| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 4421 | 111 (1.040) | 6 (0.060) | 6/268 | NT | 5.4% | coding (688/1287 nt) | thrC | L‑threonine synthase |
| ? | NC_000913 | = 4450 | 105 (1.020) | coding (717/1287 nt) | thrC | L‑threonine synthase | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
CAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGTGCCACGTTTCCTGCACGACGGTCAGTGGTC > NC_000913/4301‑4599 | cAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAAc > 2:1264551/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcag > 1:185509‑M2/1‑147 (MQ=255) cgcTGGGGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcagc > 2:1774791‑M2/1‑146 (MQ=255) cTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTg < 2:39798/150‑1 (MQ=255) cTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGATTGCTGGCGCAGATTTTCTACTACTATGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTg > 2:316742/1‑150 (MQ=255) cTGGTGAAGCAGGCGTTTAATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTg < 2:1670187/150‑1 (MQ=255) ggTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCCGCCAGCTGGt > 2:1162448/1‑150 (MQ=255) ggTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGAGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGt > 1:46186/1‑150 (MQ=255) tGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTg < 2:1629997/150‑1 (MQ=255) aGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGtct > 1:1044777/1‑150 (MQ=255) cAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCg > 2:531540/1‑150 (MQ=255) aGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCgg < 1:608049/150‑1 (MQ=255) ggCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGt > 1:1160175/1‑150 (MQ=255) 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atgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGaa < 1:255615/150‑1 (MQ=255) tgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGaaa > 2:447533/1‑150 (MQ=255) gaagaaCTGAAAGTGGCGCTAGGGTTTAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAAc > 2:125193/1‑150 (MQ=255) aCTGAAAGTGGCGCTATGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTGGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGATGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGGCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCgg < 2:988083/150‑1 (MQ=255) gTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTg < 2:361748/150‑1 (MQ=255) 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aGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATAc < 2:1335551/150‑1 (MQ=255) gCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaaccctagcgccactttcagttcttcatcatcaaacgcctgcttcaccagcgc < 2:1112278‑M2/150‑118 (MQ=255) ttGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGTGc > 2:637661/1‑150 (MQ=255) ttGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGGGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGCCTGCCGGGGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGTGc < 2:817663/150‑1 (MQ=255) gcAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCAGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGATGGCGAAGTCGCTCGGTCTGCCGGGGAAACGTTTTATTGCTGCGACCACCGAGATCGATACCGGGCCACg > 1:1140466/1‑150 (MQ=255) 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aGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGTGCCACGTTTCCTGCacg < 1:447533/150‑1 (MQ=255) ggAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGTGCCACGTTTCCTGCacga > 2:1557488/1‑150 (MQ=255) ggAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGTGCCACGTTTCCTGCacga > 2:516006/1‑150 (MQ=255) gagaCGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGTGCCACGTTTCCTGCacgac > 2:21423/1‑150 (MQ=255) agaCGCGCAACCAGCT‑GTTGTATCGGTGACAAGCGTAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCTAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTTCTGCTACCAACGTGAACGATACAGTGCCACGTTTACTGCACGACgg > 2:1215639/1‑150 (MQ=255) gaCGCGCAACCATCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGTGCCACGTTTCCTGCACGACgg < 2:1058410/150‑1 (MQ=255) gaCGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGTGCCACGTTTCCTGCACGACgg < 1:1261610/150‑1 (MQ=255) gaCGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGTGCCACGTTTCCTGCACGACgg < 1:1543305/150‑1 (MQ=255) gaCGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACATCGGCGATTTGACGGCGGGGCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGTGCCACGTTTCCTGCACGACgg < 2:1319533/150‑1 (MQ=255) gcgcAACCAGCGGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTCACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGGCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGTGCCACGTTTCCTGCACGACGGTCa < 1:125193/150‑1 (MQ=255) gcAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGTGCCACGTTTCCTGCACGACGGTCAGt < 2:1013481/150‑1 (MQ=255) ccAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGTGCCACGTTTCCTGCACGACGGTCAGTGGTc > 1:582275/1‑150 (MQ=255) | CAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGTGCCACGTTTCCTGCACGACGGTCAGTGGTC > NC_000913/4301‑4599 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |