| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 3931793 | 91 (1.010) | 6 (0.070) | 6/258 | NT | 5.9% | coding (478/1869 nt) | kup | potassium transporter |
| ? | NC_000913 | = 3931842 | 104 (1.220) | coding (527/1869 nt) | kup | potassium transporter | |||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
TCAGCCATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCAT‑GCTGA‑CCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCAGTGGTGTTGTCGAT > NC_000913/3931694‑3931989 | tCAGCCATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCAT‑GCTGA‑CCTg > 2:340080/1‑149 (MQ=255) cAGCCATTGAAGGTCTTGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGATCCCCTCTCACTAAGCGTGCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCTGTACGCTGTTTGCGCCGATCAT‑GCTGA‑CCTGg > 1:253173‑M2/1‑148 (MQ=255) aGCCATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCAT‑GCTGA‑CCTGgt < 1:981002‑M2/149‑3 (MQ=255) aGCCATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCAT‑GCTGA‑CCTGgt < 2:1221062‑M2/149‑3 (MQ=255) ccATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTACCCTCTGAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCAT‑GCTGA‑CCTGgttt > 2:1360726‑M2/1‑145 (MQ=255) ccATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTACCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTAATGATTCAAAAACATGGCACTGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCAT‑GCTGC‑CCTGgatt < 2:137856‑M2/149‑5 (MQ=255) ccATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCAGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCAT‑GCTGA‑CCTGgttt > 1:1091516‑M2/1‑145 (MQ=255) aTTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCAT‑GCTGA‑CCTGgttttt > 2:686172‑M2/1‑143 (MQ=255) aTTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCAT‑GCTGA‑CCTGgttttt > 2:1219373‑M2/1‑143 (MQ=255) tGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCAT‑GCTGA‑CCTGgtttttga > 1:1220381‑M2/1‑141 (MQ=255) tGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCAT‑GCTGA‑CCTGgtttttga > 1:1154774‑M2/1‑141 (MQ=255) tGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCAT‑GCTGA‑CCTGgtttttga > 2:729172‑M2/1‑141 (MQ=255) tCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCAT‑GCTGA‑CCTGGTTTTTGATTCTgg > 2:159531/1‑149 (MQ=255) 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gcCGATCAT‑GCTGA‑CCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTACCCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAgggg > 1:111046/1‑149 (MQ=255) gcCGATCAT‑GCTGA‑CCTGGTGTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTTGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAgggg < 2:880539/149‑1 (MQ=255) ttCAT‑GCTGA‑CCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGTGGCAgt < 1:773406/148‑1 (MQ=255) aTCAT‑GCTGA‑CCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCAgt < 2:49616/149‑1 (MQ=255) aTCAT‑GCTGA‑CCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCAgt > 1:1526784/1‑149 (MQ=255) gcAT‑GCGGA‑CCTGGTTTTTGAGTCTGGCAGGACTGTGGTTACGTAGCAATATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCGGAATCCAATGAGGGCGGTGCATTTCTTCCTTCAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCAgtg < 1:255699/148‑1 (MQ=255) aT‑GCTGA‑CCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCAgtggt < 1:360915/149‑1 (MQ=255) a‑CCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCAGTGGTGTTGTc < 2:143181/149‑1 (MQ=255) ccTGgtttttgaatcataaataataaagtgagaacgataattgagaggggaactatccaggtatccagctgcggggcgacgatttccagaccttcaatggctgacatcaccgaaatagcgggtgttatgacgacttcaccatagaaaaa > 2:1531192‑M2/1‑4 (MQ=255) cTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCAGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATCTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCAGTGGTGTTGTCGa > 1:1384410/1‑149 (MQ=255) tGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCAGTGGTGTTGTCGAt > 2:315924/1‑149 (MQ=255) | TCAGCCATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCAT‑GCTGA‑CCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCAGTGGTGTTGTCGAT > NC_000913/3931694‑3931989 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |