New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 3267401 = | 91 (1.240) | coding (22/219 nt) | tdcR | L‑threonine dehydratase operon activator protein |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
AATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCGTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCATTTTCAGTGATAAATAATGCGGCATGTCACATTTTTTCACGCTATTTGTTGGAGAACAAACATTTATTTTATCAATATTTTAAAATTTCGAATACATGTATTGATCATCTCGAACAATTGATTAACGTCAACTTT > NC_000913/3267253‑3267550 | attcgaaattttaaaatattgataaaataaatgtttgttctccaacaaatagagtgaaaaaatgtgacatgccgcattatttatcactgaaaatggtttatttataatAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTttat > 1:1148764‑M1/109‑150 (MQ=255) tGACTGGGATAACCATATTTTATGGAGATAACATCATTCGTTATGTGGTTAATACAAAATAGGGGCTGATACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTttatta < 1:1264277/150‑1 (MQ=255) tAACAATATTTTATGGCGATAACATCATTCGTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAAc < 1:1335726/150‑1 (MQ=255) aaatattgataaaataaatgtttgttctccaacaaatagcgtgaaaaaatgtgacatgccgcattatttatcactgaaaatggtttatttataatAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCa > 1:1094774‑M1/96‑150 (MQ=255) aaatattgataaaataaatgtttgttctccaacaaatagcgtgaaaaaatgtgacatgccgcattatttatcactgaaaatggtttatttataatAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCa > 2:449302‑M1/96‑150 (MQ=255) aaatattgataaaataaatgtttgttctccaacaaatagcgtgaaaaaatgtgacatgccgcattatttatcactgaaaatggtttatttataatAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCa > 1:1255073‑M1/96‑150 (MQ=255) ttATGGCGATAACATCATTCGTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCATTTTCAGt > 1:1300531/1‑150 (MQ=255) ttATGGCGATAACATCATTCGTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCATTTTCAGt > 1:269720/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |