| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4421 | 111 (1.040) | 6 (0.060) | 6/268 | NT | 5.4% | coding (688/1287 nt) | thrC | L‑threonine synthase |
| ? | NC_000913 | = 4450 | 105 (1.020) | coding (717/1287 nt) | thrC | L‑threonine synthase | |||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
GCCATCGACGGCGATTTCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGT > NC_000913/4274‑4569 | tccATCGACGGCGATTGCGATGACTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAAGTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTAGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGGAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGtt < 1:559861/149‑1 (MQ=255)gCCATCGACGGCGATTTCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGtt > 2:485293/1‑150 (MQ=255)gCCATCGACGGCGATTTCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGtt > 2:129996/1‑150 (MQ=255)gCCATCGACGGCGATTTCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGAGGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGtt > 1:282859/1‑150 (MQ=255) aTCGACGGCGATTTCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTgcg > 2:26522/1‑150 (MQ=255) aTCGACGGCGATTTCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTAGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTgcg > 1:302552/1‑150 (MQ=255) tcgtcgGCGATTTGGATGCCTGTCTGGCGGTGGTGTAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGGTATACTCGGCTAACTCGTTTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTTTTgcgc < 1:12992/150‑1 (MQ=255) cGATTTCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAATCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGcc < 2:1347944/150‑1 (MQ=255) cGATTTCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGcc > 2:1234607/1‑150 (MQ=255) gATTTCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCg > 2:1543305/1‑150 (MQ=255) aTTTCGATGCCTGTCAGTCGCTGGGGAAGCAGGCGTTTGCTGCTGAAGAACTGAACGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACCTCAGCCGTTTGCTGGCGCAGCTTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGc < 2:1281274/150‑1 (MQ=255) aTTTCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGACGCTGTTGCGCAGCTGCCGc > 2:1147566/1‑150 (MQ=255) tCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCACAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAgg > 1:701759/1‑150 (MQ=255) tCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTGGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAgg < 2:1746224/150‑1 (MQ=255) cGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGga > 1:648055/1‑150 (MQ=255) gATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGGGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGgag < 2:1141478/150‑1 (MQ=255) aTGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGC‑Ggttgcgcgtctcctgcggcagc < 1:1488247‑M1/150‑23 (MQ=255) aTGCCTGTCAGGCACTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGgaga < 2:441048/150‑1 (MQ=255) gCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGAcg > 2:1435722/1‑150 (MQ=255) 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ttGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCTGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTTCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGAc < 2:302552/150‑1 (MQ=255) gCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCa > 1:1149339/1‑150 (MQ=255) ctactaCTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCaa > 1:1013481/1‑150 (MQ=255) actactTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACg > 1:562031/1‑150 (MQ=255) actTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGa > 1:954005/1‑150 (MQ=255) ctTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaccggctgatgttaatcgagttagccgagtttaaccctagcgccactttcagttcttcatcatcaaacgcctgcttc < 1:219153‑M2/150‑111 (MQ=255) tttGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAAc < 1:1234607/150‑1 (MQ=255) ttGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggcggatgttaatcgagttagccgagtttaaccctagcgccactttcagttcttcatcatcaaacgcctgcttcac < 2:1000591‑M2/150‑113 (MQ=255) ttGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACg < 1:1252252/150‑1 (MQ=255) gAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaaccctagcgccactttcagttcttcatcatcaaacgcctgcttcaccag < 2:132845‑M2/150‑115 (MQ=255) aaGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaaccctagcgccactttcagttcttcatcatcaaacgcctgcttcaccagc < 1:493363‑M2/150‑116 (MQ=255) gCTGgttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaaccctagcgccactttcagttcttcatcatcaaacgcctgcttccccagcg > 2:1774791‑M1/1‑4 (MQ=255) gCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaaccctagcgccactttcagttcttcatcatcaaacgcctgcttcaccagcgc < 2:1112278‑M2/150‑118 (MQ=255) cTGgttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaaccctagcgccactttcagttcttcatcatcaaacgcctgcttcaccagcgc > 1:185509‑M1/1‑3 (MQ=255) tGgttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaaccctagcgccactttcagttcttcatcatcaaacgcctgcttcaccagcgcc < 2:1782672‑M1/150‑149 (MQ=255) ggTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGt < 1:999059/149‑1 (MQ=255) | GCCATCGACGGCGATTTCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGT > NC_000913/4274‑4569 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |