| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3998044 | 98 (0.920) | 7 (0.070) | 4/264 | NT | 6.7% | coding (62/2163 nt) | uvrD | DNA‑dependent ATPase I and helicase II |
| ? | NC_000913 | = 3998069 | 101 (1.000) | coding (87/2163 nt) | uvrD | DNA‑dependent ATPase I and helicase II | |||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
CCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGT‑GCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGTATCGGGCAACTGATGG > NC_000913/3997921‑3998217 | cAGCTTTTTGGCGGAGGGCGGTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGT‑GCTGGCGgg > 2:696808‑M2/1‑148 (MQ=255) tttttGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTTCCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGATGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTGTGGT‑GCTGGCGggcgcg < 1:959796‑M2/150‑7 (MQ=255) tttttGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGT‑GCTGGCGggcgcg > 1:1069138‑M2/1‑144 (MQ=255) tttttGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGT‑GCTGGCGggcgcg > 2:1034781‑M2/1‑144 (MQ=255) ggCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGT‑GCTGGCGGGCGCGGGCAg > 1:492302/1‑150 (MQ=255) gCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGT‑GCTGGCGGGCGCGGGCAGt < 1:568054/150‑1 (MQ=255) ggAGGGCGGTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTGCTTACCTGCCCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGT‑GCTGGCGGGCGCGGGCAGTgg < 1:962822/150‑1 (MQ=255) aGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGT‑GCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTa < 1:1669496/150‑1 (MQ=255) tgCGTTGCGCTTCTCCGCCCAAACTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACTTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGT‑GCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAg < 2:1036499/149‑1 (MQ=255) gCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGT‑GCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAgg > 2:1187463/1‑149 (MQ=255) cGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCCCGCACCAACCTTCTGGT‑GCAGCCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGAc > 2:1118927/1‑150 (MQ=255) gTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGT‑GCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGAcg > 2:278484/1‑150 (MQ=255) tGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGT‑GCGGGCGGGCGGGGGCAGTGGTAAGCcgcc > 1:733392/1‑149 (MQ=255) 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cACGCAGCAACCTTCTGGT‑GCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGc > 2:741763/1‑150 (MQ=255) aCGCAGCAACCTTCTGGT‑GCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCg < 1:1235804/150‑1 (MQ=255) aCGCAGCAACCTTCTGGT‑GCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCg < 1:637285/150‑1 (MQ=255) aCGCAGCAACCTTCTGGT‑GCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCg < 2:1608923/150‑1 (MQ=255) cagcaACCTTCTGGT‑GCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCa > 1:1362445/1‑150 (MQ=255) acccatCTGGTTGCTGGGGgggtcggccaccgcttcgcgctgtttgtcattaaggctgtcgagcaggtaagaaacgtccattggcaccgccgcgtaaaaataggttgggcggagaagcgcaacgccctccgccaaaaagctgggtatata > 1:588647‑M2/3‑19 (MQ=255) aaCCTTCTGGT‑GCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGTGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGt > 2:785696/1‑150 (MQ=255) tGGT‑GCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGTATCGGGc > 1:517752/1‑150 (MQ=255) tGGC‑GCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGTATCGGGc < 1:278484/150‑1 (MQ=255) ggT‑GCTGTCGGGAGCGGTCAGTGGTAAGACGCGCGTACGGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATTCGTCATCGTATCGGGCa < 1:1095518/150‑1 (MQ=255) ggT‑GCGGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGTATCGGGCa < 1:188868/150‑1 (MQ=255) gT‑GCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCAGCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGTATCGGGCaa > 1:232795/1‑150 (MQ=255) t‑GCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGTATCGGGCAAc < 1:593137/150‑1 (MQ=255) t‑GCGGGGGggcgcggccaccgcttcgcgctgtttgtcattaaggctgtcgagcaggtaagaaacgtccattggcaccgccgcgtaaaaataggttgggcggagaagcgcaacgccctccgccaaaaagctgggtatatatacagatttgc > 2:592066‑M2/1‑8 (MQ=255) gCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGTATCGGGCAACt < 2:513041/150‑1 (MQ=255) ggcgggcgCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGCCGTGTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATGGTATCGGGCAACTGAt > 2:169362/1‑150 (MQ=255) gcgggcgcgggcAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGTATCGGGCAACTGATg > 2:1490818/1‑150 (MQ=255) gcgggcgcgggcAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGTATCGGGCAACTGATg > 2:924526/1‑150 (MQ=255) ggggcgcggccaccgcttcgcgctgtttgtcattaaggctgtcgagcaggtaagaaacgtccattggcaccgccgcgtaaaaataggttgggcggagaagcgcaacgccctccgccaaaaagctgggtatatatacagatttgctgatta > 2:593137‑M2/2‑2 (MQ=255) cgggcgcgggcAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGTATCgg > 1:1800760/1‑139 (MQ=255) cgggcgcgggcAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGTATCgg < 2:1800760/139‑1 (MQ=255) cgggcgcgggcAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGTATCGGGCAACTGATgg > 2:1368090/1‑150 (MQ=255) | CCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGT‑GCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGTATCGGGCAACTGATGG > NC_000913/3997921‑3998217 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |