New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1579554 = | 34 (0.810) | 3 (0.080) | 3/246 | NT | 9.0% | coding (10/123 nt) | yneP | protein YneP |
? | NC_000913 | 1579580 = | 29 (0.740) | coding (36/123 nt) | yneP | protein YneP |
TATTTCATTTTCAGTGGTTATGGTTATGCTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATAATGTGGTAAAGCGGTACTCTGTTCTTAGCTAACTCTACCATGGCGTTCATATAA > NC_000913/1579441‑1579720 | tatTTCATTTTCAGTGGTTATGGTTATGCTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCtt < 1:133372/143‑1 (MQ=255) tttCATTTTCAGTGGTTATGGTTATGCTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGt > 1:208489/1‑143 (MQ=255) ttCATTTTCAGTGGTTATGGTTATGCTATTGATAATCCAGGTTATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGtt > 2:270773/1‑143 (MQ=255) ttCATTTTCAGTGGTTATGGTTATGCTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTCAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATGTATGTCGGGTGCCTGGtt > 2:396580/1‑143 (MQ=255) ttttCAGTGGTTATGGTTATGCTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAgg > 1:588736/1‑143 (MQ=255) atggttatgCTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAagga < 1:482906/143‑1 (MQ=255) acctcattatggatgttgcaaaacaaatggagaataattaataacgctctcttttaactccattcttagcctccttcttatgaccttaacaaggCACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAagga > 1:624158‑M1/95‑143 (MQ=255) gCTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGCAATGTATGTCGGGTGCCTTCTGCAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGa > 1:734202/1‑143 (MQ=255) aTTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCGGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATg < 2:437721/143‑1 (MQ=255) tgttgcaaaacaaatggagaataattaataacgctctcttttaactccattcttagcctccttcttatgaccttaacaaggCACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGa < 1:272365‑M1/62‑1 (MQ=255) tGATAAGCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGa < 1:622676/143‑1 (MQ=255) gttgcaaaacaaatggagaataattaataacgctctcttttaactccattcttagcctccttcttatgaccttaacaaggCACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAg > 2:272365‑M1/81‑143 (MQ=255) cAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTaaaa > 2:214591/1‑143 (MQ=255) aaGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAag > 2:40820/1‑143 (MQ=255) ttGGTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACCAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGt < 1:412707/143‑1 (MQ=255) ttGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGCTAAAAGAGAGCGt > 2:260650/1‑143 (MQ=255) gCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTattaatt > 1:127323/1‑143 (MQ=255) cccTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGttattacata > 2:111568/1‑139 (MQ=255) cccTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTattaatta < 1:710810/143‑1 (MQ=255) ccagATGCATACCACGTAAACCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAACTTTAATGattat > 2:631381/4‑143 (MQ=255) gcGTAAGCCACGATCTTCCCAAGGGAAGCCGCGGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGttt < 1:686244/142‑1 (MQ=255) cGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTTGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGtttt < 2:667298/143‑1 (MQ=255) cGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGtttt < 2:145280/143‑1 (MQ=255) ctccattcttagcctccttcttatgaccttaacaaggcacccgacataaattcctgtcgggtgCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAAc > 2:272365‑M2/64‑143 (MQ=255) tccattcttagcctccttcttatgaccttaacaaggcacccgacataaattcctgtcgggtgCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACa < 1:272365‑M2/81‑1 (MQ=255) cAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTCTGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTGATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGGTCAAAGAGCGCGCTATTAATTATTCGACATTTGCTTTGCAGCAt > 2:309784/1‑143 (MQ=255) cAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGGTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACAt > 2:341507/1‑143 (MQ=255) gATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCa > 2:55824/1‑143 (MQ=255) ttttCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATa < 2:215543/143‑1 (MQ=255) tttCGCAAGGGAAGATGATGATGACTAAACACCCGATAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATaa < 1:448364/143‑1 (MQ=255) tccttcttatgaccttaacaaggcacccgacataaattcctgtcgggtgCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATAATGAGGt > 1:624158‑M2/50‑143 (MQ=255) acgaggatgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATAATGTGGTAAAGCGGt < 2:118865/138‑1 (MQ=255) atgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTGATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCTCCATCCAAAATGTGGTAAAGCGGTACTCTg > 2:427178/1‑143 (MQ=255) gaCGAAACACCCGACAGGAATTTGTGTGGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATAATGTGGTAAAGCGGTACTCTGtt < 2:640393/143‑1 (MQ=255) gAAATACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATAATGTGGTAAAGCGGTACTCTGTTCtt < 2:429872/143‑1 (MQ=255) GACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATAATGTGGTAAAGCGGTACTCTGTTCTTAGCTAActc > 1:390874‑M1/1‑143 (MQ=255) gAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTACTTCTTCTCCATTTGACACCCAATAGCCAGAATGTGGTAAAGCGGTACTCTGTTCTTAGCTAACTCTAccc > 2:173200/1‑142 (MQ=255) tttATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATAATGTGGTAAAGCGGTACTCTGTTCTTAGCTAACTCTACCATgg > 1:575737/1‑143 (MQ=255) cgggtgCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATAATGTGGTAAAGCGGTACTCTGTTCTTAGCTAACTCTACCATGGCGTTCat < 1:743909‑M2/137‑1 (MQ=255) tgtgCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAATAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATAATGTGGTAAAGCGGTACTCTGTTCTTAGCTAACTCTACCATGGCGTTCatat < 2:345994‑M2/139‑1 (MQ=255) gtgCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATAATGTGGTAAAGCGGTACTCTGTTCTTAGCTAACTCTACCATGGCGTTCAtata > 1:332916‑M2/4‑143 (MQ=255) tgCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATAATGTGGTAAAGCGGTACTCTGTTCTTAGCTAACTCTACCATGGCGTTCATATaa < 2:725212‑M2/141‑1 (MQ=255) | TATTTCATTTTCAGTGGTTATGGTTATGCTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATAATGTGGTAAAGCGGTACTCTGTTCTTAGCTAACTCTACCATGGCGTTCATATAA > NC_000913/1579441‑1579720 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |