| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,292,997 | IS2 (–) +5 bp | 100% | intergenic (‑75/‑526) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1292997 = | 4 (0.040) | 93 (0.850) | 82/278 | NT | 95.7% | intergenic (‑75/‑530) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1293001 | 4 (0.040) | 71 (0.650) | 56/278 | NT | 94.5% | intergenic (‑79/‑526) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
AGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1292855‑1293001‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTG > NC_000913/1467910‑1468057 AGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCAGTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGG > 2:1187351/1‑150 TGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGAT < 2:497827/150‑1 TACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGGTGAGGTAATAATAGAGCCTT‑AATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTG < 2:1173401/150‑1 ACATTCTCTTGCATGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGAAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTG > 2:197727/1‑150 ATTCTCTTGGCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTGCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGAAATCTCAAACTTATATTGGGGCGGGCTGTGGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCC < 2:93811/150‑1 TCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGAGGTTGTGCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCC < 2:249770/150‑1 aTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTAT < 1:1184379/149‑1 CCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCATCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTT > 2:23666/1‑150 TGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCC > 2:363015/1‑150 TGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCC < 1:1015695/150‑1 TGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCC > 1:457418/1‑150 GCACGAAGAGTACTGATGTTGTTCAGAATTTTAAGAGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGCGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGA < 2:353641/150‑1 GCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGA < 2:1586132/150‑1 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2:848895/1‑150 ACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATC < 2:1812929/150‑1 CGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCA > 1:552137/1‑150 GATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTTAGGTAATAATTGAGAATTAAATTCAGTTGTTCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT > 1:1217570/1‑150 TTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAC > 2:255057/1‑150 TCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCAT > 2:1815198/1‑150 TCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGACAGGTGGATTTGCCACTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCAAT > 1:76307/1‑150 CAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTTGTTTTTTTAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTTGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATT < 1:983222/150‑1 CAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATATTAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATT < 1:1362388/150‑1 CAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATT > 2:439025/1‑150 CAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATT > 1:78201/1‑150 CAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATT > 1:1500849/1‑150 CAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATT > 1:1454420/1‑150 AGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTA > 2:613333/1‑150 AGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCACTATATTTCCATACATCTGTTATCACTTAACCCATTA > 1:325145/1‑150 AGAATTTTAAGTGCATCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCATTTGTGCAATAGGCAGGTGGATTTGGCCCTATATTTCCAGACATCAGTTATCAATTAACCCATTA > 1:337454/1‑150 tAATTTTATGTGCTTAGATCATTGTAGTAATCTAAAACTTATATTGGGTTGCTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGGGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTAC < 1:315935/149‑1 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1:1875443/1‑150 TTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATG > 2:706396/1‑150 TTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGCGCGATAACCCAGCGCACTAGGC > 2:1745099/1‑150 TTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGC < 1:874794/150‑1 TTGTGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGA < 1:1698625/150‑1 GAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATG < 2:1049890/150‑1 AGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGC < 2:586481/150‑1 AGGTAATAATAGAGCCTTAAAATCAGATGTGTAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTCTTATAACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGAGCAATATGCGGATGC > 1:1192916/1‑150 AATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCTCTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAGCCCAGCGCACTATGCGGATGCCATg > 2:150701/1‑149 GAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATA < 2:688206/150‑1 CTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATATCAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGATCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGC < 2:12867/150‑1 TAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCTCTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTC < 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1:1258931/1‑150 AGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTAATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTT < 2:1630148/150‑1 cGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTG > 2:431605/2‑150 GGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTG < 1:932772/150‑1 GGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTG < 1:1352596/150‑1 AGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1292855‑1293001‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTG > NC_000913/1467910‑1468057 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |