Predicted mutation | |||||||
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JC | NC_000913 | 2,357,874 | Δ12 bp | 9.7% | pseudogene (71‑82/198 nt) | ypaA → | pseudogene, C‑terminal fragment, Transposase_31 family |
New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 2357886 = | 75 (0.580) | pseudogene (83/198 nt) | ypaA | pseudogene, C‑terminal fragment, Transposase_31 family |
TGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTGACCAGGTGCTCGCGGCCACCCAGCTAAGCGAAGCCGATCTGGCAGCGAATAACCACTAATTAACACAGGCCCACAGCCGA > NC_000913/2357724‑2358022 | tGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAAAGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTa > 2:1835807/1‑150 (MQ=255) tGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGAAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAATTTGGCTGGCAGGAAGGTa > 1:1124409/1‑150 (MQ=255) ggAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAAtt < 2:2192745/150‑1 (MQ=255) gCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCACCTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTACAGACTATTGCTGAACGGTTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGa > 1:52956/1‑150 (MQ=255) gCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGtt > 1:1764737/1‑150 (MQ=255) gTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAAAGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAAc > 2:1243814/1‑150 (MQ=255) tGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGATCTGTCAGTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACa > 1:1169480/1‑150 (MQ=255) gaTTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGc > 2:176783/1‑150 (MQ=255) gaTTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGc > 2:558207/1‑150 (MQ=255) gtgCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGCCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCAtt > 1:1939730/1‑150 (MQ=255) tGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTaaaa > 1:24671/1‑150 (MQ=255) gCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCATATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTATAATTTTTTCATGAACAAGACATTTAAAtt > 1:1045577/1‑150 (MQ=25) cGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTg > 2:1840815/1‑150 (MQ=255) gACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGc > 1:1326500/1‑150 (MQ=255) aCCCAACTCACTGATTCTGATATACCGAACTGTCAATAAAAGGAGAGATTAAACACTATAGATGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCTGTAAGGTAAATTAGATGGTTTGGATGAACAAGACATTATAATTGATTTg > 2:1403211/1‑150 (MQ=255) cccATCTCACTGATTCTGATATTCCTAAATGTCAAAAAAAGGATAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGTCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTgc < 1:747223/150‑1 (MQ=25) cccAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTgc > 2:552186/1‑150 (MQ=255) ccAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTgcg > 1:1486963/1‑150 (MQ=255) 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aaaGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGATGCGGCAGGAAGGACATAAAATTGGCTGGAAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTCCATTAACAATCCATTAAAATTGCTTTGCGAATGCTGGAAAAGGGATTTAATCGTGAACATCTGCt > 2:400075/1‑150 (MQ=21) aaGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGACCAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGATGGAACTGGGGTTGGATCGTGCCCAGTTGATc > 1:822304/1‑150 (MQ=25) aGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTGACCAGGTGCTcg > 1:664088/1‑150 (MQ=255) aGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTGACCAGGTGCTcg > 1:1588971/1‑150 (MQ=255) agagaTTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCa > 2:2036229/1‑82 (MQ=255) agagaTTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCa < 1:2036229/82‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |