| New junction evidence | |||||||||||
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AAAAAACGCACCATGTTGATGTCCAGGGCAAGCAAAGGTGCTGTTGCCCATCTCAACGTACTGCGTCAGCGTGTCATAAAACGGTGGCAGCAAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCG > NC_000913/3108769‑3109064 | aaaaaaCGCACCATGTTGATGTCCAGGTCAATCAAAGGTGCTGTTGCCCATCTCAACGTACTGCGTCAGCGTGTCATAAAACGGTGGCAGCAAATTATCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGcc > 1:574259/1‑150 (MQ=255)aaaaaaCGCACCATGTTGATGTCCAGGGCAAGCAAAGGTGCTGTTGCCCATCTCAACGTACTGCGTCAGCGTGTCATAAAACGGTGGCAGCAAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGcc < 2:1042567/150‑1 (MQ=255) aaaaaCGCACCATGTTGATGTCCAGGGCAAGCAAAGGTGCTGTTGCCCATCTCAACGTACTGCGTCAGCGTGTCATAAAACGGTGGCAGCAAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGCCg > 2:1224464/1‑150 (MQ=255) 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tccagcCACTGCTGCTCGTTGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATg > 1:1139973/1‑150 (MQ=255) ccagcCACTGCTGCTCGTTGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGGAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATga < 2:519814/150‑1 (MQ=255) cagcCACTGCTGCTCGTTGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGGTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGCATGCCAATGCGACTATCCGCACCGGTAATgac > 1:332703/1‑150 (MQ=255) agcCACTGCTGCTCGTTGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATgacg < 1:1377694/150‑1 (MQ=255) gcCACTGCTGCTCGTTGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATgacga > 1:1301548/1‑150 (MQ=255) ccACTGCTGCTCGTTGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATgacgac < 1:1093713/150‑1 (MQ=255) aCTGCTGCTCGTTGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTg > 1:539931/1‑150 (MQ=255) ctgctgCTCGTTGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGc > 1:1444507/1‑150 (MQ=255) gctgctCGTTGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGCAGGTTATTCCACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTAAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCCCATATCCGCAGCGCTAATGACGACTGCcg > 1:1700587/1‑150 (MQ=255) gctgctCGTTGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGCACGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAACAACACCGGTAGATCAAAACCCGTGCGCGTAAGCAACGCAACAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGTCGACTGCcg < 2:290747/150‑1 (MQ=255) ctCGTTGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGAc < 1:1224464/150‑1 (MQ=255) ctCGTTGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGAc < 1:1341671/150‑1 (MQ=255) ctCGTTGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGAc > 1:1381646/1‑150 (MQ=255) ctCGTTGCCGTTGA‑TTACCGACGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAATACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGAc < 1:117886/150‑1 (MQ=255) tCGTTGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACg > 1:200240/1‑150 (MQ=255) TGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCg < 1:276640‑M1/150‑1 (MQ=255) | AAAAAACGCACCATGTTGATGTCCAGGGCAAGCAAAGGTGCTGTTGCCCATCTCAACGTACTGCGTCAGCGTGTCATAAAACGGTGGCAGCAAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCG > NC_000913/3108769‑3109064 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |