New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
GTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGG > NC_000913/4344297‑4344594 | gtggtgTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAAc > 1:1995269/1‑150 (MQ=255) aaaaacagagttggtagagcaatcataataaactgcatacctaatagggcttgcgtagactgttcaacattcggtacatagccaatcatccctaacacaaccgcaatgaaaaaagccgcaaaggctgaaccgcccttcaccaccatagtc > 1:1530793‑M1/150‑150 (MQ=255) aaacagagttggtagagcaatcataataaactgcatacctaatagggcttgcgtagactgttcaacattcggtacatagccaatcatccctaacacaaccgcaatgaaaaaagccgcaaaggctgaaccgcccttcaccaccatagtCTg > 1:589785‑M1/148‑150 (MQ=255) 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ctcCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTa < 1:1487458/150‑1 (MQ=255) ctcCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGAGTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCTCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGATCATTACGGTGAATATAAACTGCACGTa > 2:51498/1‑150 (MQ=255) tcCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAAAGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTCGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTAc > 1:79375/1‑150 (MQ=255) ccTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACg > 1:51288/1‑150 (MQ=255) cTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGc < 1:2054781/150‑1 (MQ=255) 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atatCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTGCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTg < 1:1881615/150‑1 (MQ=255) tCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAAc < 1:405060/150‑1 (MQ=255) cGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACa > 2:503417/1‑150 (MQ=255) tGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCGGGGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTTGTGATGATAGGCTATGTAACGAATGTTGAACAGta > 2:1452931/1‑149 (MQ=255) tGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGTTATGTACCGAATGTTGAACAGTc < 1:946620/150‑1 (MQ=255) 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aaCTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAg > 2:1990818/1‑150 (MQ=255) aCTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAgg < 2:1995269/150‑1 (MQ=255) | GTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGG > NC_000913/4344297‑4344594 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |