| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 521828 | 115 (0.980) | 7 (0.060) | 5/260 | NT | 6.0% | coding (1413/2415 nt) | ybbP | putative ABC transporter permease |
| ? | NC_000913 | = 521858 | 113 (1.030) | coding (1443/2415 nt) | ybbP | putative ABC transporter permease | |||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
GGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCC > NC_000913/521679‑521977 | ggctggATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTG > 2:282112‑M1/1‑150 (MQ=255) gctggATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTgg > 1:1210518/1‑150 (MQ=255) gctggATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTgg < 1:1944922/150‑1 (MQ=255) gctggATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTgg < 1:1961466/150‑1 (MQ=255) gATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGGCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGtt < 1:1810119/150‑1 (MQ=255) gctgctGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCg > 2:144194/1‑150 (MQ=255) ctgctgAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGt > 1:934828/1‑150 (MQ=255) tgctgAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTg < 1:898310/150‑1 (MQ=255) gctgAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTgg > 1:171829/1‑150 (MQ=255) ctgAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGc < 2:137234/150‑1 (MQ=255) gAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGa > 1:1708030/1‑150 (MQ=255) gAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGa < 1:1297109/150‑1 (MQ=255) gAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGa > 1:865625/1‑150 (MQ=255) aTGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGGTGCGTGGCGATc < 1:1610775/150‑1 (MQ=255) aCTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGGTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGGCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCt < 1:1526404/150‑1 (MQ=255) cTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTc < 1:197329/150‑1 (MQ=255) cTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTc > 1:919367/1‑150 (MQ=255) cTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTAAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGATTACGGCATTTTCGATCACCTTTATGCTGCTGCCAATGCTGATGATGTTGCGTGGCGATCTGATc > 2:823997/1‑150 (MQ=255) 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cGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGccagcggtcgagcagatcgccacgcaacaccagcagcagtgcc < 1:101896‑M1/150‑44 (MQ=255) cGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGATCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGccagcggtcgagcagatcgccacgcaacaccagcagcagtgcc < 2:788987‑M1/150‑44 (MQ=255) gCTGCCTCTGCGCCTGGCTGGTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTTGGCTACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTAcc < 1:2003406/150‑1 (MQ=255) cggccTCTGCGCCTGGCGGGTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGGGGGCAACGGTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTATATGCTGCTGGCACTGCTGCTGccagcggtcgagcagatcgccacgcaacaccagcagcagtgccag < 1:102625‑M1/148‑46 (MQ=255) ctctGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAg > 1:1301249/1‑150 (MQ=255) 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gctgctGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGt > 1:1140674/1‑150 (MQ=255) ctgGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCg > 1:541292/1‑150 (MQ=255) tgGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTTGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCgg < 1:1460273/150‑1 (MQ=255) tgGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCgg < 2:919367/150‑1 (MQ=255) aCTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGcagcagcagcagtgccagcagcataaaggagagcgaaaatgccgaaagctgacttaacgttgaccacggctgacgtaacaggcggctaaccgccaggcgcagaggcagcg < 1:516585‑M2/150‑111 (MQ=255) ctgctgctgGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGcagcagcagtgccagcagcataaaggagagcgaaaatgccgaaagctgacttaacgttgaccacggctgccgtaacaggcggctaaccgccaggcgcagaggcagcgattt < 1:282112‑M2/150‑112 (MQ=255) tgctgctgccagcggtcgagcagatcgccacgcaacaccagcagcagtgccagcagcataaaggagagcgaaaatgtcgaaagctgacttaacgttgaccacggctgacgtaacaggcggctaaccgccaggcgcagaggcagcgatttc < 2:1394024‑M1/150‑143 (MQ=255) tgctgctgccagcggtcgagcagagcgccacgcaacaccagcagcagtgccagcagcataaaggagagcgaaaatgccgaaagctgacttaacgttgaccacggctgacgtaacaggcggctaaccgccaggcgcagaggcagcgatttc < 2:838839‑M1/150‑143 (MQ=255) tgctgctgGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGt < 2:1301249/150‑1 (MQ=255) gctgctgccagcggtcgagcagatcgccacgcaacaccagcagcagtgccagcagcataaaggagagcgaaaatgccgaaagctgacttaacgttgaccacggctgacgtaacaggcggctaaccgccaggcgcagaggcagcgatttca > 2:879738‑M1/1‑7 (MQ=255) 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gccagcggtcgagcagatcgccacgcaacaccagcagcagtgccagcagcataaaggagagcgaaaatgccgaaagctgacttaacgttgaccacggctgacgtaacaggcgactaaccgccaggcgcagaggcagcgatttcagcgtca > 1:428738‑M1/1‑1 (MQ=255) gccagcggtagagcagatcgccacgcaacaccagcagcagtgccagcagcataacggagagcgaaaatgccgaaagctgacttaacgttgaccacggctgacgtaacaggcggctaaccgacaggcgcagaggcagcgatttcagcgtca < 1:1236200‑M1/150‑150 (MQ=255) | GGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCC > NC_000913/521679‑521977 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |