| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2805836 = | 122 (1.090) | 7 (0.070) | 5/266 | NT | 5.9% | coding (1022/1203 nt) | proV | glycine betaine/proline ABC transporter periplasmic binding protein |
| ? | NC_000913 | 2805856 = | 107 (1.000) | coding (1042/1203 nt) | proV | glycine betaine/proline ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
GGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGG > NC_000913/2805708‑2806002 | cgcagcagcattcctttcgaaatgatgccgacatactgttggtcctcgtcgaccacgggcaccgcacagggtgcctgtccgacatgagagagcaactcgctaagaggcgtttgtgcatcgactgctaaCGGCGCTGATTGATGCGCCGtt > 1:26273‑M1/129‑150 (MQ=255) gCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTa > 1:1325511/1‑150 (MQ=255) cACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAg < 2:1602834/150‑1 (MQ=255) agaagcattcctttcgaaatgaggccgacatactgttggtcctcgtcgaccacgggcaccgcacagggtgcctgtccgacatgagagagcaactcgctaagaggcgtttgtgcatcgactgctaaCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGc > 1:1857607‑M1/126‑150 (MQ=255) aCTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGGTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGc < 1:436255/150‑1 (MQ=255) tGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCTAACGCGGTAATAAGATTGTCGGATCAGTCTCAATAGATTCGCTAAAAACCACGTTAACGCATCAGAAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAg > 1:1206239/1‑150 (MQ=255) tGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGTCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCAGTTAGCAg > 2:1270757/1‑150 (MQ=255) aaTTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCg > 2:696315/1‑150 (MQ=255) ttattGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGAt > 2:878558/1‑150 (MQ=255) attGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATTCGCCGTTAGCAGTCGATGc > 2:1277977/1‑150 (MQ=255) gCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGcaca > 1:1456080/1‑150 (MQ=255) gCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGcaca > 1:403194/1‑150 (MQ=255) cAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACaa > 2:242819/1‑150 (MQ=255) 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GCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCttt > 2:1294573‑M1/1‑150 (MQ=255) CTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCTACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTa > 2:464763‑M1/1‑150 (MQ=255) tgattgttGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACCCCTCTTATCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGGGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAg < 2:1784977/150‑1 (MQ=255) gattgatGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGa > 1:1635182/1‑150 (MQ=255) attgatGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGTACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGCCGAGGACCACCAGTATGTCGGCATCTTTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGAt > 1:55854/1‑150 (MQ=255) ttgatGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACCGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATc > 2:1099118/1‑150 (MQ=255) ttgatGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGCCCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCTCTTTAGAtg > 2:151557/1‑149 (MQ=255) tgatGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCTAGTTGCTCTATCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCTACGTGGACCAACAGTATGTCGGCATGATTTCGAATGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCg < 2:75856/150‑1 (MQ=255) tgatGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCg < 1:1316213/150‑1 (MQ=255) gatGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGt > 1:1225651/1‑150 (MQ=255) gatGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGt > 1:59980/1‑150 (MQ=255) cgccgTTAGCAGTCGATGTCCAAACGCCTCTTAGCGCGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAgg < 2:716687‑M2/145‑1 (MQ=255) cgccgTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAgg < 1:964837‑M2/145‑1 (MQ=255) gccgTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAggg < 1:101297‑M2/146‑1 (MQ=255) ccgTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAgggg < 1:1451088‑M2/147‑1 (MQ=255) | GGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGG > NC_000913/2805708‑2806002 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |