New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 3411616 | 104 (1.030) | intergenic (+49/‑37) | fis/yhdJ | global DNA‑binding transcriptional dual regulator/DNA adenine methyltransferase, SAM‑dependent |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
TGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTT > NC_000913/3411467‑3411765 | tGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGa < 1:1205073/150‑1 (MQ=255) tGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGa > 2:1833783/1‑150 (MQ=255) gATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGGTGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTATAAAATTGAAAAAATACGGCAGGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTCCTCGGCAGGGCGAa < 2:336300‑M2/150‑2 (MQ=255) tGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAagc > 2:1438245‑M2/1‑147 (MQ=255) acCCGTCGTATCCAGACCCGTGCTGCCCTGATTATGGGAATATTCCGTTTTACGCGGGGTAAAAACTTGAAAAAATACTGCATGAACTATTTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCttttt < 2:144222/150‑1 (MQ=255) cccGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCGGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCtttttt < 1:366004/150‑1 (MQ=255) cccGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGAGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCtttttt > 2:468408/1‑150 (MQ=255) cGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat > 1:1650328/1‑150 (MQ=255) tgttAACCAGACCCGTGCTGATCTGATGATGGGAATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAg < 2:1172176/147‑1 (MQ=255) ggTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAgg < 1:829144/150‑1 (MQ=255) tAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAGCTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGgtg > 1:525307/1‑150 (MQ=255) tAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGgtg < 1:646369/150‑1 (MQ=255) tAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGgtg < 2:583507/150‑1 (MQ=255) 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tgatgaTGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATg < 1:476453/150‑1 (MQ=255) tgatgaTGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATg < 1:1079295/150‑1 (MQ=255) atgGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAAc > 1:1043883/1‑150 (MQ=255) tgGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGCCCATGAGAACa > 2:254749/1‑150 (MQ=255) cATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGAt < 1:428630/150‑1 (MQ=255) 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tGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATCAAGCTAAGACGATTATTAAAGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAg > 2:201499/1‑150 (MQ=255) aTTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAagcgcctttttaatcaagcatttagctaacctgaattagttcatgccgtattttttcaattttttacgcagcgtacaacggttgatgcccatcatcagcgcagcacgggtctggttaccacg < 1:927678‑M2/150‑123 (MQ=255) ttAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATc < 1:1682511/150‑1 (MQ=255) tAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATcc < 2:642348/150‑1 (MQ=255) aaaaaGGCGCTACTCGGCATGGGGAagcgcctttttaatcaagcatttagctaacctgaattagttcatgccgtattttttcaattttttacgcagcgtaccacggttgatgcccatcatcagcgcagcacgggtctggttaccacgggt < 1:616511‑M2/150‑126 (MQ=255) aaaaGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGATCAGGATGTGAACCGAGCCGGTTTGGTATTGAAGCGAAGACAATTTTTCCCGGTGATGCGCTTGCCGAACGTAAAAAGATcgcc > 2:367262/1‑150 (MQ=255) aaaaGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGCCCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATcccc > 1:495738/1‑150 (MQ=255) aaaaGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATcccc > 1:1342026/1‑150 (MQ=255) gcgcTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACTGGATGTGAACCGACCCGGTTTGTGAATGCAGCTAAGTCAAGTATTAACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCACAGCCGa > 1:314320/1‑150 (MQ=255) cgcTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGaa > 1:675221/1‑150 (MQ=255) cgcTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGaa > 1:1216648/1‑150 (MQ=255) tACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAAATTAAAAAGATACCCGCCGAAAgg > 2:661067/1‑149 (MQ=255) aCTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAgtg > 2:80871/1‑150 (MQ=255) cTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAgtgt > 1:1767861/1‑150 (MQ=255) tCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGATTGACCATTAGAACATTATGTTAACCGACCCGGTTTGGTTATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTc < 1:1033092/150‑1 (MQ=255) 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tGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCAGGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCgatctg < 2:85495/150‑1 (MQ=255) aaGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCtt < 2:1018098/150‑1 (MQ=255) | TGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTT > NC_000913/3411467‑3411765 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |