New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2411407 | 36 (0.850) | 3 (0.080) | 3/250 | NT | 8.0% | intergenic (‑55/+32) | yfbS/hxpA | putative transporter YfbS/hexitol phosphatase A |
? | NC_000913 | = 2411413 | 35 (0.880) | intergenic (‑61/+26) | yfbS/hxpA | putative transporter YfbS/hexitol phosphatase A |
GACCGCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCTCATTCAGGCGCGGGGTATCTGCCGGAGCGTTAA > NC_000913/2411266‑2411548 | gACCGCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTATGCCATAAAAAAGCCCcga > 2:256310/1‑143 (MQ=255) cGCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCcgacga > 1:546726/1‑143 (MQ=255) cGCATCCATACGCACTCTGCCCGGCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTGCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCcgacga < 2:223055/143‑1 (MQ=255) cATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCTCAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTGGTGTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACgcga > 1:415324/1‑143 (MQ=255) aTACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGAcgggg > 2:766587‑M2/1‑138 (MQ=255) acgcacgcTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGAcggggct > 2:660565‑M2/1‑136 (MQ=255) cGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGtctcgtcggggctt < 1:36235‑M1/143‑15 (MQ=255) aCTGTGCCGGGCGCGAACAATACGATGGCAGCGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCGGTGCACCGTTCACAACTTCTCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGTGCTAAAt < 2:567177/143‑1 (MQ=255) gtcggCCCGGCGCAAACAGGGCGATGGCAACGGCCAGGAATGAAAGAACCCAAATCGATTCACCGTTCACAACTTATCCGTGTTAATTGAGGGGGAGGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCCAAATc < 2:374030/139‑1 (MQ=255) ctctGCCCGGCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATc < 2:58865/143‑1 (MQ=255) cGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGGTTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGgt < 2:2663/143‑1 (MQ=255) gCAAACGAGTCGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAGTCAATTCACCGTTCACAATTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGtctcgtcggggcttttttatggcagaatc < 1:321350‑M1/143‑30 (MQ=255) cAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACCTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGtctcgtcggggcttttttatggcagaatcaagtc < 1:73509‑M1/143‑35 (MQ=255) aGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACt > 1:739386/1‑143 (MQ=255) gggaaaCGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAACAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGaataa < 1:257612/139‑1 (MQ=255) aaCGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAAc > 2:564285/1‑143 (MQ=255) taccAGTAATGAAAAGAGCCAACTCGATTGACCTTTCACAACGTATCGTTGTTAATTGAGTGCTATGACTTGATTCTGCCATAAAAAATCCGCGACTAGACGGGGCTAAATCATGATCATGTGTTTCACTGAATAATAACATc < 2:639903/141‑1 (MQ=255) tcaaaGACCCCACATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTCAATCGAGGGGGATGACGTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTgg < 1:44249/141‑1 (MQ=255) ggaGAACCCATACCAGTGCACCGTTTACTACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATACAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCt < 2:197784/141‑1 (MQ=255) aaGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCCCCActtacctg > 2:821160/1‑138 (MQ=255) ccAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAATAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATCACATCACCACTTAGCTGTTCGGt > 2:256383/1‑143 (MQ=255) aaaTCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGAGAATGGCGGTATTCTGCCATAAAAAAGCAACGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACGCACTAATAACGTCGCCATTTGCATCGTTGGTca > 2:176153/1‑143 (MQ=255) aTCAAGTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAATAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTcaca < 1:413987/143‑1 (MQ=255) tCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCGCGACGGGACGGGGCTAAATCATGGTATGGCGCGAAACCAAACAATCACGTACCAATTTGGCGGTTTGGTCACAg > 1:183678/1‑143 (MQ=255) tCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAg < 1:74516/143‑1 (MQ=255) cACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATCCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAAttt < 1:775487/143‑1 (MQ=255) gTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTc < 1:140684/143‑1 (MQ=255) gcacaACCTATCCTTGTTAATTGAGTGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCa < 2:239591/142‑1 (MQ=255) acaTCTGATCCGTGTTAGTTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGa < 2:824965/143‑1 (MQ=255) acaACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGCTGACTTGATTCTGCAATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGa > 1:176063/1‑143 (MQ=255) caACTTATCCTTGTTAATTGAGGCGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAACGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCACGATCAGCTGTTTCACTGAATAATAACCTCGCCATTTCGCTGCTTGGTCACAGCACTTTGCTCCAgca > 2:117905/1‑141 (MQ=255) ttGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGAc > 1:588171/1‑143 (MQ=255) aTTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATc > 1:725384/1‑143 (MQ=255) tGAGGGGGATGACTGGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGa < 2:684412/143‑1 (MQ=255) tggATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCCCa < 2:631200/142‑1 (MQ=255) ttcTTGATTCCGCCATAACAACGCCCCGGCGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAACAACATCGCCATTTGGCTGTCTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCTCATTCAg < 2:76700/141‑1 (MQ=255) gACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGAcggggcttttttatggcagaatcaagtcatccccctcaattaacaaggataggttgtgaacggtgaattgatttgggttctttcattactggccgttgccatcgtcttg < 1:73509‑M2/143‑110 (MQ=255) ttGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGCACAAATCGATCTCATTCAAgcg > 1:273687/1‑143 (MQ=255) ttGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCTCATTCAGgcg > 1:467696/1‑143 (MQ=255) tatccTGACATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCAGTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCTCATTCAGGcgcg < 2:382439/139‑1 (MQ=255) gATTGTGCCAGAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTGCACTGAATAATAACATCGCCATGTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCTCATTCAGGcgcg < 2:147079/143‑1 (MQ=255) gATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGAcggggcttttttatggcagaatcaagtcatccccctcaattaacaaggataaattgtgaacggtgaattgacttgggttctttcattactggccgttgccatcgactcgtttgc < 1:321350‑M2/143‑115 (MQ=255) gATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCTCATTCAGGcgcg < 2:546726/143‑1 (MQ=255) aTTCCGCCATAAAAACGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCTCATTCAGGCGCgg < 1:495979/143‑1 (MQ=255) ttCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCGCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCTCATTCAGGCGCggg < 2:494925/143‑1 (MQ=255) ccATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCTCATTCAGGCGCGGGGTATc > 2:732328/1‑143 (MQ=255) aaGCCCCGACGAGAcggggcttttttatggcagaatcaagtcatccccctcaattaacaaggataagttgtgaacggtgaattgatttgggttctttcattactggccgttgccatcgtcttgtttgcgacgggcagagtgcg < 1:36235‑M2/143‑130 (MQ=255) aGCCCCGtctcgtcggggcttttttatggcagaatcaagtcatccccctcaattaacaaggataagttgtgaacggtgaattgatttgggttctttcattactggccgttgccatcgtcttgtttgcgacgggcagcgtgcgt > 2:660565‑M1/1‑7 (MQ=255) ccccGtctcgtcggggcttttttatggcagaatcaagtcatccccctcaattaacaaggataagttgtgaacggtgaattgatttgggttctttcattactggccgttgccatcgtcttgtttgcgacgggcagagtgcgtat > 2:766587‑M1/1‑5 (MQ=255) cgacgaTGCGGGGCCAAATCCTTATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCTCATTCAGGCGCGGGGTATCTGCCGGAGCGTTaa < 2:129350/143‑1 (MQ=255) cgacgaGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGACTACCAAATCGACCTCATTCAGGCGCGGGGTATCTGCCGGAGCGTTaa < 2:176063/143‑1 (MQ=255) | GACCGCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCTCATTCAGGCGCGGGGTATCTGCCGGAGCGTTAA > NC_000913/2411266‑2411548 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |