| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2190617 = | 97 (0.980) | 5 (0.050) | 3/260 | NT | 5.1% | coding (294/2481 nt) | yehB | putative outer membrane protein |
| ? | NC_000913 | 2190656 = | 95 (1.030) | coding (255/2481 nt) | yehB | putative outer membrane protein | |||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
TCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCAT > NC_000913/2190507‑2190805 | tcCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTtct > 1:849552/1‑150 (MQ=255)cccACCCAGGCCCGCGGGACACTGAACTCGAGACCAACCTCCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATCTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCAATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTtct < 2:1622789/149‑1 (MQ=255)atcaacccttaccggggcagtatgacatcgatatttatgtcaataagcaatggcgcgggaaatatgagattattgttaaagacaacccgcaagaaacatgtttatcaagaGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTtct > 2:1030012‑M1/111‑150 (MQ=255) cACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTctct < 2:1482894/150‑1 (MQ=255) cACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTctct > 1:1176324/1‑150 (MQ=255) aacccttacctgggcagtatgacatcgatatttatgtcaataagcaatggcgcgggaaatatgagattattgttaaagacaacccgcaagaaacatgtttatcaagaGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCtt > 1:1421200‑M1/108‑150 (MQ=255) cAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGAt < 1:1341768/150‑1 (MQ=255) cAGCCCTGCGCGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCGGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGTAGTTATCGCTATTAAAGCCTAACCGCTAGATAACTTCTCTTGAt > 2:461196/1‑150 (MQ=255) aGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATa < 2:811374/150‑1 (MQ=255) aGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATa < 1:1119500/150‑1 (MQ=255) aGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATa < 2:1308766/150‑1 (MQ=255) cTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCCCCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACa > 2:1129536/1‑150 (MQ=255) ggggcagtatgacatcgatatttatgtcaataagcaatggcgcgggaaatatgagattattgttaaagacaacccgcaagaaacatgtttatcaagaGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATg > 1:1552069‑M1/98‑150 (MQ=255) 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tcTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTc > 2:924235‑M2/3‑150 (MQ=255) cTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCa > 1:1345017‑M2/2‑150 (MQ=255) | TCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCAT > NC_000913/2190507‑2190805 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |