| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2042116 = | 42 (0.770) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 7.4% | intergenic (+91/‑252) | zinT/yodB | metal‑binding protein ZinT/putative cytochrome |
| ? | NC_000913 | 2042149 = | 36 (0.710) | intergenic (+124/‑219) | zinT/yodB | metal‑binding protein ZinT/putative cytochrome | |||||
CCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTT > NC_000913/2041975‑2042255 | atttgttatttaaaaaattgatagtgcatattgtaaccagccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaatata > 1:471325‑M1/142‑143 (MQ=255) tatatCTTTTGATTAGTGAATAAGTTGTCGAGGAATTTTTGGTTCTTTGAGTATTCTCATGATATCGCCTCGATGTCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAATCGCCTCTGAACGCAAGCTAGCTAc < 2:11297/142‑1 (MQ=255) ttgttatttaaaaaattgagagtgcatattgtaaccagccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACa > 2:971263‑M1/140‑143 (MQ=255) gttatttaaaaaattgatagtgcatattgtaaccagccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGa < 1:142430‑M1/6‑1 (MQ=255) gttatttaaaaaattgatagtgcatattgtaaccagccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGa < 1:882402‑M1/6‑1 (MQ=255) atCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGa < 1:1008120/143‑1 (MQ=255) tCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGac > 1:791704/1‑143 (MQ=255) aGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGACTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGACACTGAAGGCCAGCTAGGTACAGacac > 2:301407/1‑143 (MQ=255) gTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACg > 1:852249/1‑143 (MQ=255) gCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCATAGAAGCGGCTTTGGTAAGTTATCATAACTACCACTGGTCCCTCCACACACGACATCGAACGCAAGCTAGCTCCAAACACGCTCAGCAc > 2:699477/1‑143 (MQ=255) gaagaaGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTa > 1:955587/1‑143 (MQ=255) gaagaaGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTa < 1:951224/143‑1 (MQ=255) gaagTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGATTATTCTCATGATAACTCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGa < 1:439569/143‑1 (MQ=255) agTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACg < 1:443860/143‑1 (MQ=255) agTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACg < 1:661530/143‑1 (MQ=255) tCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCt < 1:206443/143‑1 (MQ=255) attgtaaccagccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTg > 1:71258‑M1/113‑143 (MQ=255) aGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGta < 2:199312/143‑1 (MQ=255) gAAATGATGGCTGATTGAGTATTCTCAGGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACACGCGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGtata < 1:850878/143‑1 (MQ=255) gtggtctctcCTTGATTATTCTCATGATAACGCCTCGATTCCGCTTTAGTAAGTTATCATAGCTGCCACTGGTCCATCCACAACCGCCACTGGACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATta < 2:674326/137‑1 (MQ=255) gatgTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATAACGAGTCTGTATATtaat > 2:334423/1‑143 (MQ=255) agtcaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggtatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATtaat > 2:798299‑M1/104‑143 (MQ=255) gccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATtaata > 2:584323‑M1/103‑143 (MQ=255) tGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGGATATTAATAAGCTAAccc > 1:344841/1‑143 (MQ=255) gTATGCTCATGATAACGCTCCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCa < 1:272221/143‑1 (MQ=255) ctcATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAg < 2:439070/143‑1 (MQ=255) ctcATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAg < 1:302124/143‑1 (MQ=255) tcATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGt > 1:274036/1‑143 (MQ=255) aCGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAAt > 1:294366/1‑143 (MQ=255) ccTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTCGCTAGAGACACGCTCATCACTATGACGCGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAAc > 1:1007125/1‑143 (MQ=255) cccGATGCCCCTTTAGTACGTTATCATAACTGCCACTGGTCCCTCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACCCGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACg < 2:848799/141‑1 (MQ=255) cGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGACCCCCCACAAACGCCACTGAACGCAATCTAGCTACAGACACGCTCATCCCTAAGACGTGTCTGTAAACAAATAAACTAACCACCAATGAGATCACCAAAAACCGa > 2:699560/1‑143 (MQ=255) aTGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGCGTTAACCAATAACGGAtt > 1:787076/1‑143 (MQ=255) gCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTcc < 2:463545/143‑1 (MQ=255) cggCTGTAGTAAGTTAGCATAACTGCCACTGGTCCATCCCCAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCa < 1:321288/141‑1 (MQ=255) tcTTTGGGAAGTTATCATAACTGCCTCTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATa < 2:409846/142‑1 (MQ=255) aGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACg < 1:573632/143‑1 (MQ=255) aGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACAAATAACGGATTCCATACACAATACg > 1:52970/1‑143 (MQ=255) gTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACgg < 2:47691/143‑1 (MQ=255) tGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGaa < 1:563208/143‑1 (MQ=255) ccACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCACTAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGCGAAAg > 2:395514/1‑143 (MQ=255) cACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGa > 1:494368/1‑143 (MQ=255) atccaCAAACGCCACTGAACGCGAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACACTACGGCCAACAGAGAAAGATACCTCTGc > 2:1041271/1‑143 (MQ=255) atccaCAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGAATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATGCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATAccacagc > 2:65009/1‑138 (MQ=255) cctcaCGCCCCTGAACGCCAGCGAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCAc < 2:11776/139‑1 (MQ=255) acaAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCAc > 1:358470/1‑143 (MQ=255) gaaCACCTCTGAGCGGAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGc < 2:908107/142‑1 (MQ=255) aaaCGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGc < 2:294366/143‑1 (MQ=255) aCTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCt > 1:932644/1‑143 (MQ=255) aaCGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTtata > 1:211099/1‑143 (MQ=255) ctagctaCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAGCCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTgg < 2:791704/143‑1 (MQ=255) agctaCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAAAAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGtt < 2:90888/143‑1 (MQ=255) | CCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTT > NC_000913/2041975‑2042255 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |