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Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
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aaaCCTGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCt < 2:1297123/149‑1 (MQ=255) aaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCt > 2:593063/1‑149 (MQ=255) aaCATGGCCCGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCAAGCTGACCTGCTTTTTGCTTCTGGCAGTACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCtt > 1:1006881/1‑149 (MQ=255) aaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTTGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCtt < 1:771066/149‑1 (MQ=255) aaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCtt < 1:700266/149‑1 (MQ=255) aCcaggtcagcatgatcggcgcaaacagcttaccgaccatagccgtgccatgtttttgaatcataaataataaagtgagaacgataattgagaggggaactatccaggtatccagctgcggggcgacgatttccagaccttcaatggct < 1:981002‑M1/149‑148 (MQ=255) | TTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTATTTCGGTGATGTCAGCCATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTG > NC_000913/3931649‑3931940 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |