New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3737300 | 79 (1.040) | 4 (0.060) | 3/262 | NT | 5.1% | intergenic (‑123/‑197) | bax/malS | putative glucosaminidase/alpha‑amylase |
? | NC_000913 | = 3737320 | 73 (1.020) | intergenic (‑143/‑177) | bax/malS | putative glucosaminidase/alpha‑amylase |
AAATCATCAGGTCTCCTGGTCGGATTTAATCATTCCAACACCTTATATTTTTCACAAATTTGAGAGTTGAATCTCAAATCATATCAAAAATAGCTGTCAAGAGCACCCCAAGGAATAGTCCAAATCTGAAACTATGTCACGTGTTAACGATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGTTTTGTTTGGCTTATCGCTGGCAAACTGTCTG > NC_000913/3737171‑3737468 | aaaTCATCAGGTGTCCTGGTCGGATTTAATCATTCCAACACCTTATATTTTTCACAAATTTGAGAGTTGAATCTCAAATCATATCAAAAATAGCTGTCAAGAGCACCCCAAGGAATAGTCCAAATCTGAAACTATGTCACGTGTTAACGa < 1:71624/150‑1 (MQ=255) aaTGATCAGTTCTCCTGGTCGGATTTAATCATTCCAACACCTTATATTTTTCACAAATTTGAGATTTTAATCTCAAATCATATCAAAAATAGCTGTCAAGAGCACCCCAAGGAATAGTCCAAATCTGAATCTATGTCACGTGTTAACGAt > 1:402221‑M2/1‑149 (MQ=255) aaTCATCAGGGCTCCTGGTCGGATTTAATCATTCCAACACCTTATATTTTTCACAAATTTGAGAGTTGAATCTCAAATCATATCAAAAATAGCTGTCAAGAGCACCCCAAGGAATAGTCCAAATCTGAAACTATTTCACGTGTTAACGAt > 2:718966‑M2/1‑149 (MQ=255) tcaGGTCTCCTGGTCGGATTTAATCATTCCAACACCTTATATTTTTCACAAATTTGAGAGTTGAATCTCAAATCATATCAAAAATAGCTGTCAAGAGCACCCCAAGGAATAGTCCAAATCTGAAACTATGTCACGTGTTAACGAttcaga > 2:1165934‑M2/1‑144 (MQ=255) caGGGCTCCTGGTCGGATTTAATCATTCCAACACCTTATATTTATCACAAATTTGAGAGTTGAATCTCAAATCATATCAAAAATAGCTGTCAAGAGCACCCCAAGGAATAGTCCAAATCTGAAACTATGTCACGTGTTAACGAttcagat > 2:246434‑M2/1‑143 (MQ=255) aGGTCTCCTGGTCGGATTTAATCATTCCAACACCTTATATTTTTCACAAATTTGAGAGTTGAATCTCAAATCATATCAAAAATAGCTGTCAAGAGCACCCCAAGGAATAGTCAAAATCTGAAAATATGTCACGTGTTAACGAttcagatt < 1:536929‑M2/150‑9 (MQ=255) ggTCTCCTGGTCGGATTTAATCATTCCAACACCTTATATTTTTCACAAATTTGAGAGTTGAATCTCAAATCATATCAAAAATAGCTGTCAAGAGCACCCCAAGGAATAGTCCAAATCTGAAACTATGTCACGTGTTAACGATTCAGATTg < 2:1130226/150‑1 (MQ=255) ggTCTCCTGGTCGGATTTAATCATTCCAACACCTTATATTTTTCACAAATTTGAGAGTTGAATCTCAAATCATATCAAAAATAGCTGTCAAGAGCACCCCAAGGAATAGTCCAAATCTGAAACTATGTCACGTGTTAACGATTCAGATTg > 1:778391/1‑150 (MQ=255) 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aaaCTATGTCACGTGTTAACGATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGTTTTGTTTGGCt < 1:887579/150‑1 (MQ=255) aaaCTATGTCACGTGTTAACGATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCGCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGTTTTGTTTGGCt < 1:846974/150‑1 (MQ=255) aTGTCACGGGTTAACGATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAAAGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGTTTTGTTTGGCTTATCg < 2:417272/150‑1 (MQ=255) tGTCACGTGTTAACGATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGTTTTGTTTGGCTTATCGc > 2:1202177/1‑150 (MQ=255) gTCACGAGTTAAAGATTCAGAATGGCGCTTAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCTATTTTAGCGCGAGATCGCTCACACTTGCTTCTCATCATGTGGACTAACCGCTCAGGGATGAGAGTTGTTTGGCTGATCgat > 1:227203/1‑148 (MQ=255) tCACGTGTTAACGATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGTTTTGTTTGGCTTATCGCTg > 2:322387/1‑150 (MQ=255) tCACGTGTTAACGATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGTTTTGTTTGGCTTATCGCTg < 2:510036/150‑1 (MQ=255) gtgtTAACGATTCTGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGTGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGTTTTGTTTGGCTTATCGCTGGCaa < 2:85380/150‑1 (MQ=255) gtTATCGATTCAGAGTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGGGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCATCCTGAGGACTTCCCGCGCAGGGATGAGTTTTGTTTGGCTTATCGCTGGCAAAc < 1:65664/150‑1 (MQ=255) aaCGATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGTTTTGTTTGGCTTATCGCTGGCAAACTGt > 2:12607/1‑150 (MQ=255) gATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGTGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGTTTTGTTTGGCTTATCGCTGGCAAACTGTCTg > 2:372319/1‑150 (MQ=255) gATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGTTTTGTTTGGCTTATCGCTGGCAAACTGTCTg < 1:955821/150‑1 (MQ=255) | AAATCATCAGGTCTCCTGGTCGGATTTAATCATTCCAACACCTTATATTTTTCACAAATTTGAGAGTTGAATCTCAAATCATATCAAAAATAGCTGTCAAGAGCACCCCAAGGAATAGTCCAAATCTGAAACTATGTCACGTGTTAACGATTCAGATTGGCGCTAAATCGCAGAAAATGTGGGGGTTATCGCAAAATTCAGCCGTTTTTTGCGCGAGATCGCTCACCCTTGCTTCTCATCCTGTGGACTTACCGCTCAGGGATGAGTTTTGTTTGGCTTATCGCTGGCAAACTGTCTG > NC_000913/3737171‑3737468 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |