| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 4545995 | 103 (1.040) | 6 (0.060) | 5/260 | NT | 5.6% | coding (900/2637 nt) | fimD | fimbrial usher outer membrane porin protein; FimCD chaperone‑usher |
| ? | NC_000913 | = 4546071 | 107 (1.160) | coding (976/2637 nt) | fimD | fimbrial usher outer membrane porin protein; FimCD chaperone‑usher | |||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
TTAACTTTCGCGGCGCACAATTGGCCTCAGATGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCCACCGGGGCCTTTTACCATCAACGATATCTATGCCGCAGGTAATAGTGGTGACTTGCAGGTAACGATCAAAGAGGCTGACGGCAGCACGCAGATTTTTACCGTACCCTATTCGTCAGTCCCGCTTTTGCAACGTGAAGGGCATACTCGT > NC_000913/4545922‑4546220 | tttaCTTTCGCGGCGCACAATTGGCCTCAGATGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGc < 2:1354918/147‑1 (MQ=255)ttAACTTTCGCGGCGCACAATTGGCCTCAGATGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGc < 2:731699/150‑1 (MQ=255) tAACTTTCGCGGCGCACAATTGGCCTCAGATGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCc < 2:825756‑M2/150‑2 (MQ=255) aaCTTTCGCGGCGCACAATTGGCCTCAGATGACAATATGATACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCca > 1:357924‑M2/1‑148 (MQ=255) cTTTCGCGGCGCACAATTGGCCTCAGATGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCcacc < 1:908357‑M2/150‑5 (MQ=255) cTTTCGCGGCGCACAATTGGCCTCAGATGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCcacc < 1:1259121‑M2/150‑5 (MQ=255) tCGCGGCGCACAATTGGCCTCAGATGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCcaccggg > 2:1150253‑M2/1‑143 (MQ=255) tCGCGGCGCACAATTGGCCTCAGATGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCcaccggg > 2:1303426‑M2/1‑143 (MQ=255) cagaaTTGGCCTCAGATGACAATATGTTACCGGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCGGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCAACCGGTGCCTTTTa < 2:1237800/147‑1 (MQ=255) cacaATTGGCCTCAGATGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCGCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCCACCGGGGCCTTTTa < 2:1011692/150‑1 (MQ=255) cacaATTGGCCTCAGATGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTG‑CCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCCACCGGGGCCTTTTAc < 2:1532182/150‑1 (MQ=255) acaATTGGCCTCAGATGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTTCCACCGGGGCCTTTTAc < 2:1668121/150‑1 (MQ=255) caATTGGCCTCAGATGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCCACCGGGGCCTTTTAcc > 1:802628/1‑150 (MQ=255) ttGGCCTCAGATGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCCACCGGGGCCTTTTACCATc > 1:1225575/1‑150 (MQ=255) gCCTCAGATGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTAGTTGTACTGCTCAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCCTCCGGGGCCTTTTACCATCAAc < 1:105291/150‑1 (MQ=255) ccTCAGATGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCCACCGGGGCCTTTTACCATCAACg > 1:375430/1‑150 (MQ=255) ccTCAGATGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCCACCGGGGCCTTTTACCATCAACg > 2:233867/1‑150 (MQ=255) ccTCAGATGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCCACCGGGGCCTTTTACCATCAACg > 1:838681/1‑150 (MQ=255) 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gATGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCCACCGGGGCCTTTTACCATCAACGATATc < 2:1259121/150‑1 (MQ=255) gATGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGGGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCCACCGGGGCCTTTTACCATCAACGATATc < 1:912322/150‑1 (MQ=255) tGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGCTTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAACTGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCCACCGGGGCCTTTTACCATCAACGATATCTa < 2:1034402/150‑1 (MQ=255) tGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGACACCGGGGCCTTTTACCATCAACGATAGCTa > 2:712196/1‑150 (MQ=255) tGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGGCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCCACCGGGGCCTTTTACCATCAACGATATCTa > 2:718440/1‑150 (MQ=255) cAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCCACCGGGGCCTTTTACCATCAACGATATCTATGc < 2:963099/150‑1 (MQ=255) aaTATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCCACCGGGGCCTTTTACCATCAACGATATCTATGcc < 1:177358/150‑1 (MQ=255) tGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGTTCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCCACCGGGGCCTTTTACCATCAACGATATCTATGCCGCAg < 1:306973/150‑1 (MQ=255) ttACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCCACCGGGGCCTTTTACCATCAACGATATCTATGCCGCAGGt < 2:802628/150‑1 (MQ=255) cccGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCCACCGGGGCCTTTTACCATCAACGATATCTATGCCGCAGGTAAt > 1:445953/1‑150 (MQ=255) 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ccACCGGGGCCTTTTACCATCAACGATATCTATGCCGCAGGTAATAGTGGTGACTTGCAGGTAACGATCAAAGAGGCTGACGGCAGCACGCAGATTTTTACCGTACCCTATTCGTCAGTCCCGCTTTTGCAACGTGAAGGGCATACTCGt > 2:279465/1‑150 (MQ=255) | TTAACTTTCGCGGCGCACAATTGGCCTCAGATGACAATATGTTACCCGATAGTCAAAGAGGATTTGCCCCGGTGATCCACGGTATTGCTCGTGGTACTGCACAGGTCACTATTAAACAAAATGGGTATGACATTTATAATAGTACGGTGCCACCGGGGCCTTTTACCATCAACGATATCTATGCCGCAGGTAATAGTGGTGACTTGCAGGTAACGATCAAAGAGGCTGACGGCAGCACGCAGATTTTTACCGTACCCTATTCGTCAGTCCCGCTTTTGCAACGTGAAGGGCATACTCGT > NC_000913/4545922‑4546220 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |