgtgtgCTGCCGGTTTTGCGTTGTCAGGGGAGTACTGGAGCCTGCTGCCCGCCATGATTCTACTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTAATCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGcc < 2:117269/149‑1 (MQ=255) tttGCTGCCGGTTTTGCGTTGTCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGa < 1:260566/149‑1 (MQ=255) 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aaccggtcattcatcatctccttactgcaaccaggtcgcggcgattacgctggaaatcagcgacatcataatcagtacaatcaacaccaggcgcattgatCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGAt > 2:646795‑M1/101‑149 (MQ=255) aaccggtcattcatcatctccttactgcaaccagggcgcggcgattacgctggaaatcagcgacatcataatcagtacaatcaacaccaggcgcattgatCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGAt > 2:646801‑M1/101‑149 (MQ=255) tCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATc > 2:1103478/1‑149 (MQ=255) tCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATc < 1:176664/149‑1 (MQ=255) tCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCAAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATc > 1:380017/1‑149 (MQ=255) cccggtcattcatcatctccttcctgcaaccaggtcgcggcgattacgctggaaatcagcgacatcacaatcagtacaatcaacaccaggcgcattgatCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATc > 1:1594340‑M1/100‑149 (MQ=255) cggtcattcatcatctccttactgcaaccaggtcgcggcgattacgctggaaatcagcgacatcacaatcagtacaatcaacaccaggcgcgttgtgCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCaa > 1:1225345‑M1/98‑149 (MQ=255) aGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGCTTCTTCTGATGATTGAATCGCTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCaa < 2:136502/149‑1 (MQ=255) aGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCaa > 1:1460386/1‑149 (MQ=255) ggtcattcatcatctccttactgcaaccaggtcgcggcgattacgctggaaatcagcgacatcacaatcagtacaatcaacaccaggcgcattgatCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAAt > 2:926276‑M1/97‑149 (MQ=255) 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tttATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCa < 2:1349705/149‑1 (MQ=255) tttATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCa < 2:663033/149‑1 (MQ=255) tttATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCa < 1:873027/149‑1 (MQ=255) tttATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCa < 1:817731/149‑1 (MQ=255) tCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTGATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAg < 2:426026/149‑1 (MQ=255) tGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGgaga < 1:616408/149‑1 (MQ=255) tttGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAgatga < 2:684925/149‑1 (MQ=255) ttGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAgatgat < 2:326986/149‑1 (MQ=255) gTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGTTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGatgaa < 2:482117/149‑1 (MQ=255) tCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGatgaat > 2:874677/1‑149 (MQ=255) tCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCAGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGatgaat > 1:327730/1‑149 (MQ=255) gcgTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGatgaatga > 2:1505672/1‑149 (MQ=255) gcgTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGatgaatga < 2:355650/149‑1 (MQ=255) cgTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGAc < 1:460605/149‑1 (MQ=255) cgTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAAGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGAc > 1:636148/1‑149 (MQ=255) gTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGAcc < 1:436129/149‑1 (MQ=255) tgtgCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCgg < 2:855421/149‑1 (MQ=255) | CAACGGCTTCTTCAGTAAATTCCCGCTGTTTGCTGCCGGTTTTGCGTTGTCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCGG > NC_000913/2605977‑2606269 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |