New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 618054 = | 114 (1.020) | 7 (0.070) | 5/252 | NT | 6.4% | intergenic (+16/‑200) | entF/fepE | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent/regulator of length of O‑antigen component of lipopolysaccharide chains |
? | NC_000913 | 618087 = | 103 (1.010) | intergenic (+49/‑167) | entF/fepE | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent/regulator of length of O‑antigen component of lipopolysaccharide chains |
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
GTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCTTCGGATAATTATCACCAACTGGTAAAGT > NC_000913/617905‑618203 | gTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTTTCTCTGCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTtata > 2:1321604/1‑150 (MQ=255) gTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTtata < 1:1773220/150‑1 (MQ=255) agtccaatagggggaaatctccacggcgctcactttaccagttggtgataattatccgaagctgaagtttgtaaattccttccactgaatgcaccattcactctatttaagagaaatattcttcaaacctataaatcaaacaaataaaaa < 2:380474‑M1/2‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |