| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4381930 = | 226 (1.300) | 3 (0.020) | 3/262 | NT | 1.5% | coding (389/1809 nt) | frdA | anaerobic fumarate reductase catalytic and NAD/flavoprotein subunit |
| ? | NC_000913 | 4381970 = | 192 (1.170) | coding (349/1809 nt) | frdA | anaerobic fumarate reductase catalytic and NAD/flavoprotein subunit | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
CCTTCCATCATGTTCATTGCTACCAGGCCGCGAACATGACCATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCC > NC_000913/4381783‑4382079 | gcTTCCATCATGTTCATTGCTACCAGGCCGCGAACATGACCATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTATTATcg < 2:1681715/149‑1 (MQ=255)ccTTCCATCATGTTCATTGCTACCAGGCCGCGAACATGACCATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATcg < 1:2923481/150‑1 (MQ=255) cgatacagtagcgggtggcgactggttgtgtgagcaggatgtcgtggattatttcgtccaccactgcccaaccgaaatgacccaactggaactgtggggatgcccatggagccgtcgcccggatggtagcgtcaacgtacgtcgctTcgg > 1:2907809‑M1/147‑150 (MQ=255) cgatacagtagcgggtggcgactggttgtgtgagcaggatgtcgtggattatttcgtccaccactgcccaaccgaaatgacccaactggaactgtggggatgcccatggagccgtcgcccggatggtagcgtcaacgtacgtcgctTcgg > 2:2034969‑M1/147‑150 (MQ=255) cgatacagtagcgggtggcgactggttgtgtgagcaggatgtcgtggattatttcgtccaccactgcccaaccgaaatgacccaactggaactgtggggatgcccatggagccgtcgcccggatggtagcgtcaacgtacgtcgctTcgg > 1:2024489‑M1/147‑150 (MQ=255) cgatacagtagcgggtggcgactggttgtgtgagcaggatgtcgtggattatttcgtccaccactgcccaaccgaaatgacccaactggaactgtggggatgcccatggagccgtcgcccggatggtagcgtcaacgtacgtcgctTcgg > 1:887409‑M1/147‑150 (MQ=255) cgatacagtagcgggtggcgactgggtgtgtgagcaggctgtcgtggattatttcgtccaccactgcccacccgaaatgacccaactggaactgtggggatgcccatggagccgtcgcccggatggtagcgtcaacgtacgtcgctTcgg > 1:2216450‑M1/147‑150 (MQ=255) cTTCCATCATGTTCATTGCTACCAGGCCGCGAACATGACCATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATcgg < 1:572012/150‑1 (MQ=255) tCCATCATGTTCATTGCTACCAGGCCGCGAACATGACCATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATcggcg < 1:1270991/150‑1 (MQ=255) ccATCATGTTCATTGCTACCAGGCCGCGAACATGACCATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATcggcgg < 2:565892/150‑1 (MQ=255) ccATCATGTTCATTGCTACCAGGCCGCGAACATGACCATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATcggcgg < 1:620007/150‑1 (MQ=255) ccATCATGTTCATTGCTACCAGGCCGCGAACATGACCATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATcggcgg < 1:896844/150‑1 (MQ=255) acagtagcgggtggcgactggttgtgtgagcaggatgtcgtggattatttcgtccaccactgcccaaccgaaatgacccaactggaactgtggggatgcccatggagccgtcgcccggatggtagcgtcaacgtacgtcgctTCggcggc > 2:2653392‑M1/143‑150 (MQ=255) tcatGTTCATTGCTACCAGGCCGCGAACATGACCATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGa < 2:231440/150‑1 (MQ=255) tGCTACCAGGCCGCGAACATGACCATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTgcg > 1:2880204/1‑150 (MQ=255) cTACCAGGCCGCGAACATGACCATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCt > 1:2823493/1‑150 (MQ=255) cTACCAGGCCGCGAACATGACCATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCt > 1:1460547/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCGCGAACATGACCATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGa < 2:105061/150‑1 (MQ=255) 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cATGACCATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATgccgc < 2:722779/150‑1 (MQ=255) cATGACCATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATgccgc < 1:1914794/150‑1 (MQ=255) aTGACCATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATgccgcc > 2:1622237/1‑150 (MQ=255) aTGACCATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATgccgcc > 1:2345361/1‑150 (MQ=255) ggatgtcgtggattatttcgtccaccactgcccaaccgaaatgacccaactggaactgtggggatgcccatggagccgtcgcccggatggtagcgtcaacgtacgtcgctTCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGa > 1:2393067‑M1/111‑150 (MQ=255) ccATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAg < 1:2371278/150‑1 (MQ=255) catcatCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGATGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTATTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGc < 1:988492/150‑1 (MQ=255) catcatCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGc < 1:550696/150‑1 (MQ=255) tcatcaACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGa < 2:1283946/150‑1 (MQ=255) catcaACCAGAATATCCCGCACGAAATGTTCGTCAAACCGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGac < 2:2592535/150‑1 (MQ=255) catcaACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGac < 2:2929197/150‑1 (MQ=255) atcaACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTACTCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGacg > 2:2745860/1‑150 (MQ=255) cAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGtt > 2:1400986/1‑150 (MQ=255) gAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGa > 2:212543/1‑150 (MQ=255) gAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGa < 2:1778156/150‑1 (MQ=255) 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gagagGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACCTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTggg > 1:2300807/1‑150 (MQ=255) tCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCAttt > 2:1809402/1‑150 (MQ=255) tCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCAttt > 1:2753176/1‑150 (MQ=255) tCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCAttt > 1:452840/1‑150 (MQ=255) tCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCAttt > 1:225315/1‑150 (MQ=255) cTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTc < 2:1138242/150‑1 (MQ=255) tGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCg > 2:1818854/1‑150 (MQ=255) tGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCg > 2:884591/1‑150 (MQ=255) gAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGTACCTGGTGCGCTCTATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTAAGTTGACGCTACCATCCGGGCGTCGGCTCCATGGGCTTCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGt < 1:1670929/150‑1 (MQ=255) gAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGt < 2:1489929/150‑1 (MQ=255) aaCAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGtt > 2:2597651/1‑150 (MQ=255) cgCGTGTGCAGCAGATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTggn < 1:1579242/149‑2 (MQ=255) tgtgCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAgt > 2:2157481/1‑150 (MQ=255) gtgCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAgtg < 1:1535878/150‑1 (MQ=255) gcagcaTATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAgtggt < 1:168288/150‑1 (MQ=255) gcagcaTATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCGACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAgtggt < 1:697494/150‑1 (MQ=255) cagcaTATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAgtggtg > 1:1631774/1‑150 (MQ=255) ggAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAaat > 1:1873759/1‑150 (MQ=255) gAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAacta > 2:416471/1‑150 (MQ=255) gAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAaata > 2:2478715/1‑150 (MQ=255) aGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAaataat > 1:1883104/1‑150 (MQ=255) ccGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATcc > 1:1058044/1‑150 (MQ=255) cGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCa > 2:905450/1‑150 (MQ=255) tCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGa > 2:772599/1‑150 (MQ=255) tATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACAt > 2:1990389/1‑150 (MQ=255) aTCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATc < 1:953689/150‑1 (MQ=255) aTCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATc > 1:426560/1‑150 (MQ=255) | CCTTCCATCATGTTCATTGCTACCAGGCCGCGAACATGACCATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCC > NC_000913/4381783‑4382079 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |