| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 552400 | 120 (1.130) | 6 (0.060) | 5/264 | NT | 5.0% | coding (195/1068 nt) | purK | N5‑carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthase |
| ? | NC_000913 | = 552430 | 113 (1.120) | coding (165/1068 nt) | purK | N5‑carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthase | |||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
CGCTGCGTTCGGCAAGTAACTGCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTCTATCTCAGCGGTAATCACGCTTTGTTGAAAAGGCACCGCCGCCGGTTCAGCGTCCAGCCCGACTGGCCAGACAGCAATGCCTAACGGTTCGCCTGCCTGACGCAGCATACGGCCTAACTGCCCGTTACCGAGGAC > NC_000913/552282‑552579 | cGCTGCGTTCGGCAAGTAACTGCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTt < 2:826856‑M2/150‑2 (MQ=255) gCGTTCGGCAAGTAACTGCCCCGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTtccgg < 1:495112‑M2/150‑6 (MQ=255) ttCGGCAAGTAACTGCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCa > 2:957675/1‑150 (MQ=255) tCGGCAAGTAACTGCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAg > 1:1317840/1‑150 (MQ=255) ggCAAGTAACTGCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTATTGCGGTTTCCGGCCAGCg > 1:365623/1‑150 (MQ=255) aaGTATCTGCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTc < 2:341883/150‑1 (MQ=255) aaGTAACTGCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCGAGCGTTc < 2:769250/150‑1 (MQ=255) aaGTAACTGCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTc > 1:1566996/1‑150 (MQ=255) aaGTAACTGCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGGCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTc < 2:773602/150‑1 (MQ=255) aGTAACTGCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGCGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGCACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTCt > 1:222708/1‑150 (MQ=255) aGTAACTGCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAAAAATCGGGAACACATCGCGGTGCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGGTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTCt < 1:464843/150‑1 (MQ=255) aaCTGCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTCTAtc > 1:1327716/1‑150 (MQ=255) aaCTGCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTCTAtc > 1:1373013/1‑150 (MQ=255) tGCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTc > 2:1592998/1‑143 (MQ=255) tGCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTc < 1:1592998/143‑1 (MQ=255) gCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTCTAtctctg > 1:1575105/1‑148 (MQ=255) gCCACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTCTATCTCAg > 2:9388/1‑150 (MQ=255) cACGGTGCAGTCGGCAGGTGGAGCTTATCGAAAAGCTGCTTCTGAGTCAGACGGTCAGCAATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGAGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGGCCAGCGTTCTATCTCAGCg < 1:309493/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |