New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3252015 = | NA (NA) | 12 (0.030) | 8/260 | NT | NA | intergenic (+5/‑289) | yqjG/yhaH | putative S‑transferase/DUF805 family inner membrane protein |
? | NC_000913 | 3252035 = | NA (NA) | intergenic (+25/‑269) | yqjG/yhaH | putative S‑transferase/DUF805 family inner membrane protein |
Only 100 of 472 total aligned reads displayed.
GGGGATCGCCGAAACAGTCAATTTCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGA > NC_000913/3251866‑3252164 | ggggATCGCCGAAACAGTCAATTTCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTaaaaaaa > 2:6631399/1‑150 (MQ=255) ggggATCGCCGAAACAGTCAATTTCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTaaaaaaa < 2:3184538/150‑1 (MQ=255) ggggATCGCCGAAACAGTCAATTTCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTaaaaaaa < 1:1530377/150‑1 (MQ=255) ggggATCGCCGAAACAGTCAATTTCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTaaaaaaa < 2:2833960/150‑1 (MQ=255) actgatgacaagcgcaaaatcgccagatgcgctacgcttatctggtctgcgcgggttatgcaatctattgaatgtacaatgttttgtatgtcagataaggcgttcatgccacatccgacatgaacaacatgcacttagctaattatcaga > 1:3243686‑M1/150‑150 (MQ=255) actgatgacaagcgcaaaatcgccagatgcgctacgcttatctggtctgcgcgggttatgcaatctattgaatgtacaatgttttgtatgtcagataaggcgttcatgccacatccgacatgaacaacatgcacttagctaattatcaga > 2:787080‑M1/150‑150 (MQ=255) gggATCGCCGAAACAGTCAATTTCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAg < 2:1933334/150‑1 (MQ=255) gggATCGCCGAAACAGTCAATTTCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAg < 2:2424983/150‑1 (MQ=255) tgatgacaagcgcaaaatcgccagatgcgctacgcttatctggtctgcgcgggttatgcaatctattgaatgtacaatgttttgtatgtcagataaggcgttcatgccacatccgacatgaacaacatgcacttagctaattatcagAgg < 2:1578040‑M1/3‑1 (MQ=255) tgatgacaagcgcaaaatcgccagatgcgctacgcttatctggtctgcgcgggttatgcaatctattgaatgtacaatgttttgtatgtcagataaggcgttcatgccacatccgacatgaacaacatgcacttagctaattatcagAgg > 2:6440331‑M1/148‑150 (MQ=255) gatgacaagcgcaaaatcgccagatgcgctacgcttatctggtctgcgcgggttatgcaatctattgaatgtacaatgttttgtatgtcagataaggcgttcatgccacatccgacatgaacaacatgcacttagctaattatcagAGGc < 2:1138004‑M1/4‑1 (MQ=255) atgacaagcgcaaaatcgccagatgcgctacgcttatctggtctgcgcgggttatgcaatctattgaatgtacaatgttttgtatgtcagataaggcgttcatgccacatccgacatgaacaacatgcacttagctaattatcagAGGCa < 2:3047446‑M1/5‑1 (MQ=255) tCGCCGAAACAGTCAATTTCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCAc < 1:2563928/150‑1 (MQ=255) acaagcgcaaaatcgccagatgcgctacgcttatctggtctgcgcgggttatgcaatctattgaatgtacaatgttttgtatgtcagataaggcgttcatgccacatccgacatgaacaacatgcacttagctaattatcagAGGCACCt < 2:1029139‑M1/8‑1 (MQ=255) acaagcgcaaaatcgccagatgcgctacgcttagctggtctgcgcgggttatgcaatctattgaatgtacaatgttttgtatgtcagataaggcgttcatgccacatccgacatgaacaacatgcacttagctaattatcagAGGCACCt < 2:4399924‑M1/8‑1 (MQ=255) aGTCAATTTCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGt < 2:5306899/150‑1 (MQ=255) tcgccagatgcgcttcgcttatctggtctgcgcgggttatgcaatctattgaatgtacaatgttttgtatgtcagataaggcgttcatgccacatccgacatgaacaacatgcacttagctaattatcagAGGCACCTTACGAGGTGCct > 2:2296182‑M1/131‑150 (MQ=255) aTTTCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCctc < 1:2943038/150‑1 (MQ=255) tttCGATCATCTCCTTAATCATTACTTCCGCAGCCATCAGACCATCAACCCTACGGGGTTTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCcttt < 1:3947549/150‑3 (MQ=255) ttCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTg > 2:4782605/1‑150 (MQ=255) ttCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTCGTAAGGTGCctttt < 1:2365271/150‑4 (MQ=255) cGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGAt < 2:3097149/150‑1 (MQ=255) gATCATTTCCGTAATATTTACTTCCGCAGACATAAGTCCTTCAACCCTACGGGGTTTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCTATTAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAATAAAAGGCACCTTACGATGTGCCTCTGATa < 1:2996930/150‑1 (MQ=255) tCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAAt < 1:2245166/150‑1 (MQ=255) cATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAAtt < 1:6160415/150‑1 (MQ=255) cATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAAtt < 1:3605854/150‑1 (MQ=255) cATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAAtt < 1:5482760/150‑1 (MQ=255) atatCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTa < 1:5538510/150‑1 (MQ=255) atatCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTa < 1:4610480/150‑1 (MQ=255) tatCCGTAATCATTACGTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTATAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAg < 1:1702744/150‑1 (MQ=255) tCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCt > 2:1685934/1‑150 (MQ=255) tCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCa < 2:872708/150‑1 (MQ=255) tCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCa < 1:2466804/150‑1 (MQ=255) aTTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATACTTAGCTAAGAGCAtg > 2:3885317/1‑150 (MQ=255) aTTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCAtg > 2:4644663/1‑150 (MQ=255) ttACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCAtgt > 1:3097445/1‑150 (MQ=255) tACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCAtgtt < 1:5653444/150‑1 (MQ=255) attCCGCAGCCATAAGACCATAAAACCTACGTGGATTATTTCATTTGGTCCGTGGCAGGATCTATATGAACAGCATTGACGAGATGTTCGCTTCGGTTATAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCAtgttgt < 2:1059573/149‑1 (MQ=255) 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cccTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGc < 2:5247966/150‑1 (MQ=255) gATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGACGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGa < 1:5755043/150‑1 (MQ=255) ttattTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACa > 1:2073281/1‑150 (MQ=255) tattTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTAGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACAt > 2:4139420/1‑150 (MQ=255) tttCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATAc < 1:1098568/150‑1 (MQ=255) 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ttCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTa > 2:6273392/1‑150 (MQ=255) ttCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTa > 1:644632/1‑150 (MQ=255) gTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAgcgc > 2:1487409/1‑150 (MQ=255) gTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAgcgc > 1:4213886/1‑150 (MQ=255) aaaaGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTgg < 1:1685934/150‑1 (MQ=255) 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AGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGa > 2:3765534‑M1/1‑150 (MQ=255) | GGGGATCGCCGAAACAGTCAATTTCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGA > NC_000913/3251866‑3252164 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |