New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2042116 = | 42 (0.770) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 7.4% | intergenic (+91/‑252) | zinT/yodB | metal‑binding protein ZinT/putative cytochrome |
? | NC_000913 | 2042149 = | 36 (0.710) | intergenic (+124/‑219) | zinT/yodB | metal‑binding protein ZinT/putative cytochrome |
GAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACAAATTA > NC_000913/2042008‑2042291 | gAAATGATGGCTGATTGAGTATTCTCAGGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACACGCGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGtata < 1:850878/143‑1 (MQ=255) gtggtctctcCTTGATTATTCTCATGATAACGCCTCGATTCCGCTTTAGTAAGTTATCATAGCTGCCACTGGTCCATCCACAACCGCCACTGGACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATta < 2:674326/137‑1 (MQ=255) gatgTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATAACGAGTCTGTATATtaat > 2:334423/1‑143 (MQ=255) agtcaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggtatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATtaat > 2:798299‑M1/104‑143 (MQ=255) gccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATtaata > 2:584323‑M1/103‑143 (MQ=255) tGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGGATATTAATAAGCTAAccc > 1:344841/1‑143 (MQ=255) gTATGCTCATGATAACGCTCCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCa < 1:272221/143‑1 (MQ=255) ctcATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAg < 2:439070/143‑1 (MQ=255) ctcATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAg < 1:302124/143‑1 (MQ=255) tcATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGt > 1:274036/1‑143 (MQ=255) aCGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAAt > 1:294366/1‑143 (MQ=255) ccTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTCGCTAGAGACACGCTCATCACTATGACGCGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAAc > 1:1007125/1‑143 (MQ=255) cccGATGCCCCTTTAGTACGTTATCATAACTGCCACTGGTCCCTCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACCCGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACg < 2:848799/141‑1 (MQ=255) cGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGACCCCCCACAAACGCCACTGAACGCAATCTAGCTACAGACACGCTCATCCCTAAGACGTGTCTGTAAACAAATAAACTAACCACCAATGAGATCACCAAAAACCGa > 2:699560/1‑143 (MQ=255) aTGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGCGTTAACCAATAACGGAtt > 1:787076/1‑143 (MQ=255) gCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTcc < 2:463545/143‑1 (MQ=255) cggCTGTAGTAAGTTAGCATAACTGCCACTGGTCCATCCCCAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCa < 1:321288/141‑1 (MQ=255) tcTTTGGGAAGTTATCATAACTGCCTCTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATa < 2:409846/142‑1 (MQ=255) aGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACg < 1:573632/143‑1 (MQ=255) aGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACAAATAACGGATTCCATACACAATACg > 1:52970/1‑143 (MQ=255) gTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACgg < 2:47691/143‑1 (MQ=255) tGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGaa < 1:563208/143‑1 (MQ=255) ccACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCACTAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGCGAAAg > 2:395514/1‑143 (MQ=255) cACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGa > 1:494368/1‑143 (MQ=255) atccaCAAACGCCACTGAACGCGAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACACTACGGCCAACAGAGAAAGATACCTCTGc > 2:1041271/1‑143 (MQ=255) atccaCAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGAATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATGCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATAccacagc > 2:65009/1‑138 (MQ=255) cctcaCGCCCCTGAACGCCAGCGAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCAc < 2:11776/139‑1 (MQ=255) acaAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCAc > 1:358470/1‑143 (MQ=255) gaaCACCTCTGAGCGGAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGc < 2:908107/142‑1 (MQ=255) aaaCGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGc < 2:294366/143‑1 (MQ=255) aCTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCt > 1:932644/1‑143 (MQ=255) aaCGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTtata > 1:211099/1‑143 (MQ=255) tattaatatacagacacgtcatagtgatgagcgtgtctgtaTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGc > 2:584323‑M2/42‑143 (MQ=255) attaatatacagacacgtcatagtgatgagcgtgtctgtaTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATACCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGACt > 2:798299‑M2/41‑143 (MQ=255) ctagctaCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAGCCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTgg < 2:791704/143‑1 (MQ=255) agctaCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAAAAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGtt < 2:90888/143‑1 (MQ=255) cagacacgtcatagtgatgagcgtgtctgtaTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAat > 1:71258‑M2/32‑143 (MQ=255) CAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAACGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATCGGCTGGTTACAat < 2:885052‑M1/143‑1 (MQ=255) ACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGATTATATTGGCAGGttccaaactg < 2:396439‑M1/143‑5 (MQ=255) ACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCAATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTCCAATATg < 1:680363‑M1/143‑1 (MQ=255) tcatcaCTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACCATATGCCCTAt > 1:541047/1‑143 (MQ=255) tcaCTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGGTCACGCCATTGCTAGTATTAGCTGGTTACAATATGCACAACCaa > 2:822519/1‑143 (MQ=255) tcaCTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATAGCTTAAACAGGGCGGTCACAAAATGCACTACCaa > 2:914632/1‑143 (MQ=255) caCTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAAt < 2:115018/143‑1 (MQ=255) cTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATAc > 1:672369/1‑71 (MQ=255) cTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATAc < 2:672369/71‑1 (MQ=255) tATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAAtttt > 1:361803/1‑143 (MQ=255) tATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAAtttt > 2:13228/1‑143 (MQ=255) tctgtaTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAAc < 1:142430‑M2/137‑1 (MQ=255) tctgtaTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAAc < 1:882402‑M2/137‑1 (MQ=255) tgtaTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTCTCAATTTTTTAAATAACaa > 2:971263‑M2/5‑143 (MQ=255) taTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACAAAt > 1:471325‑M2/3‑143 (MQ=255) tatTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACAAatta < 1:914996/143‑1 (MQ=255) | GAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACAAATTA > NC_000913/2042008‑2042291 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |