New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 4344485 = | 114 (0.970) | coding (1117/1422 nt) | melB | melibiose:sodium symporter | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
CGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTT > NC_000913/4344337‑4344633 | ctaatagggcttgcgtagactgttcaacattcggtacatagccaatcatccctaacacaaccgcaatgaaaaaagccgcaaaggctgaaccgcccttcaccaccatagtCTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGAc > 2:1446206‑M1/110‑150 (MQ=255) taatagggcttgcgtagactgttcaacattcggtacatagccaatcatccctaacacaaccgcaatgaaaaaagccgcaaaggctgaaccgcccttcaccaccatagtCTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACt > 1:889874‑M1/109‑150 (MQ=255) cgtcCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTAt > 1:260539/1‑150 (MQ=255) tcCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTAtgg < 1:929412/150‑1 (MQ=255) cATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATATACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTAGTCCGTGCAGACTAtggtggg > 2:421454/1‑149 (MQ=255) aTTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGgtggtg < 1:1922441/150‑1 (MQ=255) aTTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGgtggtg > 1:396985/1‑150 (MQ=255) gtgATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGTCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAg < 1:710823/150‑1 (MQ=255) 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ttACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTAcc < 2:260539/150‑1 (MQ=255) ttACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTAcc < 1:1235236/150‑1 (MQ=255) tACTCCGTGCAGACTATGGTCGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCa > 1:490085/1‑150 (MQ=255) cTCCGTGCAGACTTTGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTGTTTTCAGTGCGGTTGTGGTAGGGTTGATTGGCTATGTACAGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCGCTTTTAGGTTTGCTGTTTATTATGTTTGCTCTACAAAc > 2:349044/1‑150 (MQ=255) cTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAAc > 1:1560/1‑150 (MQ=255) tCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAAct < 2:192243/150‑1 (MQ=255) ccGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAActc > 2:219081/1‑150 (MQ=255) cgtgcagACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAActct < 1:463982‑M2/143‑1 (MQ=255) tgcagACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGt < 1:964488‑M2/145‑1 (MQ=255) tgcagACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCATTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTTTTAGGGATGATTGGCTATGTTCCGAATTTTGAACAGTCTACGAAAGCCCTATTAGTTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGt > 1:1571142‑M2/6‑150 (MQ=255) cagACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGttt > 1:589785‑M2/4‑150 (MQ=255) agACTATTGTGGTGAAGGGCGGTTCTGCGTTTGCGGGTTTTTTCCTTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATTTTGAACAGTGTACGCAAGCCCTATTAGGTTTGGAGTTTATTATGATTGCTCTACCTACTCTGtttt < 1:871850‑M2/148‑1 (MQ=255) | CGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTT > NC_000913/4344337‑4344633 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |