| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3798221 = | 174 (2.330) | 13 (0.190) | 11/268 | 3.7 | 7.7% | intergenic (+14/+18) | waaL/waaU | O‑antigen ligase/lipopolysaccharide core biosynthesis |
| ? | NC_000913 | 3798249 = | 151 (2.220) | coding (1064/1074 nt) | waaU | lipopolysaccharide core biosynthesis | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
TTGATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGATTTATGATGATTCGGGGACCAAATTAAATG > NC_000913/3798073‑3798367 | atatTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTaat > 1:348281/1‑148 (MQ=255) atatTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTaag < 2:824425/149‑1 (MQ=255) atTATCGCTTGGCATTGTGGTTTTTGTACTCATTGATTTGATCATATGGGAACGCATCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACTATAAAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTaagaa < 1:478230/149‑1 (MQ=255) ttAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTaagaag > 1:443377/1‑149 (MQ=255) tAACGATTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGt < 2:291820/149‑1 (MQ=255) tAAAGCTTGTCTTTGTTGGGATTGGAATTTGTGATGTGATAATAAGGTAAAGCATCATTCAAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGt < 1:220970/149‑1 (MQ=255) aCGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGa < 1:941498/149‑1 (MQ=255) aCGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGa < 1:321013/149‑1 (MQ=255) cGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAg > 2:59867/1‑149 (MQ=255) cTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGtt < 2:401129/149‑1 (MQ=255) gCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTaaaa < 2:332135/149‑1 (MQ=255) aTTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGt < 1:1026062/142‑1 (MQ=255) aTTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACt > 2:524324/1‑149 (MQ=255) aTTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATAATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCTTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACt < 2:593312/149‑1 (MQ=255) tgtgGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCa < 2:623542/149‑1 (MQ=255) tgtgGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCa < 2:330963/149‑1 (MQ=255) tgGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCAct < 1:1061594/149‑1 (MQ=255) aTTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTa < 2:654828/149‑1 (MQ=255) ttGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCC‑CTATAGTCCTCTTACTCTTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATc < 2:1186589/149‑1 (MQ=255) tGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTaaa < 2:739443/149‑3 (MQ=255) gACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCta > 1:722084/1‑149 (MQ=255) gACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCta < 2:774185/149‑1 (MQ=255) cTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCtata > 1:528787/1‑149 (MQ=255) cTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCtata > 1:396662/1‑149 (MQ=255) tCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACTATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATAc > 1:304787/1‑149 (MQ=255) tCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATAc > 2:577011/1‑149 (MQ=255) aGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAAATAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACaa > 1:831558/1‑149 (MQ=255) gtgatgtgatCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTaaacttgt < 2:627577/146‑8 (MQ=255) gtgatgtgatCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTaaacttgt > 1:544793/1‑139 (MQ=255) tgatgtgatCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCtata > 2:1051138/1‑144 (MQ=255) atgtgatCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTa > 2:694427/1‑149 (MQ=255) atgtgatCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTa > 2:10188/1‑149 (MQ=255) tgtgatCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTaa < 1:577011/149‑1 (MQ=255) tgatCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑ta > 1:1185971/1‑148 (MQ=255) cttatGTGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTTAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCtt < 1:230132/147‑1 (MQ=255) tatGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTTAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTa > 2:117138/1‑149 (MQ=255) tatGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTaaac < 1:991153/130‑4 (MQ=255) tatGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAAGTGACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTa > 2:592535/1‑149 (MQ=255) gCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCTTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGaa < 1:1079441/149‑1 (MQ=255) gCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGaa < 1:288581/149‑1 (MQ=255) gCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTATTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGaa < 1:780798/149‑1 (MQ=255) cGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTa < 2:1222942/149‑1 (MQ=255) cagcaTTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGt < 2:980435/149‑1 (MQ=255) agcaTTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGtt > 1:169412/1‑149 (MQ=255) aTTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTaaa > 1:407458/1‑149 (MQ=255) aTTCCAATTATCATTATATCAGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTaaa < 1:647961/149‑1 (MQ=255) ttCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAg > 1:339245/1‑149 (MQ=255) ttCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAg > 1:710444/1‑149 (MQ=255) cAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTTGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGttt < 1:932116/149‑1 (MQ=255) aTTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCg > 2:1067603/1‑149 (MQ=255) tatCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGatat > 2:321920/1‑149 (MQ=255) atCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATc < 2:919443/149‑1 (MQ=255) atCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATc > 2:345532/1‑149 (MQ=255) tCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCt > 1:752348/1‑149 (MQ=255) tCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAAATTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATAGATATCt > 1:68989/1‑149 (MQ=255) ccGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCtt > 1:1038916/1‑149 (MQ=255) cGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCttt > 2:839766/1‑149 (MQ=255) gCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCtttt > 2:532046/1‑149 (MQ=255) cTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTa > 2:687294/1‑149 (MQ=255) atataGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTa < 1:113097/148‑1 (MQ=255) tataGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTAc < 1:4869/149‑1 (MQ=255) gTCCTCTTACTCTTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATATACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGta < 2:221668/149‑1 (MQ=255) ccTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGtata < 2:289472/149‑1 (MQ=255) tctTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAACTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATg < 1:156878/149‑1 (MQ=255) ctTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAACCTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGt > 2:794289/1‑149 (MQ=255) ctTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGt > 1:24128/1‑149 (MQ=255) ttACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTAATGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACATTATATGtt > 1:1214028/1‑149 (MQ=255) tACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTg < 2:443377/149‑1 (MQ=255) aCTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTgg < 1:524324/149‑1 (MQ=255) cTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTggg > 2:1112330/1‑149 (MQ=255) cTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTACACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTggg < 1:597505/149‑1 (MQ=255) tCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATa > 1:843448/1‑149 (MQ=255) aTTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCATTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATAca > 1:129704/1‑148 (MQ=255) ttAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTa > 2:602291/1‑149 (MQ=255) taataaTCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTAt < 1:1157669/149‑1 (MQ=255) taataaTCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTAt < 2:169412/149‑1 (MQ=255) aataatCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTAtt > 1:279558/1‑149 (MQ=255) aataatCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTAtt > 2:1146885/1‑149 (MQ=255) ataatCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTAttt < 2:722084/149‑1 (MQ=255) taatCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTg > 1:663372/1‑149 (MQ=255) tCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGtat < 1:883730/149‑1 (MQ=255) tAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGa < 1:59867/149‑1 (MQ=255) aaCAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGAt > 2:36055/1‑149 (MQ=255) acaatacaatTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGa > 2:809555/1‑149 (MQ=255) aatacaatTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGATTTa < 1:776465/149‑1 (MQ=255) aatacaatTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGATTTa > 2:704159/1‑149 (MQ=255) atacaatTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGATTTat > 1:1079481/1‑149 (MQ=255) attaattaAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGATTTAtgatga > 1:1173354/1‑149 (MQ=255) ttaattaaGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGATTTATgatgat > 2:878559/1‑149 (MQ=255) ttaaGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGATTTATGATGATTCgg < 2:407458/149‑1 (MQ=255) aaGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGATTTATGATGATTCgggg > 2:668749/1‑149 (MQ=255) gAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGATTTATGATGATTCGGGGAc > 2:849/1‑149 (MQ=255) aaaCAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGATTTATGATGATTCGGGGACCaaa < 2:752348/149‑1 (MQ=255) aaCAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGATTTATGATGATTCGGGTACCAAAt < 2:560819/149‑1 (MQ=255) aCAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGATTTATGATGATTCGGGGACCAAAtt > 1:1028718/1‑149 (MQ=255) tagatAAGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGATTTATGATGATTCGGGGACCAAATTaaa > 2:786349/5‑149 (MQ=255) aGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGATTTATGATGATTCGGGGACCAAATTaaa < 2:528787/149‑1 (MQ=255) gTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGATTTATGATGATTCGGGGACCAAATTAAAt > 2:1111989/1‑149 (MQ=255) gTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGATTTATGATGATTCGGGGACCAAATTAAAt > 2:1025739/1‑149 (MQ=255) tttAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGATTTATGATGATTCGGGGACCAAATTAAATg < 2:304787/149‑1 (MQ=255) | TTGATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAA‑‑TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGATTTATGATGATTCGGGGACCAAATTAAATG > NC_000913/3798073‑3798367 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |