| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3411602 | 103 (0.940) | 6 (0.060) | 5/256 | NT | 5.7% | intergenic (+35/‑51) | fis/yhdJ | global DNA‑binding transcriptional dual regulator/DNA adenine methyltransferase, SAM‑dependent |
| ? | NC_000913 | = 3411616 | 104 (1.030) | intergenic (+49/‑37) | fis/yhdJ | global DNA‑binding transcriptional dual regulator/DNA adenine methyltransferase, SAM‑dependent | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
CCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGT > NC_000913/3411453‑3411751 | ccTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCT < 1:1358353‑M1/150‑1 (MQ=255) ttGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTc < 2:990101/150‑1 (MQ=255) tGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCg > 1:552728/1‑150 (MQ=255) 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aGCTAAATGATTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGAATGGGGAAGAGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCg < 2:1209975/150‑1 (MQ=255) tAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTAACGGTGATGCGCGTGCCGAAc > 1:253057/1‑150 (MQ=255) aTGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTa > 1:14362/1‑150 (MQ=255) gCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTaaa > 1:1138632/1‑150 (MQ=255) ttGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAagcgcctttttaatcaagcatttagctaacctgaattagttcatgccgtattttttcaattttttacgcagcgtaccacggttgatgcccatcatcggcgcagcacgggtctggttacc < 2:639416‑M2/150‑120 (MQ=255) aTTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAagcgcctttttaatcaagcatttagctaacctgaattagttcatgccgtattttttcaattttttacgcagcgtaccacggttgatgcccatcatcagcgcagcacgggtctggttaccacg < 1:609298‑M2/150‑123 (MQ=255) aTTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAagcgcctttttaatcaagcatttagctaacctgaattagttcatgccgtattttttcaattttttacgcagcgtacaacggttgatgcccatcatcagcgcagcacgggtctggttaccacg < 1:927678‑M2/150‑123 (MQ=255) ttAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATc < 1:1682511/150‑1 (MQ=255) aaaaaGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGCACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCCCGGTGATGCGCTTGCCGCACTTAAAAAGATccc > 2:1856493/1‑150 (MQ=255) aacaggcTCTtcccgatgccgagtagcgcctttttaatcaagcatttagctaacctgaatttgttcatgccgtattttttcaattttttacgcagcgtaccacggttgatgcccatcatcagcgcagcacgggtctggttaccacgggtg < 2:461528‑M1/147‑141 (MQ=255) aaaaGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGCCCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATcccc > 1:495738/1‑150 (MQ=255) aaaaGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATcccc > 1:1342026/1‑150 (MQ=255) aaGGCGCTACTCGGCATGGGGAagcgcctttttaatcaagcatttagctaacctgaattagttcatgccgtattttttcaattttttacgcagcgtaccacggttgatgcccatcatcagcgcagcacgggtctggttaccacgggtgta < 1:1082732‑M2/150‑129 (MQ=255) cgcTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGaa > 1:675221/1‑150 (MQ=255) gcTtccccatgccgagtagcgcctttttaatcaagcatttagctaacctgaattagttcatgccgtattttttcaattttttacgcagcgtaccacggttgatgcccatcatcagcgcagcacgggtctggttaccacgggtgtattgca > 2:1438245‑M1/1‑3 (MQ=255) ttcgccctgccgaggagcgcctttttaatcaagcatttagctaacctgaattagttcctgccgtattttttcaattttatacgcagcgtaccacggttgatgcccatcaccagcgcagcacgggtctggttaccacgggtgtattgcatc < 2:336300‑M1/150‑150 (MQ=255) tACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAAATTAAAAAGATACCCGCCGAAAgg > 2:661067/1‑149 (MQ=255) | CCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGT > NC_000913/3411453‑3411751 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |