New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3998044 | 98 (0.920) | 7 (0.070) | 4/264 | NT | 6.7% | coding (62/2163 nt) | uvrD | DNA‑dependent ATPase I and helicase II |
? | NC_000913 | = 3998069 | 101 (1.000) | coding (87/2163 nt) | uvrD | DNA‑dependent ATPase I and helicase II |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
TATAATCAGCAAATCTGTATATATACCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGC > NC_000913/3997895‑3998193 | tataATCAGCAAATCTGTATATATACCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTGCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTTATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCC < 1:1457486‑M1/150‑1 (MQ=255) ataATCAGCAAATCTGTATATATACCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCa < 1:1153230/150‑1 (MQ=255) taATCAGCAAATCTGTATATATACCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCcc > 2:593137‑M1/1‑148 (MQ=255) taATCAGCAAATCTGTATATATACCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCAc > 2:855821/1‑150 (MQ=255) aaTCAGCAAATCTGTATATATACCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCAcc > 2:1458657/1‑149 (MQ=255) aaTCAGCAAATCTGTATATATACCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACg > 2:90556/1‑150 (MQ=255) aaTCAGCAAATCTGTATATATACCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTGTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGGGAAGCGGTGGCCGCGCCtcc > 1:291966‑M1/1‑147 (MQ=255) cAGCAAATCTGTATATATACCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGGTGCGCTTCTCCGCCCCACCTATTTTTACGCGGCGGTGTCAATGGACGTTGCGTACCTGCTCGACAGCCTGAATGACAACCAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCCCgcag > 1:294970/1‑150 (MQ=255) aGCAAATCTGTATATATACCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGATGCGGTGGCCGCGCCACgcagc > 1:256833/1‑150 (MQ=255) cAAATCTGTATATATACCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCCCGCCcccccccaa > 1:544486‑M1/1‑141 (MQ=255) tatataCCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGACCCccccagcaaccagatgggt > 1:588647‑M1/1‑131 (MQ=255) tataCCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCCGCAACCTTCTGGTGcg > 1:1742404/1‑149 (MQ=255) tataCCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCt > 2:1235804/1‑150 (MQ=255) 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cgcgcGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGGGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACca < 2:84946/149‑1 (MQ=255) aaGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAg < 1:90556/150‑1 (MQ=255) cGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAgcgg < 1:168944/150‑1 (MQ=255) gTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGGGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAgcggcg < 2:256833/150‑1 (MQ=255) gCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAgcggcggcg < 1:1422185/150‑1 (MQ=255) gCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAgcggcggcg < 1:1620761/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCACGCAGCACCCTTGTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTTACACGCGCGTACTGGTGCCTCGTCTCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCCTACTCGATTATGGCGGTGACGGTTACCAACAAAGcggcggcgg < 2:294970/150‑1 (MQ=255) ccGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGggcgcggccaccgcttcgcgctgtttgtcattaaggctgtcgagcaggtaagaaacgtccattggcaccgccgcgtaaaaataggttgggcggagaagcgcaacgccctccgccaaaa < 2:631433‑M2/150‑119 (MQ=255) cgcgCCcgccagcaccagaaggttgctgcgtggcgcggccaccgcttcgcgctgtttgtcattaaggctgtcgagcaggtaagaaacgtccattggcaccgccgcgtaaaaataggttgggcggagaagcgcaacgccctccgccaaaaa > 1:1069138‑M1/1‑6 (MQ=255) cgcgCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGggcgcgggcaccgcttcgcgctgtttgtcattaaggctgtcgagcaggtaagaaacgtccattggcaccgccgcgtaaaaataggttgggcggagaagcgcaacgccctccgccaaaaa < 1:1102957‑M2/150‑120 (MQ=255) cgcgCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGga < 1:1367330/150‑1 (MQ=255) cgcgCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGga < 2:1316023/150‑1 (MQ=255) gcgcCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTCAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGgag < 1:1575461/150‑1 (MQ=255) cccACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGGAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGGGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGAt < 1:1142205/149‑1 (MQ=255) cccgccagcaccagaaggttgctgcgtggcgcggccaccgcttcgcgctgtttgtcattaaggctgtcgagcaggtaagaaacgtccattggcaccgccgcgtaaaaataggttgggcggagaagcgcaccgccctccgccaaaaagctg > 2:696808‑M1/1‑2 (MQ=255) ccgccagcaccagaaggctgctgcgtggcgcggccaccgcttcgcgctgtttggcattaaggctgtcgagcaggcaagaaccgcccattggcaccgccgcgtaaaaataggttgggccgagaagcgcaacgccctccgccaaaaagctgg < 1:109163‑M1/150‑150 (MQ=255) cACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGc > 2:741763/1‑150 (MQ=255) | TATAATCAGCAAATCTGTATATATACCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGC > NC_000913/3997895‑3998193 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |