| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 329836 | 87 (0.880) | 6 (0.060) | 6/270 | NT | 6.8% | coding (374/2034 nt) | betT | choline transporter of high affinity |
| ? | NC_000913 | = 329872 | 80 (0.830) | coding (410/2034 nt) | betT | choline transporter of high affinity | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGT‑CAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTA > NC_000913/329723‑330021 | cAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGT‑Ca > 2:531900/1‑150 (MQ=255)cAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGT‑Ca < 2:1594547/150‑1 (MQ=255)cAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGT‑Ca > 1:512455/1‑150 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ccGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGT‑CAggcg < 1:144227‑M2/150‑5 (MQ=255) ggAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGT‑CAGGCGAt > 2:1403557/1‑150 (MQ=255) aagtccgCCTGCTGAGTTGGGCGGCGAGGCTGCTTGCTGCCGGGATCGGTCGCGACCTGAGGTTCTTCTCCGTCGCCGACCCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGT‑CAGGCGATgg < 1:284711/144‑1 (MQ=255) ttCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGT‑CAGGCGATGGTc < 2:236507/150‑1 (MQ=255) tCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGT‑CAGGCGATGGTCt < 1:1203823/150‑1 (MQ=255) 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ctgcCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGT‑CAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGt > 2:1500149/1‑150 (MQ=255) tgcCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGT‑CAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTc < 1:462721/150‑1 (MQ=255) gcCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGT‑CAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCg < 2:229612/150‑1 (MQ=255) gcCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGT‑CAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCg > 1:826203/1‑150 (MQ=255) gcCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTGCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGT‑CAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCg < 1:235715/150‑1 (MQ=255) 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2:469739‑M2/95‑61 (MQ=255) aaGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCCTTCCggcggctgcatatactgcgttaccggttcggctacggagaagaacatcaggtcgataccg > 1:469739‑M2/1‑35 (MQ=255) ggCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGT‑CAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCg < 2:784764/150‑1 (MQ=255) ggACAGACGATTGAGGCCGCGCGT‑CAGGCTATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGATGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTCTCTATCGTTATAATATGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTg > 2:1056228/1‑150 (MQ=255) ggACAGACGATTGAGGCCGCGCGT‑CAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCGGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTg < 1:76990/150‑1 (MQ=255) gACAGACGATTGAGGCCGCGCGT‑CAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGt > 1:1577747/1‑150 (MQ=255) cGATTGAGGCCGCGCGT‑CAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGa > 1:1370368/1‑150 (MQ=255) gATTGAGGCCGCGCGT‑CAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGAt < 1:520100/150‑1 (MQ=255) gAGGCCGCGCGT‑CAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTc < 2:411345/150‑1 (MQ=255) aGGCCGCGCGT‑CAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCTATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCg < 2:822598/150‑1 (MQ=255) ggCCGCGCGT‑CAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCgg < 1:1109023/150‑1 (MQ=255) cgcgcgT‑CAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTaa > 1:169444/1‑150 (MQ=255) t‑CAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGAt < 2:1577747/150‑1 (MQ=255) cAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCAGATCTTCGGTAAACGGAtt > 1:595571/1‑150 (MQ=255) cAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGCCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGAtt > 2:1129251/1‑150 (MQ=255) aGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTa < 2:512455/150‑1 (MQ=255) | CAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGT‑CAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTA > NC_000913/329723‑330021 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |