New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3252015 = | NA (NA) | 12 (0.030) | 8/260 | NT | NA | intergenic (+5/‑289) | yqjG/yhaH | putative S‑transferase/DUF805 family inner membrane protein |
? | NC_000913 | 3252035 = | NA (NA) | intergenic (+25/‑269) | yqjG/yhaH | putative S‑transferase/DUF805 family inner membrane protein |
Only 100 of 446 total aligned reads displayed.
ATTTCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTC > NC_000913/3251886‑3252184 | ttCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTg > 2:4782605/1‑150 (MQ=255) tCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGa < 2:5953941/150‑1 (MQ=255) gATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATa > 1:3184386/1‑150 (MQ=255) cATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAAtt < 1:3605854/150‑1 (MQ=255) atatCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTa < 1:6125262/150‑1 (MQ=255) atatCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTa < 1:4610480/150‑1 (MQ=255) tCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCt > 2:1685934/1‑150 (MQ=255) tCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCa < 2:872708/150‑1 (MQ=255) tCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCa < 1:2466804/150‑1 (MQ=255) cATTACTTCCGCAGCCATGAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTCAGTGCAt > 1:5608887/1‑150 (MQ=255) cATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCAt > 1:5943580/1‑150 (MQ=255) aTTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATACTTAGCTAAGAGCAtg > 2:3885317/1‑150 (MQ=255) aTTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCAtg > 2:1440096/1‑150 (MQ=255) 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aaGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGAtgt > 1:1922232/1‑150 (MQ=255) gACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTgg > 2:552909/1‑150 (MQ=255) aCCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTTAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGc < 2:6674842/150‑1 (MQ=255) ccATCAACCCTCCGGGGAGTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTGACGAGGTGCCTCTGATACTTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCa < 2:3088190/150‑1 (MQ=255) cATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCAt > 2:3158616/1‑150 (MQ=255) cAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGaa < 1:5349148/150‑1 (MQ=255) aaCCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAAc > 1:1570375/1‑150 (MQ=255) aaCCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAAc < 1:5517535/150‑1 (MQ=255) aaCCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAAc < 2:5018647/150‑1 (MQ=255) aCCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACg > 2:734756/1‑150 (MQ=255) 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TTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCAtctggtct < 2:5869831‑M1/143‑4 (MQ=255) aCGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCt < 2:2317650/150‑1 (MQ=255) gAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCAGCTGGCGATTTTGCGCTTg > 2:1809428/1‑150 (MQ=255) aggtgcctCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGCTAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGt < 2:4399924‑M2/142‑1 (MQ=255) aggtgcctCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGt < 2:1029139‑M2/142‑1 (MQ=255) 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tCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGt > 2:787080‑M2/2‑150 (MQ=255) | ATTTCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTC > NC_000913/3251886‑3252184 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |