New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 552430 | 113 (1.120) | coding (165/1068 nt) | purK | N5‑carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthase |
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
TCACCTAAACGATCAAACACCGCAGGCCACTCGCTGCGTTCGGCAAGTAACTGCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTCTATCTCAGCGGTAATCACGCTTTGTTGAAAAGGCACCGCCGCCGGTTCAGCGTCCAGCCCGACTGGCCAGACAGCAATGCCTAACGGTTCGCCTGCCTGACGCAG > NC_000913/552251‑552549 | tCACCTAACCGATCAAACACCGCAGGCCACTCGCTGCGTTCGGCAAGTAACTGCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACCTCGCGGTTCACAAAGGCCGGA > 1:87371‑M1/1‑150 (MQ=255) tAAACGATCAAACACCGCAGGCCACTCGCTGCGTTCGGCAAGTAACTGCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGgcg > 2:1323409/1‑150 (MQ=255) aaaCGATCAAACACCGCAGGCCACTCGCTGCGTTCGGCAAGTAACTGCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGgcgc > 1:463007/1‑150 (MQ=255) 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aaaGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTtccggcctttgtgaaccgcgatgtgttcccgattattgctgaccgtctgactcagaagcagcttttcgataagctccacctgccgactgcaccgtggcagttacttgccg < 1:526885‑M2/150‑111 (MQ=255) aaGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTCTATCTCAGCGGTAATCACGCTTTGTTGAAAAGGCACCGCCGCCGGTTCAGCGTCCAGCCCGACTGGCCAGACAGCAATGCCTAACGGTTCgcctgcc < 1:476859/150‑1 (MQ=255) aGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTCTATCTCAGCGGTAATCACGCTTTGTTGAAAAGGCACCGCCGCCGGTTCAGCGTCCAGCCCGACTGGCCAGACAGCAATGCCTAACGGTTCgcctgcct < 2:774479/150‑1 (MQ=255) ggCCGGAaaccgcattaacccgcgagctggcgcgccatccgggctttgtgaaccgcgatgtgttcccgattattgctgaccgtctgactcagaagcagcttttcgataagctccacctgccgactgcaccgtggcagttacttgccgaac < 2:204121‑M1/150‑144 (MQ=255) ggCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTtccggcctttgtgaaccgcgatgtgttcccgattattgctgaccgtctgactcagaagcagcttttcgataagctccacctgccgactgcaccgtggcagttacttgccgaac < 1:1403267‑M2/150‑114 (MQ=255) ggCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTCTATCTCAGCGGTAATCACGCTTTGTTGAAAAGGCACCGCCGCCGGTTCAGCGTCCAGCCCGACTGGCCAGACAGCAATGCCTAACGGTTCGcctgcctg > 1:261183/1‑150 (MQ=255) ccGGAaaccgcattaacccgcgagctggcgcgccatccggcctttgtgaaccgcgatgtgttcccgattattgctgaccgtctgactcagaagcagcttttcgataagctccacctgccgactgcaccggggcagttacttgccgaacgc < 1:495112‑M1/150‑146 (MQ=255) ccGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCCGCGTTCTATCTCCGCGGTAATCACGCTTTGTTGAAAAGGCCCCGCCGCCGGTTCAGCGTCCAGCCCGCCTGGCCCGACAGCAATGCCTAACGGTTCGCCTGCCTGAc > 1:1166982/1‑150 (MQ=255) ccGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTCTATCTCAGCGGTAATCACGCTTTGTTGAAAAGGCACCGCCGCCGGTTCAGCGTCCAGCCCGACTGGCCAGACAGCAATGCCTAACGGTTCGCCTGCCTGAc < 1:997974/150‑1 (MQ=255) ccGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTCTATCTCAGCGGTAATCACGCTTTGTTGAAAAGGCACCGCCGCCGGTTCAGCGTCCAGCCCGACTGGCCAGACAGCAATGCCTAACGGTTCGCCTGCCTGAc < 2:122627/150‑1 (MQ=255) ggATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTCTATCTCAGCGGTAATCACGCTTTGTTGAAAAGGCACCGCCGCCGGTTCAGCGTCCAGCCCGACTGGCCAGACAGCAATGCCTAACGGTTCGCCTGCCTGACgc < 2:811777/150‑1 (MQ=255) aaaccgcattaacccgcgagctggcgcgccatccggcctttgtgaaccgcgatgtgttcccgattattgctgaccgtctgactcagaagcagcttttcgataagctccacctgccgactgcaccgtggcagttacttgccgaacgcagcg < 2:826856‑M1/150‑150 (MQ=255) | TCACCTAAACGATCAAACACCGCAGGCCACTCGCTGCGTTCGGCAAGTAACTGCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTCTATCTCAGCGGTAATCACGCTTTGTTGAAAAGGCACCGCCGCCGGTTCAGCGTCCAGCCCGACTGGCCAGACAGCAATGCCTAACGGTTCGCCTGCCTGACGCAG > NC_000913/552251‑552549 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |