New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | = 4042486 | 88 (1.040) | coding (72/987 nt) | srkA | Cpx stress response Thr/Ser protein kinase; MazF antagonist protein |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TTACGCGCTCGCGGCGTAATTAAAGAGTAAAAGCTTGTAAGCGGCGCCACCAAAATCATCGTGAAATGATATCCTTCGTCATTCGTAATGTTTTCCGGATGATGGGATGAATAACAGCGCTTTTACTTTCCAGACACTACACCCGGATACCATCATGGACGCTCTGTTTGAGCATGGGATCCGGGTGGATTCCGGTCTTACCCCGCTTAACAGCTATGAAAACCGTGTCTATCAATTTCAGGACGAAGATCGTCGACGTTTTGTCGTCAAATTTTATCGCCCTGAACGTTGGACA > NC_000913/4042309‑4042603 | ttACGCGCTCGCGGCGTAATTATAGAGTAAAAGCTTGTAAGCGGCGCCACCAAAATCATCGTGAAATGATATCCTTCGTCATTCGTAATGTTTTCCGGATGATGGGATGAATAACAGCGCTTTTACTTTCCAGACACTACACCCGGATa < 2:249840/149‑1 (MQ=255) tACGCGCTCGCGGCGTAATTAAAGAGTAAAAGCTTGTAAGCGGCGCCACCAAAATCATCGTGAAATGATATCCTTCGTCATTCGTAATGTTTTCCGGATGATGGGATGAATAACAGCGCTTTTACTTTCCAGACACTACACCCGGATAc < 1:1335098/149‑1 (MQ=255) aCGCGCTCGCGGCGTAATTAAAGAGTAAAAGCTTGTAAGCGGCGCCACCAAAATCATCGTGAAATGATATCCTTCGTCATTCGTAATGTTTTCCGGATGATGGGATGAATAACAGCGCTTTTACTTTCCAGACACTACACCCGGATAcc > 2:384265/1‑149 (MQ=255) 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cTACACCCGGATACCATCATGGACGCTCTGTTTGAGCATGGGATCCGGGTGGATTCCGGTCTTACCCCGCTTAACAGCTATGAAAACCGTGTCTATCATTTTCAGGACGAAGATCGTCGACGTTTTGTCGTCAAATTTTATCGCCCTGa < 2:360085/149‑1 (MQ=255) acCCGGATcccatgctcaaacagagcgtccatgatggtatccgggtgtagtgtctggaaagtaaaagcgctgttattcatcccatcatccggaaaacattacgaatgacgaaggatatcatttcacgatgattttggtggcgccgctta > 1:1130471‑M1/1‑8 (MQ=255) acCCGGATACCATCATGGACGCTCTGTTTGAGCATGGGatccgggtgtagtgtctggaaagtaaacgcgctgttattcatcccatcatccggaaaacattacgaatgacgaaggatatcatttcacgatgattttggtggcgccgctta < 2:1086148‑M2/149‑112 (MQ=255) cccGGATACCATCATGGACGCTCTGTTTGAGCATGGGATCCGGGTGGATTCCGGTCTTACCCCGCTTAACAGCTATGAAAACCGTGTCTATCAATTTCAGGACGAAGATCGTCGACGTTTTGTCGTCAAATTTTATCGCCCTGAACGtt < 1:1402057/149‑1 (MQ=255) ccGGATACCATCATGGACGCTCTGTTTGAGCATGGGATCCGGGTGGATTCCGGTCTTACCCCGCTTAACAGCTATGAAAACCGTGTCTATCAATTTCAGGACGAAGATCGTCGACGTTTTGTCGTCAAATTTTATCGCCCTGAACGTTg > 1:1032683/1‑149 (MQ=255) ccGGATACCATCATGGACGCTCTGTTTGAGCATGGGATCCGGGTGGATTCCGGTCTTACCCCGCTTAACAGCTATAAAAACCGTGTCTATCAATTTCAGGACGAAGATCGTCGACGTTTTGTCGTCAAATTTTATCGCCCTGAACGTTg < 2:729926/149‑1 (MQ=255) ggATcccatgctcaaacagagcgtccatgatggtatacgggtgtagtgtctggaaagtaaaagcgatgttattcatcccatcatccggaaaacattacgaatgacgaaggatatcatttcacgatgattttggtggcgccgcttacaac > 1:762753‑M1/1‑4 (MQ=255) ggATACCATCATGGACGCTCTGTTTGAGCATGGGATCCGGGTGGATTCCGGTCTTACCCCGCTTAACAGCTATGAAAACCGTGTCTATCAATTTCAGGACGAAGATCGTCGACGTTTTGTCGTCAAATTTTATCGCCCTGAACGTTGGa < 1:1522135/149‑1 (MQ=255) gATACCATCATGGACGCTCTGTTTGAGCATGGGatccgggtgtagtgtctggaaagtaaaagcgctgttattcatcccatcatccggaaaacattacgaatgacgaaggatatcatttcacgatgattttggtggcgccgcttacaagc < 1:148871‑M2/149‑117 (MQ=255) aTcccatgctcaaacagagcgtccatgatggtatccgggtgtagtgtctggaaagtaaaagcgctgttattcatcccatcatccggaaaacattacgaatgacgaaggatatcatttcacgatgattttggtggcgccgcttacaagct < 2:697640‑M1/149‑148 (MQ=255) aTcccatgctcaaacagagcgtccatgatggtatccgggtgtagtgtctggaaagtaaaagcgctgttattcatcccatcatccggaaaacattacgaatgacgaaggatatcatttcacgatgattttggtggcgccgcttacaagct > 2:1272535‑M1/1‑2 (MQ=255) | TTACGCGCTCGCGGCGTAATTAAAGAGTAAAAGCTTGTAAGCGGCGCCACCAAAATCATCGTGAAATGATATCCTTCGTCATTCGTAATGTTTTCCGGATGATGGGATGAATAACAGCGCTTTTACTTTCCAGACACTACACCCGGATACCATCATGGACGCTCTGTTTGAGCATGGGATCCGGGTGGATTCCGGTCTTACCCCGCTTAACAGCTATGAAAACCGTGTCTATCAATTTCAGGACGAAGATCGTCGACGTTTTGTCGTCAAATTTTATCGCCCTGAACGTTGGACA > NC_000913/4042309‑4042603 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |