| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 521828 | 115 (0.980) | 7 (0.060) | 5/260 | NT | 6.0% | coding (1413/2415 nt) | ybbP | putative ABC transporter permease |
| ? | NC_000913 | = 521858 | 113 (1.030) | coding (1443/2415 nt) | ybbP | putative ABC transporter permease | |||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
ATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCGATTAA > NC_000913/521709‑522007 | aTGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTgg < 1:1299789/150‑1 (MQ=255) tGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGTCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCGTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCTACCGCTGGc < 1:1236200‑M2/150‑2 (MQ=255) tGAACTCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTCGTCAACGTTAATTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGcagcagc > 2:263231‑M2/1‑143 (MQ=255) tGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGcagcagc > 1:1027776‑M2/1‑143 (MQ=255) tGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGcagcagc > 2:879738‑M2/1‑143 (MQ=255) ggcaatcgCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTCAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGGCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGcagcagc > 1:1817735‑M2/4‑143 (MQ=255) gAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGCTCTGCTCGACCGCTGGcagcagca < 2:838839‑M2/150‑9 (MQ=255) tCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGGCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCtg > 1:562155/1‑149 (MQ=255) cGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGGTTTCGGCATTTTCGCTGTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTTCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCCGCAGCAGCTAc > 2:296539/1‑150 (MQ=255) ctctGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTACAg > 1:1300936/1‑150 (MQ=255) tctGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGa > 1:507845/1‑150 (MQ=255) tctGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGa > 2:1387436/1‑150 (MQ=255) tGCGCCTGGCGGGTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGaaa < 1:20554/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGGCAGCCGGGGGCAACGTTAAGTCAGCTATCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAg < 2:1078282/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCg > 1:1000397/1‑150 (MQ=255) cTGGCGGTTAGCCGCCTGATACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGGTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCg < 2:983072/150‑1 (MQ=255) tGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGGTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCAACCTCCAGAAAGCCCgc > 2:1368302/1‑149 (MQ=255) aGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACttt < 2:242482/150‑1 (MQ=255) 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cTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTttaatt > 2:1746119/1‑150 (MQ=255) tGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTttaatta < 1:871535/150‑1 (MQ=255) cGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTTAGTAACATc > 1:174125/1‑150 (MQ=255) cGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATc > 2:1388229/1‑150 (MQ=255) cGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATc > 1:1681332/1‑150 (MQ=255) 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gATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGTACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGgcg > 1:220661/1‑150 (MQ=255) tCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGcgcg < 1:186539/150‑1 (MQ=255) tCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGcgcg < 2:507845/150‑1 (MQ=255) tGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCTCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGc < 2:1210518/150‑1 (MQ=255) gCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCt > 2:387307/1‑150 (MQ=255) cTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTg < 2:68860/150‑1 (MQ=255) cTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACAACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTGGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTg > 2:534312/1‑150 (MQ=255) cTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCGTCCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACCTCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCTGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTg < 2:1295798/150‑1 (MQ=255) gcccGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCCGAAAGCCCGACCTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTCGTGCGGGCGCGGCTGACg < 1:318133/148‑1 (MQ=255) ccGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGc < 2:1992620/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGc < 2:979602/150‑1 (MQ=255) cGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAGTCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCg > 2:645698/1‑150 (MQ=255) cGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCg < 2:859202/150‑1 (MQ=255) cGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCg < 2:562155/150‑1 (MQ=255) gCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCGa > 2:1130805/1‑150 (MQ=255) cTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCGAt < 1:628051/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCGAt < 2:1000397/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACATTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAACAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCGAt < 1:1357365/150‑1 (MQ=255) tGGCATCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCTGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCGAtt < 2:926496/150‑1 (MQ=255) tGGCAGCAGCAGCTACCTACAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCGAtt < 2:934828/150‑1 (MQ=255) gggCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACAGCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCGAtt < 1:45976/149‑1 (MQ=255) gcagcagcaGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCGATTaa < 2:1612860/150‑1 (MQ=255) | ATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCGATTAA > NC_000913/521709‑522007 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |