New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 3267361 = | 96 (1.220) | 5 (0.070) | 3/258 | NT | 5.3% | intergenic (‑296/‑19) | tdcA/tdcR | tdc operon transcriptional activator/L‑threonine dehydratase operon activator protein |
? | NC_000913 | 3267401 = | 91 (1.240) | coding (22/219 nt) | tdcR | L‑threonine dehydratase operon activator protein |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
ATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCGTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCATTTTCAGTGATAAATAATGCGGCATGTCACATTTTTTCACGCTATTTGTTGGAGAACAAACATTTATTTTATCAATATTTTAAAATTTCGAATA > NC_000913/3267216‑3267509 | ttacgttaatcaatttttcgagattatcaaaaaatttatattaaattttaaaatattgataaaataaatttttgttctccaaaaaatagcgtgaaaaaatgtgacatgccgcattatttatcactgaaaatggtttatttataatAAAAt > 1:234028‑M1/146‑150 (MQ=255) taAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAAAATCATTCGTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAAtt > 1:1313993/1‑150 (MQ=255) ttaatcaattgttcgagatgatcaatacatgtattcgaaattttaaaatattgataaaataaatgtttgttctccaacaaatagcgtgaaaaaatgtgacatgccgcattatttatcactgaatatggtttttttataatAATATTTGAg < 2:170070‑M1/10‑1 (MQ=255) 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cATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCGTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAAt < 1:729694/150‑1 (MQ=255) aaaCCCTAATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGCCGATAACATATTTCGTTAGGTGGAAAAAAATAAAAAGGTGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGAGAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTa > 2:228289/1‑150 (MQ=255) aaCCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCGTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTaa > 1:1322427/1‑150 (MQ=255) cccTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCGTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATg < 2:893536/150‑1 (MQ=255) cccTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCGTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATg < 2:503066/150‑1 (MQ=255) 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aaatattgataaaataaatgtttgttctccaacaaatagcgtgaaaaaatgtgacatgccgcattatttatcactgaaaatggtttatttataatAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCa > 1:1094774‑M1/96‑150 (MQ=255) ttttATGGCGATAACATCATTCGTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCATTTTCa > 2:1274915/1‑150 (MQ=255) ttATGGCGATAACATCATTCGTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCATTTTCAGt > 1:1300531/1‑150 (MQ=255) ttATGGCGATAACATCATTCGTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCATTTTCAGt > 1:269720/1‑150 (MQ=255) tATGGCGATAACATCATTCGTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCATTTTCAGTg < 1:665640/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |