New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 4381930 = | 226 (1.300) | 3 (0.020) | 3/262 | NT | 1.5% | coding (389/1809 nt) | frdA | anaerobic fumarate reductase catalytic and NAD/flavoprotein subunit |
? | NC_000913 | 4381970 = | 192 (1.170) | coding (349/1809 nt) | frdA | anaerobic fumarate reductase catalytic and NAD/flavoprotein subunit | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
ACCATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCAGTCGCCACCCGCTACTGTATCGTGA > NC_000913/4381821‑4382118 | ccATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAg > 1:592243/1‑150 (MQ=255) ccATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAg < 1:2371278/150‑1 (MQ=255) catcatCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGATGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTATTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGc < 1:988492/150‑1 (MQ=255) catcatCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGc > 2:2684682/1‑150 (MQ=255) catcatCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGc < 1:550696/150‑1 (MQ=255) tcatcaACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGa < 2:1283946/150‑1 (MQ=255) catcaACCAGAATATCCCGCACGAAATGTTCGTCAAACCGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGac < 2:2592535/150‑1 (MQ=255) catcaACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGac < 2:2929197/150‑1 (MQ=255) atcaACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGacg < 1:2352084/150‑1 (MQ=255) gAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGa > 2:2406258/1‑150 (MQ=255) gAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGa < 2:2061154/150‑1 (MQ=255) aaTATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGAc < 1:311599/150‑1 (MQ=255) aaTATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGAc < 1:17281/150‑1 (MQ=255) tatCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGc > 2:2154650/1‑150 (MQ=255) tatCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGc > 1:845813/1‑150 (MQ=255) ccAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTAc < 2:648104/150‑1 (MQ=255) cAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTAcc > 1:1090584/1‑150 (MQ=255) aaaTGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCggg > 2:2814462/1‑150 (MQ=255) aaaTGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCggg < 1:862687/150‑1 (MQ=255) aaaTGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCggg < 1:1971653/150‑1 (MQ=255) ttCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGGACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACg > 1:325816/1‑150 (MQ=255) cGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGc < 2:2517676/150‑1 (MQ=255) gTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCt > 2:2277602/1‑150 (MQ=255) 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gCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGc > 1:2392845/1‑150 (MQ=255) gCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGc < 1:2244663/150‑1 (MQ=255) cTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCa > 2:1604388/1‑150 (MQ=255) cTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCa > 2:476911/1‑150 (MQ=255) tGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCAt < 1:829148/150‑1 (MQ=255) tGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCAt > 2:2583766/1‑150 (MQ=255) gATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATcc < 1:257429/150‑1 (MQ=255) aTCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATccc < 1:1869254/150‑1 (MQ=255) gCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCcaca < 1:1400986/150‑1 (MQ=255) gCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTGGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCcaca < 2:1875681/150‑1 (MQ=255) 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GGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTg > 1:2408490‑M1/1‑150 (MQ=255) GCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGc > 1:1157149‑M1/1‑150 (MQ=255) GCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTca > 2:1408270‑M1/1‑150 (MQ=255) gatcctggTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGTCGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTcaca < 2:2186099/144‑1 (MQ=255) aGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAAcc < 1:1589365/150‑1 (MQ=255) aGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTT‑GGCAGTGGTGGACGAAATAATACACGACATCCAGCTCACACAAccc > 1:1009619/1‑149 (MQ=255) ggTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCa > 2:2557366/1‑150 (MQ=255) ggTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCa < 2:1072969/150‑1 (MQ=255) atcgagcgcacctggttcgccgccgaAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCa > 2:2222003‑M2/27‑150 (MQ=255) tGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCAGt > 1:1052819/1‑150 (MQ=255) tGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCAGt > 1:1927812/1‑150 (MQ=255) tGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTAGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCAGt > 2:1954819/1‑150 (MQ=255) gcgcTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCAGTc < 1:1599544/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCAGTc < 1:492712/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCAGTc < 1:1209945/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCAGTc < 1:1790893/150‑1 (MQ=255) gcTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCAGTCGc < 2:426540/150‑1 (MQ=255) gcTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCAGTCGc < 2:1719931/150‑1 (MQ=255) tCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCAGTCGCCa > 2:2109536/1‑150 (MQ=255) gATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCAGTCGCCAcc > 1:1311564/1‑150 (MQ=255) tttCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCAGTCGCCACCCGc > 1:1340330/1‑150 (MQ=255) gccgaAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCAGTCGCCACCCGCTACTGTATc > 2:518878‑M2/6‑150 (MQ=255) ccgaAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCAGTCGCCACCCGCTACTGTATCg > 1:1139472‑M2/5‑150 (MQ=255) ccgaAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCAGTCGCCACCCGCTACTGTATCg > 1:717676‑M2/5‑150 (MQ=255) ccgaAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCGCACACAACCAGTCGCCACCCGCTACTGTATCg > 1:2024484‑M2/5‑150 (MQ=255) aAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCAGTCGCCACCCGCTACTGTCTCGTGa > 2:1621719‑M2/2‑150 (MQ=255) aAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCAGTCGCCACCCGCTACTGTATCGTGa > 1:1503152‑M2/2‑150 (MQ=255) | ACCATCATCAACCAGAATATCCAGCACGAAATGTTCGTCAAAACGCTGGATCTGCGGGAATTGCAGAGAGGTCTGGAACAGCGTGTGCAGCATATGGAAGCCGGTCTTATCGGCGGCGAACCAGGTGCGCTCGATTTTCATGCCGCCGAAGCGACGTACGTTGACGCTACCATCCGGGCGACGGCTCCATGGGCATCCCCACAGTTCCAGTTGGGTCATTTCGGTTGGGCAGTGGTGGACGAAATAATCCACGACATCCTGCTCACACAACCAGTCGCCACCCGCTACTGTATCGTGA > NC_000913/4381821‑4382118 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |