New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | = 3737320 | 73 (1.020) | intergenic (‑143/‑177) | bax/malS | putative glucosaminidase/alpha‑amylase |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
TATCGTCGTATGGGAGTCAAAATCATCAGGTCTCCTGGTCGGATTTAATCATTCCAACACCTTATATTTTTCACAAATTTGAGAGTTGAATCTCAAATCATATCAAAAATAGCTGTCAAGAGCACCCCAAGGAATAGTCCAAATCTGAAACTATGTCACGTGTTAACGATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGTTTTGTTTGGCTT > NC_000913/3737152‑3737449 | tatCGTCGTATGGGAGTCAAAATAATCAGGTCTCCTGGTCGGATTTAATCATTCCAACACCTTATATTTTTCACAAATTTGAGAGTTGAATCTCAAATAATATCAAAAATAGCTGTCAAGAGCACCCCAAGGAATAGTCCAAATCTGaaa > 1:510036/1‑150 (MQ=255) atCGTCGTATGGGAGTCAAAATCATCAGGTCTCCTGGTCGGATTTAATCATTCCAACACCTTATATTTTTCACAAATTTGAGAGTTGAATCTCAAATCATATCAAAAATAGCTGTCAAGAGCACCCCAAGGAATAGTCCAAATCTGAAAc < 2:389834/150‑1 (MQ=255) atCGTCGTATGGGAGTCAAAATCATCAGGTCTCCTGGTCGGATTTAATCATTCCAACACCTTATATTTTTCACAAATTTGAGAGTTGAATCTCAAATCATATCAAAAATAGCTGTCAAGAGCACCCCAAGGAATAGTCCAAATCTGAAAc < 1:803910/150‑1 (MQ=255) 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tCCAAATCTGAAACTATGTCACGTGTTAACGAttcagatttggactattccttggggtgctcttgacagctatttttgatatgatttgagattcaactctcaaatttgtgaaaaatataaggtgttggaatgattaaatccgaccaggag < 1:696008‑M2/150‑119 (MQ=255) ccAAATCTGAAACTATGTCACGTGTTAACAATTCAGATTGTCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCCCCCTTGCTTCTCATCCTGTGGCCTTACCGCTCAGGGATGAGttt > 2:87235/1‑150 (MQ=255) ccAAATCTGAAACTATGTCACGTGTGAACGATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCATAATTCCGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCAGCCTGTGGCGTGACCGCTCAGGGATGAGttt > 2:519108/1‑150 (MQ=255) cAAATCTGAAACTATGTCACGTGTTAACGAttcagatttggactattccttggggtgctcttgacagctatttttgatatgatttgagattcaactctcaaatttgtgaaaaatataaggtgttggaatgattaaatccgcccaggagac < 2:356327‑M2/150‑121 (MQ=255) cAAATCTGAAACTATGTCACGTGTTAACGATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGtttt > 1:1047708/1‑150 (MQ=255) aaaTCTGAAACTATGTCACGTGTTAACGATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGtttag > 1:13826/1‑148 (MQ=255) aaaTCTGAAACTATGTCACGTGTTAACGATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGTtttg > 1:344197/1‑150 (MQ=255) aaTCTGAAtcgttaacacgtgacatattttcagattttgactattccttggggtgctcttgacagctatttttgatatgatttgagattcaactctcaaatttgtgaaaaatataaggtgttggaatgattaaatccgaccaggagacct < 1:536929‑M1/150‑143 (MQ=255) aTCTGAAtcgttaacacgtgacatagtttcagatttggactattccttggggtgctcttgacagctatttttgatatgatttgagattcaactctcaaatttgtgataaatataaggtgttggaatgattaaatccgaccaggagccctg > 2:246434‑M1/1‑7 (MQ=255) tCTGAAtcgttaacacgtgacatagtttcagatttggactattccttggggtgctcttgacagctatttttgatatgatttgagattcaactctcaaatttgtgaaaaatataaggtgttggaatgattaaatccgaccaggagacctga > 2:1165934‑M1/1‑6 (MQ=255) tCTGAAACTATGTCACGTGTTAACGATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGTtttgttt < 1:498285/150‑1 (MQ=255) cTGAAACTATGTCACGTGTTAACGATTCATATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGTTTATCTCAAAATTCAGCCGTATTTTGCGCGAGATCGCTAACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGTtttgtttg > 2:1012271/1‑150 (MQ=255) gAAACTATGTCACGTGTTAACGATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGTTTTGTTTGGc < 1:406622/150‑1 (MQ=255) aaaCTATGTCACGTGTTAACGATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGTTTTGTTTGGCt < 1:887579/150‑1 (MQ=255) aaaCTATGTCACGTGTTAACGATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCGCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGTTTTGTTTGGCt < 1:846974/150‑1 (MQ=255) atcgttaacacgtgacatagattcagatttggactattccttggggtgctcttgacagctatttttgatatgatttgagattaaaatctcaaatttgtgaaaaatataaggtgttggaatgattaaatccgaccaggagaactgatcatt > 1:402221‑M1/1‑1 (MQ=255) atcgttaacacgtgaaatagtttcagatttggactattccttggggtgctcttgacagctatttttgatatgatttgagattcaactctcaaatttgtgaaaaatataaggtgttggaatgattaaatccgaccaggagccctgatgatt > 2:718966‑M1/1‑1 (MQ=255) | TATCGTCGTATGGGAGTCAAAATCATCAGGTCTCCTGGTCGGATTTAATCATTCCAACACCTTATATTTTTCACAAATTTGAGAGTTGAATCTCAAATCATATCAAAAATAGCTGTCAAGAGCACCCCAAGGAATAGTCCAAATCTGAAACTATGTCACGTGTTAACGATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGTTTTGTTTGGCTT > NC_000913/3737152‑3737449 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |