New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2606125 = | 85 (0.940) | 6 (0.070) | 5/260 | NT | 6.9% | coding (1315/1440 nt) | hyfD | hydrogenase 4, membrane subunit |
? | NC_000913 | 2606172 = | 81 (0.950) | coding (1362/1440 nt) | hyfD | hydrogenase 4, membrane subunit |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GTCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCGGTTCTATGATCGTAAATAATCTGGCGGGACTGATGATGCTGACATCGCTGT > NC_000913/2606025‑2606319 | gTCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCTCCGCTGCCAGGAt < 2:904543/149‑1 (MQ=255) gTCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGAt < 1:1062678/149‑1 (MQ=255) aaccggtcattcatcatctccttactgcaaccaggtcgcggcgattacgctggaaatcagcgacatcataatcagtacaatcaacaccaggcgcattgatCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGAt > 2:646795‑M1/101‑149 (MQ=255) aaccggtcattcatcatctccttactgcaaccagggcgcggcgattacgctggaaatcagcgacatcataatcagtacaatcaacaccaggcgcattgatCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGAt > 2:646801‑M1/101‑149 (MQ=255) tCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATc > 2:1103478/1‑149 (MQ=255) tCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATc < 1:176664/149‑1 (MQ=255) tCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCAAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATc > 1:380017/1‑149 (MQ=255) cccggtcattcatcatctccttcctgcaaccaggtcgcggcgattacgctggaaatcagcgacatcacaatcagtacaatcaacaccaggcgcattgatCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATc > 1:1594340‑M1/100‑149 (MQ=255) cggtcattcatcatctccttactgcaaccaggtcgcggcgattacgctggaaatcagcgacatcacaatcagtacaatcaacaccaggcgcgttgtgCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCaa > 1:1225345‑M1/98‑149 (MQ=255) aGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGCTTCTTCTGATGATTGAATCGCTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCaa < 2:136502/149‑1 (MQ=255) aGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCaa > 1:1460386/1‑149 (MQ=255) ggtcattcatcatctccttactgcaaccaggtcgcggcgattacgctggaaatcagcgacatcacaatcagtacaatcaacaccaggcgcattgatCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAAt > 2:926276‑M1/97‑149 (MQ=255) gTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAAt < 2:928249/149‑1 (MQ=255) 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cgagcgagGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCGGTTCTATGATCGTaa > 1:1568560/1‑149 (MQ=255) cgagcgagGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCGGTTCTATGATCGTaa > 2:871035/1‑149 (MQ=255) gagcgtgGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCGGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGATGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCGGTTCTATGATCGTaaa < 2:1017383/149‑1 (MQ=255) agGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCGGTTCTATGATCGTAAATAATc > 2:1122408/1‑149 (MQ=255) ccGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCATGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCGGTTCTATGATCGTAAATAATCTgg > 2:833002/1‑149 (MQ=255) gTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCGGTTCTATGATCGTAAATAATCTGGCg < 1:412986/149‑1 (MQ=255) gTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCGGTTCTATGATCGTAAATAATCTGGCg > 1:359174/1‑149 (MQ=255) cGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCGGTTCTATGATCGTAAATAATCTGGCggg < 2:1082361/149‑1 (MQ=255) gCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCGGTTCTATGATCGTAAATAATCTGGCGGGACtgatg < 2:579178/149‑1 (MQ=255) ccGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCGGTTCTATGATCGTAAATAATCTGGCGGGACtgatga < 1:874677/149‑1 (MQ=255) gCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCGGTTCTATGATCGTAAATAATCTGGCGGGACTGatgatg > 1:1150609/1‑149 (MQ=255) cgcggccaggATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCGGTTCTATGATCGTAAATAATCTGGCGGGACTGATGATGCTGa < 1:566733‑M2/139‑1 (MQ=255) tgccaggATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCGGTTCTATGATCGTAAATAATCTGGCGGGACTGATGATGCTGACAt < 2:327730‑M2/142‑1 (MQ=255) ccaggATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGCTGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCTGTAAGGAGATGATGACTGACCGGTGCTATGATCGTAAATAATCTGGCGGGACTGATGATGCTGACATCg < 1:106146‑M2/144‑1 (MQ=255) aggATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCGGTTCTATGATCGTAAATAATCTGGCGGGACTGATGATGCTGACATCGCt < 1:494876‑M2/146‑1 (MQ=255) aggATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCGGTTCTATGATCGTAAATAATCTGGCGGGACTGATGATGCTGACATCGCt < 1:488817‑M2/146‑1 (MQ=255) gATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCGGTTCTTTGATAGTAAATAATCTGGCGGGACTGATGATGCTGACATCGATGt > 1:1032542‑M2/2‑149 (MQ=255) | GTCAGTGGAGTACTGGATCCTGCTGCCCGCCATGATTCTTCTGATGATTGAATCGGTCGCCAGTTTCGCCTGGTTTATTCGCTGGTTTGGTCGCGTTGTGCCTGGCAAACCGAGCGAGGCCGTCGCCGATGCCGCACCGCTGCCAGGATCAATGCGCCTGGTGTTGATTGTACTGATTGTGATGTCGCTGATTTCCAGCGTAATCGCCGCGACCTGGTTGCAGTAAGGAGATGATGAATGACCGGTTCTATGATCGTAAATAATCTGGCGGGACTGATGATGCTGACATCGCTGT > NC_000913/2606025‑2606319 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |