| New junction evidence | |||||||||||
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TGTTGCCCATCTCAACGTACTGCGTCAGCGTGTCATAAAACGGTGGCAGCAAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTATCTCCCAACGCCACCACGCGACGATGAGA > NC_000913/3108810‑3109104 | tGTTGCCCATCTCAACGTACTGCGTCAGCGTGTCATAAAACGGTGGCAGCAAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCAt < 1:1560015/150‑1 (MQ=255)ggacgtcgcggcagtcgtcattaccgctgcggatagtcgcagtggcattcttgcgttgcttaagcgcaccggttttcatctaccggtgtttttgtattccgaacaTGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCAt > 1:1556022‑M1/106‑150 (MQ=255) acgtcgcggcagtcgtcattaccgctgcggatagtcgcagtggcattcttgcgttgcttaagcgcaccggttttcatctaccggtgtttttgtattccgaacaTGCTGTTGAATTACCGCCGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATg > 1:1606019‑M1/104‑150 (MQ=255) 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aCCGCCGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTa > 1:1809544/1‑150 (MQ=255) ccgccgTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCCGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTAt > 1:1649534/1‑150 (MQ=255) gccgTAACGCCCTCAGGTAATTAAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCAGCAGCGTTAATGACGACTGCAGCGAAGTACGTAAAATCAGAAtca > 1:1272693/1‑149 (MQ=255) cGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTATCTCCCAACg < 1:638459/150‑1 (MQ=255) cGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGACACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTATCTccacacg > 1:322224/1‑145 (MQ=255) cccGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTATCTCCCAACGcc > 2:1604512/1‑150 (MQ=255) cccGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACAGCGACTATCCGCTGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTATCTCCCACCGcc > 2:369793/1‑150 (MQ=255) tAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAACCCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGCCTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTATCTCCCAACGCCCCCAcgcg > 2:334271/1‑150 (MQ=255) tAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCTACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTATCTCCCAACGCCACCAcgcg < 1:935964/150‑1 (MQ=255) tAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTATCTCCCAACGCCACCAcgcg < 2:342771/150‑1 (MQ=255) aTTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTATCTCCCAACGCCACCACGcgac < 1:1329447/150‑1 (MQ=255) ttCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGCCTGCCGCGACGTCCGTATAATCAGTATCTCCCAACGCCACCACGcgccg > 1:708816/1‑150 (MQ=255) ttCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTATCTCCCAACGCCACCACGcgacg > 2:324805/1‑150 (MQ=255) cAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTACGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTATCTCCCAACGCCACCACGCGACGAt > 1:195952/1‑150 (MQ=255) cAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGTTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTATCTCCCAACGCCACCACGCGACGAt > 1:801837/1‑150 (MQ=255) cAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTATCTCCCAACGCCACCACGCGACGAt > 1:194613/1‑150 (MQ=255) cAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTATCTCCCAACGCCACCACGCGACGAt > 1:196611/1‑150 (MQ=255) cAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTATCTCCCAACGACACCCCGCGACGAt > 2:144308/1‑150 (MQ=255) aCAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTATCTCCCAACGCCACCACGCGACGATga < 2:1047505/150‑1 (MQ=255) aGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTATCTCCCAACGCCACCACGCGACGATgaga > 2:1278430/1‑150 (MQ=255) aGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTATCTCCCAACGCCACCACGCGACGATgaga < 2:399561/150‑1 (MQ=255) | TGTTGCCCATCTCAACGTACTGCGTCAGCGTGTCATAAAACGGTGGCAGCAAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGCCGTTGA‑TTACCGCCGTAACGCCCGCAGGTAATTCAACAGCATGTTCGGAATACAAAAACACCGGTAGATGAAAACCGGTGCGCTTAAGCAACGCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATCAGTATCTCCCAACGCCACCACGCGACGATGAGA > NC_000913/3108810‑3109104 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |