| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2190617 = | 97 (0.980) | 5 (0.050) | 3/260 | NT | 5.1% | coding (294/2481 nt) | yehB | putative outer membrane protein |
| ? | NC_000913 | 2190656 = | 95 (1.030) | coding (255/2481 nt) | yehB | putative outer membrane protein | |||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
TCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATT > NC_000913/2190468‑2190766 | tgaaagaccagcaggttgcaaatattcgtcttgatgataatcaacccttaccggggcagtatgacatcgatatttatgtcaataagcaatggcgcgggaaatatgagattattgttaaagacaacccgcaagaaacatgtttatcaagag > 1:1345017‑M1/150‑150 (MQ=255) gaaagaccagcaggttgcaaatattcgtcttgatgataatcaacccttaccggggcagtatgacatcgatatttatgtcaataagcaatggcgcgggaaatatgagattattgttaaagacaacccgcaagaaacatgtttatcaagaga < 1:1030012‑M1/2‑1 (MQ=255) gaaagaccagcaggttgcaaatattcgtcttgatgataatcaacccttaccggggcagtatgacatcgatatttatgtcaataagcaatggcgcgggaaatatgagattattgttaaagacaacccgcaagaaacatgtttatcaagaga > 2:924235‑M1/149‑150 (MQ=255) ccAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGATCTTCCACCCAGGCCAGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAACCCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAAAATGGCTGACCGCTGGCGaa > 1:931238/1‑150 (MQ=255) aaGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAg < 1:526765/149‑1 (MQ=255) accagcaggttgcaaatattcgtcttgatgataatcaacccttaccggggcagtatgacatcgatatttatgtcaataagcaatggcgcgggaaatatgagattattgttaaagacaacccgcaagaaacatgtttatcaagaGAAGTTa < 1:879180‑M1/7‑1 (MQ=255) tttCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTAt < 2:187227/150‑1 (MQ=255) aagcaggttgcaaatattcgtcttgatgataatcaacccttaccggtgcagtatgacatcgatatttatgtcaataagcaatggcgcgggaaatatgagtttattgttaaagacaacccgcaagaaacatgtttatcaagaGAAGTTATc > 2:1052694‑M1/142‑150 (MQ=255) gAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTaa > 1:1693244/1‑150 (MQ=255) ttttcgaCTTTCGAGTTCTTACACCCTGGCCTTCGGGATACGGAAATCGATACGAAATTCCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCTCCCTGAACAATTTGCTCAAATGTTAAACATTGGTTACGGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGcc < 2:1128818/144‑1 (MQ=255) gCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTaa > 1:307228/1‑150 (MQ=255) tttCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCt < 2:233971/150‑1 (MQ=255) tCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTg > 1:1648631/1‑150 (MQ=255) 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tAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATa < 2:1087045/150‑1 (MQ=255) aaaCATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATAc < 2:1536891/150‑1 (MQ=255) aaaCATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCGATTAATGCATAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATAc < 2:1061173/150‑1 (MQ=255) aCATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATCGATATTTATGTCaataag < 2:1531002/150‑6 (MQ=255) cATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATCGATATTTATGTCaataagc < 1:1589365/150‑7 (MQ=255) cATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGc > 2:1429218/1‑150 (MQ=255) gCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCg > 2:1295700/1‑150 (MQ=255) ttACCGCTTGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGt < 1:838894/150‑1 (MQ=255) taacgttGGCGAATTTATCTCTATTAATTCCTATCCTCTTGATAACTTCTCTTGATAAATATGTTTCTTTATTGTTGTATTTAAGAATAATCTCTTTTTTCTCTCGCCATTGCTTATTGACATAATTATCGATGTCATACTGCTCCGGTa < 1:460193/144‑1 (MQ=255) tACCGCTGGCGAAGGTATCGCTATTTAAGCCTAACCGCTTGATAAATTCTCATGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGGCATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTa < 2:319945/150‑1 (MQ=255) 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cGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGAt > 1:792776/1‑150 (MQ=255) cGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGAt > 1:976674/1‑150 (MQ=255) | TCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATT > NC_000913/2190468‑2190766 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |