New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 2805836 = | 122 (1.090) | 7 (0.070) | 5/266 | NT | 5.9% | coding (1022/1203 nt) | proV | glycine betaine/proline ABC transporter periplasmic binding protein |
? | NC_000913 | 2805856 = | 107 (1.000) | coding (1042/1203 nt) | proV | glycine betaine/proline ABC transporter periplasmic binding protein |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
CCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGC > NC_000913/2805687‑2805984 | cccTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATgc > 2:140722/1‑150 (MQ=255) cccctcacgatctaaagcgcgcagcagcattcctttcgaaatgatgccgacatactgttggtcctcgtcgaccacgggcaccgcacagggtgcctgtccgacatgagagagcaactcgctaagaggcgtttgtgcatcgactgctaaCgg < 1:1451088‑M1/3‑1 (MQ=255) ccctcacgatctaaagcgcgcagcagcattcctttcgaaatgatgccgacatactgttggtcctcgtcgaccacgggcaccgcacagggtgcctgtccgacatgagagagcaactcgctaagaggcgtttgtgcatcgactgctaaCGgc < 1:101297‑M1/4‑1 (MQ=255) ccctcacgatctaaagcgcgcagcagcattcctttcgaaatgatgccgacatactgttggtcctcgtcgaccacgggcaccgcacagggtgcctgtccgacatgagagagcaactcgctaagaggcgtttgtgcatcgactgctaaCGgc < 1:878558‑M1/4‑1 (MQ=255) cctcacgatctaaagcgcgcagcagcattcctttcgaaatgatgccgacatactgttggtcctcgtcgaccacgggcaccgcacagggtgcctgtccgacatgagagagcaactcgctaagaggcgtttgtgcatcgactgctaaCGgcg < 1:964837‑M1/5‑1 (MQ=255) cctcacgatctaaagcgcgcagcagcattcctttcgaaatgatgccgacatactgttggtcctcgtcgaccacgggcaccgcacagggtgcctgtccgacatgagagagcaacgcgctaagaggcgtttggacatcgactgctaaCGgcg < 2:716687‑M1/5‑1 (MQ=255) cTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACTTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCt < 2:108263/150‑1 (MQ=255) cTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCt > 1:734323/1‑150 (MQ=255) cGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCtgat > 1:192821/1‑150 (MQ=255) ggCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGAGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCtgatt > 2:14705/1‑150 (MQ=255) ccACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCtgattgat > 2:816912/1‑150 (MQ=255) cGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTATTAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATgcg < 1:1336207/150‑1 (MQ=255) gTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATgcgc > 1:1875259/1‑150 (MQ=255) ttCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGGCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTAAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGcc < 1:952927/150‑1 (MQ=255) cgcagcagcattcctttcgaaatgatgccgacatactgttggtcctcgtcgaccacgggcaccgcacagggtgcctgtccgacatgagagagcaactcgctaagaggcgtttgtgcatcgactgctaaCGGCGCTGATTGATGCGCCGtt > 1:26273‑M1/129‑150 (MQ=255) gCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTa > 1:1325511/1‑150 (MQ=255) cACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAg > 1:572163/1‑150 (MQ=255) cACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAg < 2:1602834/150‑1 (MQ=255) 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aCCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTc > 1:1128592/1‑150 (MQ=255) ccGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCACTCATGTCGGACAGGCACACTGTGAGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGAATGTCg > 2:161354/1‑150 (MQ=255) cgcgTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCgg < 1:853266/150‑1 (MQ=255) cgcgTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCgg < 2:1853983/150‑1 (MQ=255) gcgTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGc > 1:996769/1‑150 (MQ=255) gcgTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGc < 2:1325511/150‑1 (MQ=255) gcgTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGc < 1:772984/150‑1 (MQ=255) gcgTTAACGCAGCAGAAAGGTCTTGATGCGGCGGTGTTTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACTGGCACCCTGTTCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAAGAGTATGTCGGc < 2:421497/150‑1 (MQ=255) aaCGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGcatcat < 1:1764367/150‑1 (MQ=255) cGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCAttt > 2:915890/1‑150 (MQ=255) cGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGGATGTCGGCATCAttt > 1:436659/1‑150 (MQ=255) cGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCATGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCAttt > 1:655599/1‑150 (MQ=255) gcagcagcaAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTc < 1:1771067/150‑1 (MQ=255) cagcagcaAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCg < 1:22487/150‑1 (MQ=255) gcaAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTGGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGCCAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCNannnn < 2:116697/150‑5 (MQ=255) aGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAAt > 2:983282/1‑150 (MQ=255) ggTCATGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCCATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTGGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGGGCCCGGGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAAtg < 2:275655/150‑1 (MQ=255) gTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCCCCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAAtgc > 1:875533/1‑150 (MQ=255) gcTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAAtgct < 2:1770748/149‑1 (MQ=255) tGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTgcg > 1:74624/1‑150 (MQ=255) tGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTgcg > 1:688993/1‑150 (MQ=255) | CCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGC > NC_000913/2805687‑2805984 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |